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贝勒医学院文曙教授:中美遗传病发展及其未来趋势情况如何?

2019-4-22 23:35| 编辑: 小桔灯网| 查看: 2779| 评论: 0|来源: 联川基因

摘要: 编者按从湘雅学习到贝勒执教,文曙教授践行遗传病诊断20余年,目前主要研究方向为二代测序技术的临床应用和遗传大数据临床分析与报告。在我们和文曙教授沟通过程中发现,文教授虽然身处国外,却时刻心系国内的遗传病 ...

编者按

从湘雅学习到贝勒执教,文曙教授践行遗传病诊断20余年,目前主要研究方向为二代测序技术的临床应用和遗传大数据临床分析与报告。在我们和文曙教授沟通过程中发现,文教授虽然身处国外,却时刻心系国内的遗传病发展,对目前国内的遗传病诊断有着专业的见解及建议。

本次联川基因就国内各企业医院关心的遗传病相关问题,对文教授做了专题采访,讨论中美遗传病发展及其未来趋势。

联川基因:文教授您好,非常感谢您这次能够接受我们的采访,之前我们做了个活动征集大家关心的想向您咨询的有关遗传病问题。其中我们收到的大家关心最多的就是中美在遗传病诊断上存在的异同有哪些,就您的判断,中国这边需要在哪些方面进行努力?

文曙教授:我觉得以下这几个方面国内外目前还有一定差距:


A 变异数据积累

国外因为开始全外测序和其他二代测序时间比较早,其他一代测序等检测经验也比较多,对变异的致病性一开始就有一个积累,目前国内无论公开还是公司内部的变异数据积累一般还是有差距。加上种种原因造成华人正常对照公开数据库很少,所以可能造成这方面国内外有一定差距。但是随着国内的发展,这个差距应该是在迅速缩小的。

B 质控严格程度

国外这类临床实验室的质控管理已经开始了很多年,无论是规章制度的完整性和执行的规范性都更完善。国内开展类似质控管理时间还不长,还需要根据国情进行一些调整。

C 临床医生更了解遗传病

遗传病临床专科在美国大约是1990年左右开始正规化的,比国内早很多,国内目前还没有很正式的遗传病临床专科体系。临床经验的积累,专科的细分,使得美国临床医生总体对遗传病更加了解,有更好的分级诊疗体系,开单更准确,后续临床诊断更准确,治疗更有针对性。这方面国内也在迅速学习和追赶,但一般来说经验的积累和体系的建设还需要一段时间。

D 遗传咨询体系

遗传咨询师在国外也是早就有专门的学习和认证体系,而在国内,目前也还没有这方面的公认体系。但是这方面我知道国内很多老师正在和政府部门积极筹划建设,相信体系建立的时间不会太久了。

E 患者隐私保密工作

欧美国家总体对患者的隐私的保密管理要比国内严格很多,有非常详细的HIPAA制度,而且一旦违反,惩罚非常严重,例如可以立即吊销违纪医生的行医执照。遗传信息有很特殊的隐私性,更好的保密制度对于减少致病变异携带者受到的工作和家庭歧视有非常重要的意义,这方面需要国内的同行形成共识,多做努力。

F 消费级“疾病易感性基因检测“的管理

国内目前很多公司都在进行所谓的“疾病易感基因“的检测项目,并且冠名为“消费级”基因检测,以与“医疗级基因检测”区分开。而实际上,限于目前的科技水平,真正有很明确的科学证据的与疾病易感性相关的基因变异很少,大部分所谓的相关科研论文重复性都非常差,因而在美国这类项目的监管是非常严格的。

以23andMe这样的美国顶级消费级基因检测公司为例,现在也只是提供十来种疾病的风险预测,而且实际上主要是BRCA、SERPINA1、G6PD这类的单基因病的明确致病变异检测,以一些常见的SNP的检测来对多基因病的风险进行预测的情况是非常少的,更不要说我有时候看到国内的易感基因检测报告,就检测了几个常见SNP就对像心血管病,糖尿病之类的风险进行精确到百分位的预测,这是非常不合适的。

我认为只要是自称与疾病风险有关的基因检测,都应该属于医疗服务范围,应该由卫生部门直接监管,并且需要提供详实的科学证据。

联川基因:目前我们看到市场上有许多企业正在用二代测序的方法检测遗传病,过往诊断方法有很大的不同。就二代测序的方法诊断遗传病,您觉得企业或医院需要注意哪些方面?

文曙教授:我觉得首先是要注意二代测序的质控。二代测序是非常复杂,数据量非常大的项目,与其他医学检验项目相比,容易错漏的陷阱多得多。一个简单的质控方法就是数据的公开化,在临床报告上应该充分公布二代测序数据质量的主要指标,并且给医生和患者获取原始数据的渠道,这样间接给提供二代测序服务的企业动力和压力去提供更好的数据质量。

其次是报告的解读。除了在报告中应该给出每个阳性变异位点的评分标准(目前各国都基本以美国医学临床学会的变异评分指南为标准),而且基于目前中国大部分医生遗传病知识比较欠缺,同时平均每个患者的处理时间比较有限的特点,基因检测企业应该尽量在报告中提供相关遗传病的治疗和遗传咨询要点,帮助临床医生更准确高效地服务遗传病患者。

联川基因:测序的不断普及将遗传病的诊断推向了更为明确,更为全面的方向。未来您觉得,就测序来看,全外显子是否会在中国成为一个普及的手段,其中的难点还有什么?

文曙教授:目前看起来,单基因病的发病频率之前是被明显低估了的,而且随着基因检测技术成本的迅速下降,我相信全外测序甚至全基因组测序这样的大型基因检测技术会进一步普及。其中主要的难点可能还是目前的测序成本还是比较高,另外就是临床医生对遗传病的学习还比较有限,这也是一个需要时间的过程。

此外,从基因检测实验室的角度,还需要更加严格地质控,降低成本,并且在尽可能的情况下帮助医生选择最适合做基因检测的患者,并且在检测结果出来后,尽量提供更好的售后服务。在缺乏政府部门的充分监管情况下,要让基因检测企业做到这些,还需要各方一起来努力。

联川基因:联川是临床NGS上游定制化试剂盒的提供商,在遗传病领域的试剂盒使用上,您对我们这类厂家有何期许和要求?

文曙教授:对于遗传病检测的医疗产品,我想用户的需求和其它医疗产品是类似的,主要是下面这些指标:低成本、短周期、少漏诊、售后好特别是售后服务,我感觉是一些类似企业竞争上有优势的一个重要原因。


文曙教授简介

2000年湘雅医学院临床专业毕业,随即进入医学遗传学国家重点实验室攻读基因诊断方向研究生,导师为我国细胞遗传学及临床实验遗传学奠基人夏家辉院士。毕业后进入美国最大的医学中心暨德州医学中心的德州A&M大学生命科学和技术研究所,师从所长Richard Finnell博士,进行常见人类先天畸形的遗传机理研究以及群体遗传学研究。

而后进入遗传学排名全美第一的贝勒医学院进行实验遗传学及临床分子遗传学培训,并于2014年完成培训,获得独立运行诊断实验室资格。工作期间发表SCI文章20余篇,担任多家杂志特邀审稿,并任The Scientific World Journal特邀客座编辑。

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