CNV-seq助力我国产前诊断事业实现弯道超车

在刚刚落幕的“第四届中国母胎医学大会”上，北京协和医院边旭明教授公布了一组数据。

显而易见，中国临床亟需一种高通量、低成本、易操作的产前诊断技术。而依托高通量测序平台的CNV-seq技术，完美契合上述需求。

来自郑州大学第一附属医院的孔祥东教授在会上表示，自2019年开展CNV-seq，2月份的诊断量为300多，3月份达到600多，上量非常快。这充分表明，CNV-seq将在缓解现阶段产前诊断服务供给严重不足方面大显身手！

蕴藏巨大能量的CNV-seq，究竟是怎样一项技术？接下来，小编带您好好了解一下。

CNV-seq是一种基于高通量测序技术的新型染色体疾病检测方法，可对多种类型的样本，如外周血、绒毛、羊水、脐带、流产物等进行检测，一次分析23对染色体非整倍体以及>100 kb的染色体拷贝数变异(CNV)。

图1：CNV-seq技术原理

国内外研究者对CNV-seq技术的临床应用进行了一系列的探讨，充分评估了该项技术的临床适用性与准确性。结果表明，CNV-seq技术可以应用于外周血、流产物、胎儿组织以及产前诊断样本分析^[1-5]。

《美国妇产科学杂志（American Journal of Gynecology and Obstetrics）》于2018年报道了3429例CNV-seq技术的前瞻性临床应用数据，将CNV-seq技术定位于一线产前诊断技术^[6]。

2019年4月10日，《低深度全基因组测序技术在产前诊断中的应用专家共识》（以下简称《共识》）发布，明确指出CNV-seq可以作为一线产前诊断技术^[7]。

图2：CNV-seq临床应用发展历程

凭借强劲的技术优势及贴合临床需求的专业服务，贝瑞基因与全国200多家产前诊断中心达成合作，累积的CNV-seq临床实践样本已达10万余例。

 乘《共识》之东风，CNV-seq势必将在我国更多的产前诊断中心大规模、规范化的开展！

《共识》发布后，CNV-seq临床应用有了统一的标准，医院引进后开展CNV检测会更加得心应手。以文库构建环节为例，《共识》明确指出，采用PCR-free建库流程，无PCR扩增偏好性，检测更精准。

此外，相对PCR建库，PCR-free建库省去了四个步骤（连接产物QC、PCR、PCR纯化和PCR产物QC），流程简便，实验室人员通过培训即可自行开展CNV检测。

图3：文库构建流程对比

在对样本的检测结果进行注释解读时，芯片等检测技术仅能参考常用的公共数据库（DGV、DECIPHER、OMIM、UCSC等），而这些数据库中收录的大多为欧美人的数据信息。

贝瑞基因作为我国基因测序领军企业，凭借多年来在基因测序领域的数据累积，构建了百万中国人基因组大数据库，包含100万健康中国人与10万患者的CNV数据信息。在进行结果注释时，不仅参考公共数据库，还纳入了百万中国人基因组大数据库，降低致病性未知比例，提高CNV-seq注释解读的准确性与可靠性。

现阶段，我国的遗传咨询师极其匮乏。为了缓解临床医生的报告解读压力，贝瑞基因开发了高度自动化的CNV-seq分析软件，内置公共数据库与贝瑞基因百万中国人基因组数据库，不仅可准确检测CNV，还可进一步通过对数据库的搜索查询，自动展示CNV注释信息，并根据ACMG对CNV致病性评判新标准（尚未正式发表），对CNV的致病性自动打分评级。

同时，为了更好的服务临床、服务孕妇，贝瑞基因搭建了国际一流的遗传咨询团队，由美国哈佛医学院沈亦平教授担任首席医学遗传咨询顾问，资深遗传咨询师黄宥芯带队，辅助临床医生在检测前、检测中、检测后为患者提供专业的报告解读和遗传咨询服务。

采用检测全面精准、高通量低成本、好落地的创新技术是产前诊断事业未来发展的方向和趋势。而CNV-seq正是这样一项技术。

多年来，我国多采用“拿来主义”，国外推广什么技术，国内就引进什么技术。芯片虽被引入多年，但受到检测通量、价格等因素限制，并未在国内广泛应用。段涛教授曾经公开坦言：“芯片（CMA）是被中国错过的上一代技术。”

秉承《共识》发表之东风，在产前诊断领域，我国完全可以实现弯道超车。CNV-seq作为一线产前诊断技术，势必将在我国出生缺陷防控事业上增添浓墨重彩的一笔。