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使用手机供电的一体化CRISPR核酸检测微流控平台

2026-6-29 10:30| 发布者: 沙糖桔| 查看: 140| 评论: 0|来源: 小桔灯网|作者:动力彩虹

摘要: 这篇Microsystems & Nanoengineering文章提出了一种手机供电的去中心化CRISPR核酸检测微流控平台。
据报道,全球有47%的人口无法获得基本的诊断服务,如果将这一差距缩小至10%,每年可避免约110万死亡案例,尤其在农村和低收入等资源有限地区。核酸检测正在从中心实验室走向现场化、便携化和低资源场景。COVID-19疫情让人们充分认识到,传统RT-qPCR虽然准确,但依赖集中实验室、昂贵仪器和训练有素的操作人员,样本采集到结果报告往往需要较长时间。对于基层医疗、社区监测、偏远地区、公共卫生应急和家庭检测而言,真正有价值的核酸检测系统,不仅要灵敏、特异,还要低功耗、低成本、易操作、可便携,并尽可能减少外部设备依赖。


近日,美国明尼苏达大学在杂志Microsystems & Nanoengineering上发表了一篇题为 “A smartphone-powered decentralized microfluidic platform for sensitive CRISPR-based nucleic acid detection”的文章。作者提出了一种手机供电的去中心化微流控核酸检测平台。该平台集成了LIG加热器、LAMP等温扩增、CRISPR/Cas9分子识别、侧向层析试纸条(LFA)和电化学检测模块。作者以SARS-CoV-2为模型靶标,证明该平台可在低功耗条件下完成片上LAMP扩增,并通过Cas9介导快速LFA定性读出或基于RuHex电化学探针的定量读出实现核酸检测。


图片来源:Microsystems & Nanoengineering



主要内容



#1


集成传感平台的原理与系统设计  

在本核酸检测系统中,Cas9为核心分子识别元件,可通过LFA或电化学分析进行双模式核酸检测。LAMP扩增与电化学检测模块集成于同一装置中,简化了工作流程,并提升了诊断平台的便携性(图a)。


通过sgRNA实现可编程的DNA结合,激活Cas9核酸酶(图b),并可通过LFA检测生成条带(图b)。在电化学高灵敏度定量分析中,将Cas9:sgRNA复合物固定在电极表面作为分子识别单元,RuHex作为电活性的探针,通过差分脉冲伏安法(DPV)监测电流变化,评估探针结合的变化,从而将Cas9与特定核酸靶标之间的分子识别事件定量转化为电信号。


整个平台由电子控制模块和微流控子系统组成(图c),整合含便携恒电位仪、温控模块的电子控制单元与集成LIG加热器、电化学传感器的微流控芯片,搭建出仅靠手机供电、带3D打印外壳的一体化便携核酸检测平台。


集成传感平台的原理与系统设计。 图片来源:Microsystems & Nanoengineering



#2


LFA检测性能

作者优化了Cas9-LFA反应条件。使用热循环仪时,LAMP和Cas9孵育20分钟即可产生可见LFA测试线。LIG片上LAMP低功耗加热也能支持后续Cas9-LFA检测。LFA检测本身需要足够多的扩增产物才能产生可见条带。作者通过不同PCR循环数和定量DNA稀释实验估算,LFA读出所需的目标DNA量大约为1×10¹¹ copies/20 μL(5×10⁹ copies/μL)。结果说明了只要扩增产物量足够,LFA可以提供简单直观的结果。因此,LFA更适合作为强阳性的现场定性读出,但不适合低丰度或弱阳性定量判断。


作者还将该体系用于真实世界污水样本中的SARS-CoV-2检测。作者用柱纯化获得的污水总核酸进行RT-LAMP,再进行Cas9-LFA检测。污水核酸经过60分钟RT-LAMP后,在Cas9孵育40分钟以上时可出现目标条带。作者使用的sgRNA跨越SARS-CoV-2 Omicron相关S基因H69/V70缺失区域,因此能够识别Omicron相关序列背景。结果显示,污水中SARS-CoV-2拷贝数变化与住院人数和ICU入院趋势具有一定的相关性(如下图b)。


基于Cas9的废水样本LFA检测。图片来源:Microsystems & Nanoengineering



#3


电化学的定量检测,比LFA灵敏约1000倍

作者又开发了更灵敏的Cas9电化学检测模块。将Cas9:sgRNA复合物固定在电极表面作为分子识别单元,RuHex作为电活性的探针,通过差分脉冲伏安法(DPV)监测电流变化,评估探针结合的变化。作者最终采用Cas9 200 ng/μL、DNA孵育10分钟、RuHex 50 μM、孵育5分钟。EIS结果显示,随着DNA浓度增加,电荷转移电阻逐渐升高,检测限为5×10⁶ copies/μL(下图f)。


电化学的单碱基分辨能力也优于LFA。实验结果显示,LFA和电化学平台在sgRNA与目标完全匹配时均产生更强信号,单碱基错配时信号明显减弱。但电化学检测在匹配和错配之间给出的信号差异更清楚,因此对单核苷酸分辨更有优势。


基于Cas9的电化学传感平台特性分析。图片来源:Microsystems & Nanoengineering



#4


一体化微流控系统

最终集成的微流控系统芯片包含两个串联腔室。前端是LAMP加热腔,背面有LIG加热器用于精确控温,后端是电化学检测腔,内嵌Cas9传感电极。流体转移由三个手动PDMS微泵控制,依次完成扩增产物转移、RuHex加入和DPV缓冲液冲洗测量。所有组件均封装在3D打印的外壳中,确保了紧凑的组装和协调的运行。


作者用低至5 copies/10 μL 的DNA溶液验证微流控平台。结果显示,LAMP扩增10分钟后出现弱电化学信号,20分钟后信号清晰,30分钟达到较强峰值(下图e和f)。也就是说,系统在30分钟检测窗口内可检出极低拷贝靶标。


集成的一体化微流控系统。图片来源:Microsystems & Nanoengineering




总结与讨论


这篇Microsystems & Nanoengineering文章提出了一种手机供电的去中心化CRISPR核酸检测微流控平台。它用LIG加热器实现低功耗、精确片上LAMP扩增;用Cas9-sgRNA实现靶序列特异识别。用LFA提供快速可视化定性读出,用RuHex电化学模块提供更高灵敏度和定量读出。系统最终能够在约30分钟内检出低至 5 copies/10 μL 的目标DNA,LIG加热器稳态功耗约130 mW,整个平台可依靠智能手机供电。


不过,这个平台当前也有明显短板。平台主要聚焦核酸扩增和检测,上游样本采集、裂解和核酸提取仍然在芯片外完成。其次,LFA读出所需扩增产物量很高,对弱阳性和低效扩增样本不够友好。Cas9单碱基分辨能力受sgRNA和局部序列影响,未来用于变异检测或耐药检测还需要更系统验证。手动微泵操作虽然简单,但距离全自动闭管检测仍有距离。总之,这篇文章证明了LAMP等温扩增、Cas9特异识别和电化学读出可以被整合进一个手机供电的微流控平台,有望用于基层和资源有限地区分子诊断。


注:本文内容仅供行业动态参考,不构成任何投资建议或临床医疗决策依据。

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