立即注册找回密码

QQ登录

只需一步,快速开始

小桔灯网

搜索
小桔灯网 门户 资讯中心 产品杂谈 查看内容

肿瘤NGS试剂盒市场“三足鼎立”丨回顾与初探,谁略胜一筹?

2018-11-8| 编辑: 小桔灯网| 查看: 165| 评论: 0|来源: 基因Talks

摘要: 截至目前,国内肿瘤NGS基因检测试剂盒的市场已呈现“三足鼎立”之势。回顾与初探,谁略胜一筹?先分享几张比对图表让大家先睹为快:没看过瘾?且“听”小编细细道来!回顾初探:基因检测试剂盒未来发展之路在何方201 ...


截至目前,国内肿瘤NGS基因检测试剂盒的市场已呈现“三足鼎立”之势。回顾与初探,谁略胜一筹?

先分享几张比对图表让大家先睹为快:



没看过瘾?

且“听”小编细细道来!


回顾&初探:基因检测试剂盒未来发展之路在何方


2018年7月伊始,肿瘤分子诊断领域利好不断,三家测序公司(燃石,诺禾及世和)的肺癌NGS多基因试剂盒陆续获得国家药监局(NMPA,原CFDA)批准--官宣上市根据申报信息推断,后续还将会有三家公司的NGS试剂盒产品在今年底或明年初获批。除了为行业的发展注入动力,NGS试剂盒获得NMPA认证的意义更在于给基因检测的规范化开了个好头。纵观中国NGS医疗器械注册之路,耐人寻味:

已获批的这三家试剂盒产品的设计思路是怎样的?他们的申报经验是否值得借鉴?后续产品又如何走的更远?


图1 三款已上市NGS多基因试剂盒对比


最低检测限(灵敏度)-申报信心和技术水准的双重考验。根据申报时公开的研究数据,燃石、诺禾及世和获得CFDA批准的最低检测线(LOD)分别为2-10%,5%和1-2.5%。单纯的横向比较中,世和基因NGS试剂盒除了ALK融合是2.5%的最低检出限,其他基因灵敏度都是1%,检测灵敏度较具优势。


图2 三款NGS多基因试剂盒灵敏度对比

诺禾产品的测序深度在2000X时,使用配套软件进行数据分析时,SNV阳性判断值≥0.7%;Indel阳性判断值≥1%;RNA融合序列支持条数为200条


外,基于世和基因的 6512 例非小细胞肺癌患者的临床数据分析(图3数据内容来自于世和基因NGS产品上市发布会,旨在进行学习交流,侵删!,针对EGFR突变,1%-2% 检出限之间分布着约 2% 的阳性的患者;1%-5% 检出限之间分布着7%的EGFR突变阳性患者。换句话说,如果以1%检测线为基准,采用2%的灵敏度进行检测,可能遗漏约 2% 的EGFR阳性患者;而 5% 为检测线,阳性遗漏将达到 7% 。同样的道理,KRAS突变 1%-2% 检出限之间阳性的患者占 3%,1%-5% 检出限之间为 9%; BRAF突变采用 2% 的检出线将会漏检 6% 以上的阳性患者,5% 的检出限则意味着 19% BRAF阳性的患者会被漏检。这些百分数字背后的临床意义还在于,如果一个患者同时携带EGFR和KRAS突变,但因为试剂盒灵敏度的问题如果只检出了EGFR突变,此时选择服用EGFR-TKI类药物,患者的临床疗效将会存在极大的风险和不确定性。

另外,对于ALK这种融合(基因重排)突变形式,10%的检出限相比于2.5%的检出限则意味着高达52%的ALK阳性的患者可能被漏检。这里需要注意的是,灵敏度的比较还应考虑测序平台,测序样本、及原理技术的影响(如RNA-seq检测),具体参数指标应当有所区分。


图3 世和6512例肺癌临床大样本数据灵敏度临床检出率分析


测序设备平台-是战术利器,亦是战略基石。高通量测序技术平台的发展一直方兴未艾,在经历了一系列的收购和合并,国内市场目前主要由三家企业提供,包括:Illumina测序平台、Life Technologies(已被Thermo Fisher收购)测序平台和华大基因测序平台。

燃石与世和基因均选择了 Illumina MiseqDx 测序仪,这一款测序仪于今年 8 月获得了国家药监局的批准。根据Illumina公司在MiseqDx上市会上公布的数据,全球>90%的测序数据产生于Illumina 测序平台,全球>70%装机市场占有率。由此可见,Illumina在整个行业中已处于统治地位,仅次于垄断地位了。



而随着2018年11月2日,Illumina对Pacific Biosciences(PacBio,三代测序)的收购,Illumina平台的市场占有率将会进一步扩大,完整且成熟的产品链条以及丰富的科研成果积累,使其在中国各级医疗院所的营销推广中极具竞争力。因此,对于第三方检测公司来说,Illumina检测平台的选择无疑会让自己在未来的市场竞争中处于更有利的位置。

Panel基因数量-取舍之间有深意精准医疗,检测先行。高通量测序技术(NGS)的出现为多基因并行检测和高灵敏度变异信息挖掘提供了有力的工具。从几个基因的小Panel到四五百个基因的大Panel;从微卫星不稳定性(MSI)、错配修复基因(MMR)的检测再到现在大火大热的肿瘤突变负荷(TMB),针对这些基因及生物标志物如何进行选择将极大的影响试剂盒的申报速度和难度。(国内NGS检测公司目前已提前布局大panel产品的注册申报工作,未来还将推出更多产品

借鉴欧美发达国家基因检测技术的发展经验,我国的相关申报也是从小Panel开始尝试。本批次申请中,燃石、诺禾和世和三者都囊括了目前肺癌研究中较成熟的4个靶点基因:EGFR、KRAS、ALK 和 BRAF。除此之外,诺禾试剂盒还多了2个基因:ROS1 和 PIK3CA;而世和试剂盒中加上了 ROS1 和 HER2 基因的 E20ins 检测。显而易见,诺禾的选择使得靶药下游通路的基因检测更加丰富,利于评估对药物疗效的影响;而世和基因试剂盒也许是更多的考量诸如NCCN指南等有明确肺癌靶向用药的基因力求最全面的临床指导意义


正值国家医疗体制持续改革浪潮中,肿瘤基因检测市场充满机会,更不乏挑战。回首过去风雨十载,基因检测产业从初露端倪便被肿瘤专家认可,到茁壮成长而与靶向治疗、免疫治疗相辅相成,再到NGS多基因试剂盒的认证上市,基因检测不断推进肿瘤诊疗向着更快、更准方向快速发展。

千古风流何为英雄?且看


整个肿瘤基因检测市场还处于市场培育期,接下来的2-3年内,市场会爆发性的增长。资本的助推,CFDA的认证将会改变中国肿瘤基因检测的现状。进而将会产生一系列的效应,如行业洗牌,这势必导至“有证”的活下来,不规范的被淘汰。在这数十亿甚至是百亿级别的市场,避讳群雄逐鹿,最后也将会是个位数的几家公司分别占据不同地区或细分领域并存活下来。


声明:
1、凡本网注明“来源:小桔灯网”的所有作品,均为本网合法拥有版权或有权使用的作品,转载需联系授权。
2、凡本网注明“来源:XXX(非小桔灯网)”的作品,均转载自其它媒体,转载目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责。其版权归原作者所有,如有侵权请联系删除。
3、所有再转载者需自行获得原作者授权并注明来源。

鲜花

握手

雷人

路过

鸡蛋

最新评论

关闭

官方推荐 上一条 /3 下一条

客服中心 搜索 官方QQ群 洽谈合作
返回顶部