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研究背景 胃癌（Gastric Cancer, GC）是全球发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一。由于早期胃癌（Early Gastric Cancer, EGC）症状不明显，缺乏侵入性小、方便且有效的方法，导至其早期诊断率较低。然而，早期诊断对于胃癌的治疗至关重要，因为早期胃癌的五年生存率超过90%。传统的胃镜检查虽然是诊断胃癌的有效手段，但由于其侵入性和高昂的费用，限制了其在大规模胃癌筛查中的应用。因此，研究者们一直在寻找非侵入性或微创的早期胃癌检测方法。 研究亮点 研究鉴定出的由13种蛋白组成的panel，在发现队列和验证队列中对于GC和EGC都有较的诊断性能，这些标志物在未来有望助力GC和EGC的临床诊断和新型早筛工具的研发。 研究结果 两个队列被纳入此研究：经过严格的纳入排除标准，最终发现队列一共88例样本（包含34名胃癌I-IV期，和6名癌前病变，以及48名对照组）和验证队列一共50例样本（包含24名胃癌I-IV期，和4名癌前病变，以及22名对照组）被纳入研究。通过Olink Explore 384 Cardiometabolic panel，对血浆样本中的369种蛋白质进行定量。在发现队列中通过LASSO回归模型和Ridge回归模型，筛选出能够区分GC/EGC与对照的蛋白质标志物，并进一步在验证队列中验证其诊断效能，最终得到可靠的GC和EGC的多蛋白分子诊断panel。
为了鉴定GC生物标志物，研究者在发现队列中，利用Olink Explore 384 Cardiometabolic panel，对血浆样本中的369个蛋白进行检测，共367个蛋白纳入后续分析，通过差异分析发现116个在GC组与对照组之间表达水平显著不同的蛋白质（FDR校正p值<0.05）。通过GO和KEGG分析，研究者发现在GC组中上调的蛋白通常富集在炎症和免疫相关的途径上，而下调的蛋白主要富集在蛋白质代谢和代谢途径调控上。为了验证PEA的定量准确性，研究者使用ELISA检测了差异蛋白中显著性最高的GDF15蛋白的表达水平，发现PEA测量的GDF15水平（2^NPX）与ELISA测量的水平之间存在高相关性（发现队列：Pearson’s r = 0.88, 验证队列：Pearson’s r = 0.96）
发现队列中GC患者与对照组血浆蛋白质的变化 为了筛选到EGC标志物，研究者们首先对于EGC的分组进行了定义。尽管之前对GC的部分Olink研究将I-II期作为EGC，但II期患者的5年生存率（>60%）大大低于I期患者（>80%）。与上述两个阶段相比，HGIN患者的5年生存率（>95%）更高，这意味着该阶段的诊断和治疗可能使患者受益更多。同时，由于大多数HGIN表现出与原位癌相似的组织形态学特征，并在4至48个月内发展为侵袭性GC，许多内科医生对HGIN和I期GC患者使用相同的临床治疗原则（如内镜黏膜下剥离术，ESD）。因此，在该研究中，研究者们将HGIN和I期患者作为EGC。通过对发现队列中的367个蛋白进行差异分析，研究者在EGC（HGIN-I）与对照组之间鉴定出27个差异表达的蛋白质。
发现队列中早期GC组与对照组血浆蛋白差异表达的鉴定
GC和早期GC诊断模型构建及验证 研究展望 序祯达生物Olink蛋白质组学平台 2020年，序祯达生物正式引进Olink这一具备高灵敏度、宽动态范围、高通量的蛋白质检测技术，开启蛋白质组学研究之旅。序祯达生物是国内首家可提供Olink Explore HT、Explore、Target、Flex及Focus全套服务的服务商，是国内首家通过Olink Target 48/96、Olink Explore、Olink Explore HT质控标准的一致性验证的服务商，一直以来致力于提供满足国际标准的高质量的检测数据和服务。 序祯达生物介绍 序祯达生物是一家专业提供测序技术服务和多组学研究解决方案的服务型平台企业，总部位于上海自由贸易实验区外高桥保税核心功能区内，中心实验室面积超过3000平方米，拥有大规模的高通量测序平台，提供超过300项符合组学领域专业检测项目。是国内屈指可数的同时获得CLIA、CAP、ISO15189、ISO27001等国际权威认证的测序与组学技术服务商。作为一个致力于提供优质生物技术研究服务的平台，我们支持灵活定制化的开发验证和检测分析服务，为生物医药领域的研究者提供高品质的技术支撑。 在序祯达生物，我们以创新和技术为驱动力，汇聚了一支高度专业、经验丰富的研发团队，致力于提供优质并具竞争力的服务。让测序技术惠及每一个人，以创新多组学技术赋能新药研发！ 联系方式 官网：www.sequanta.com 邮箱：info@sequanta.com 电话：021-20500599 |
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