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中通量纳米孔基因测序仪之后,普译生物下一步怎么走?

2024-5-17 10:27| 编辑: 归去来兮| 查看: 850| 评论: 0|来源: 小桔灯网 | 作者:灯哥

摘要: 16通道开路,应运而生

2023年不光是IVD企业的极寒之年,对其上游所在整个生命科学领域亦如此。

然而作为万亿产业的基石,基因测序仪却一直保持热度,并延续到2024年,前不久,北京普译生物发布了首款中通量纳米孔基因测序仪PolyseqOne以及配套芯片和试剂盒,迎来较大关注,该测序系统长读长测序应用提供了新的解决方案。

来源:官网

我国基因测序仪行业整体起步较晚,国内测序仪市场曾一度被海外企业垄断,从国际关系变化及生命科学研究发展的需要来看,发展过程测序仪是必然选项。以华大智造为旗帜的中国基因测序仪市场,过去几年的引进和自主研发,在短读长测序方面,有了极大的缓解;然而单靠一家华大智造必然不够,行业需要真迈、齐碳等越来越多后起之秀们,在各自擅长领域发挥特色;从技术分类看,较能代表未来的长读长测序方面,还欠缺能手,普译生物此番在长读长测序的突破,也算是宣告了问题解决时机。

作为第四代测序技术,纳米孔测序技术在读长、便捷性等有巨大优势,被用于PolyseqOne则很好的突破对了长读长的困境,实现对行业发展的贡献。纳米孔测序的核心是满足条件的纳米孔道,自90年代提出纳米孔测序技术之后,寻找合适的纳米孔道成为重要目标,普译生物结合创始人的研究背景,完成生物膜蛋白形成的生物纳米孔的核心技术,构建了高技术壁垒。在错失CsgG蛋白之后,创始人选择新型纳米孔蛋白,仍然取得卓越成绩,不得不说这样原始技术、底层技术的韧性,也注定了普译生物的潜力。

16通道开路,应运而生

在创始人相继完成新型蛋白验证、国家重点研发计划之后,16通道纳米孔测序样机也随之问世,最终助推了2021年普译生物的成立,可谓是水到渠成。

论文、技术、规模生产转化验证,普译生物的发展有迹可循,稳扎稳打,一步一步向前发展,得益于此,其在充分发掘市场痛点后,能够根据技术底蕴开发相应的产品出来。例如主流的二代测序仪产品体积较大,移动、操作不便;需专业人员分析,使得较难下沉到各级医疗机构和科研实验室。并且通过专业测序服务公司中间一层,使得测序的时间和人力成本在无形中增加,也给各方均带来的困惑。而基于纳米孔测序技术则可较好地解决这些:

既然掌握纳米孔测序技术,有着极佳的优点可以改变现状,那么普译生物也在无形中增加了社会责任感。其纳米孔测序仪研制工作遂此展开,从便捷、无需专业人员、可触及终端用户等多种特点入手,大有普惠大众的意味,同时触及终端能带来丰富的数据,在当前的大数据、AI兴起,无疑将形成正向循环,纳米孔测序产品将多彩多样。

在读长方面,用一些数据量化来看,二代测序仪一般都是数百个碱基,而纳米孔测序仪已经实现了从几百到百万级碱基的读长。可以轻易解决重复序列拼接困难的问题,极大降低了数据分析的难度,可能会解决NGS测序在表观遗传学修饰、RNA直接测序以及蛋白质组学等方面存在的缺陷。

单次准确率超97%,PolyseqOne刷新认知

此次发布的PolyseqOne是一款中通量测序仪,具有集成度高,噪声低、通量高等特点;在数据生产上,PolyseqCell单颗芯片有2560个测序单元,最高可获得15-20Gb的高质量数据,可满足多种测序需求;在基因组测序方面,PolyseqOne单次准确率超过97%,一致性准确率(30x)超过99.9%,刷信了业内的认知

来源:官网  PolyseqOne测序仪及与之匹配的PolyseqCell测序芯片

能做到单次97%则主要基于纳米孔蛋白和控速蛋白两种核心蛋白的优化,也就是上文所提及的普译生物的底层技术。在控速蛋白方面,通过突变和测序条件的改变,M系列控速蛋白可以实现150 nt/s到450 nt/s的测序速度选择

以研究成果展示来看,二代测序由于读长较短,难以完成整个基因组(人肺泡灌洗液的呼吸道合胞病毒的感染情况)的全覆盖,而PolyseqOne读长较长,无需扩增即可确认病毒的存在并能准确判断病毒的亚型,显示出了巨大的优势。

芯片、软件、仪器本身、蛋白等多个维度的有效融合,促成了PolyseqOne,其刷新了准确度和速度的新水平,不仅标志着中国也能够在测序仪领域走在国际前列,发挥了后发优势,也将在多个领域内,为人民健康带来实际贡献。

写在文末

鉴于优异的成果展示,我们可以看到PolyseqOne在人类基因组测序、动物基因组测序、植物基因组测序、临床罕见病诊断、肿瘤学应用、等领域内巨大的应用空间,加之其便捷可移动、快速测序等特点,使得应用场景进一步扩宽。

普译生物作为一支新兴力量,在成立不到3年时间里,就推出具有革命性产品出来,除了归功资本助力和前身十几年的积累之外,也说明了当前市场发展的提速,纳米孔测序技术的发展和成熟均会对上游生命科学领域有着引领性的影响,也符合当前推动高质量发展的时代呼唤,对中下游的应用方来说自然也是一种庆幸。


参考资料:

1.普译生物的官网、相关资讯

2.引领基因测序进入新纪元 | 普译生物发布纳米孔测序仪PolyseqOne,测序中国,2024

3.单次准确率超97%!普译生物发布中通量纳米孔基因测序仪,实现高精准长读长测序,2024

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