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Illumina、Life Tech:在测序仪发展历史上的经典角逐

2017-11-14| 编辑: 小桔灯网| 查看: 125| 评论: 0|来源: 修社

摘要: 一、探秘NGS测序平台发展史高通量测序技术(又称为下一代测序,Next Generation Sequencing,NGS)自2005年454公司推出第一台基于焦磷酸测序二代测序仪开始,到2017年Illumina推出NovaSeqTM系列,高通量测序技术经历 ...


一、探秘NGS测序平台发展史


高通量测序技术(又称为下一代测序,Next Generation Sequencing,NGS)自2005年454公司推出第一台基于焦磷酸测序二代测序仪开始,到2017年Illumina推出NovaSeqTM系列,高通量测序技术经历了十几年的飞速发展。


人类基因组测序成本已经从人类基因组计划的约30亿美元降到了1000美元左右。


在技术发展过程中,NGS测序平台经历了一系列的收购和合并,最终形成主要三家测序平台,包括:Illumina的Solexa平台、Life Technologies的 Ion Torrent平台和华大基因的Complete Genomics平台。


△ 表1. NGS测序平台发展史


二、解析NGS测序平台



 1 


Illumina平台


由于其技术成熟,平台之间高度互补性与交叉性,使得其在短读长测序上大占优势,是目前应用最广泛的NGS平台。目前其占据了测序仪市场约70%的市场份额。



 2 


Life Technologie平台


Life公司Ion Torrent测序平台采用的为半导体测序原理,其在非碱基多聚体(non-homopolymer)的测序上正确率与其它NGS平台相差无几,而对于连续碱基的检测还不够完善,在检测同一碱基连续出现时的数量可能会有所误差。相对于其他平台,测序通量较小,平台数量也较少。



 3 


Complete Genomics平台


Complete Genomics平台采用了高密度DNA纳米芯片技术,在芯片上嵌入DNA纳米球,然后用复合探针-锚定分子连接(cPAL)技术来读取碱基序列。虽然这些技术非常准确,但该技术在应用上最大的限制可能就是其过短的读长。


我们可以用一张表格横向比较一下三大平台,如下:


△ 表2. NGS测序平台对比

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