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熊说肿瘤 | ctDNA MRD 产品性能之争,请继续下去

2023-12-15 17:40| 编辑: 归去来兮| 查看: 1283| 评论: 0|来源: 熊言熊语 | 作者:kaopubear

摘要: 关键是如果卷性能,究竟应该怎么比?

导语里面有个错误,大家发现了吧。不是超高灵敏度卷不起,而是万分之二更有性价比?

关键是如果卷性能,究竟应该怎么比?

MRD 的性能为何重要


最近推送的不少内容都和 ctDNA MRD 相关,比如 
于是有小伙伴在通读之后来询问我的观点是不是:MRD这个东西,性能够用就可以了,关键在于落地的难度和价格。

这话,我以为对了一半。

落地的难度和面向患者的价格确实很关键,但是「性能够用」这事儿远远没那么简单。

对于MRD这种未来必然会影响患者治疗方案的检测,永远是越灵敏越好。 但凡有人说「够用就行」,都应该想想背后是不是有小心思。
在确保检测技术特异性的基础上,提高灵敏度,一直是MRD需要努力攻克的难点。
MRD 在科学研究的定义里是 minimal residual disease。但,在各家检测公司的认知里,MRD 私下应该翻译为 "Must Regularly Do"。
预后价值只是 MRD 临床应用很小的一部分,远不能满足市场期待和对得起各家投入。它更多的想象空间在于能够帮助医生进行辅助决策。
癌症患者术后1周采血,随后每3到6个月进行动态监控。MRD只有变成癌症患者的定期体检,才是这类产品未来真正的高频场景。
因此,终极目标是指导患者升阶降阶治疗的产品,性能越强悍越好。
问题的关键,在于如何证明性能真的很重要。



MRD 卷性能,要怎么卷


最简单的方法,就是在你的规则里,用你的方法,你的数据,打败你。
性能重要,但谁想把性能作为产品最大的亮点,很难。一个产品如果选择了性能,大概率就要在这条路上一去不回,最怕扭扭捏捏。
关于性能怎么比,前一段时间结束的 ESMO 2023 大会上,Personalis MRD 产品 NeXT Personal 做了一个示范,接下来我们就详细看看。
对于一个检测产品,要比的无非是实际检测性能和临床表现性能。
2023 ESMO LBA55 的研究内容是 Personalis 家的MRD产品 NeXT Personal 依托 TRACERx 研究的再探索,也可以说算是一次针对 TRACERx 研究先前 MRD 检测产品的「头对头PK」。

在之前的推送中,我们提到过 NeXT Personal 主打的优势之一就是极高的灵敏度和特异性,换句话说就是可以检出那些突变频率极低的位点。
为什么需要这样呢?他们一上来先介绍了真实情况下肺癌检出有多难。
用肺癌不同结节大小作为估计,可以看到对于一个在T1b期,nodule diameter 为1.2 cm的肺癌患者来说,对应ctDNA MAF 仅为0.008%(0.002-0.03%),嗯,十万分之八,最低十万分之二。

这里多说一句,目前国内专家共识中要求肺癌MRD是可以稳定检出万分之二的ctDNA。
如此这般,在临床应用过程中,有多少临床表现和MRD本身检测灵敏度的缺失有关?
为了回答这个问题,Personalis 直接丢出了 TRACERx 在 2017 年和 2023 年两篇 Nature 中使用的MRD产品性能数据。
虽然没写名字,但是看到下图的监控位点,懂得都懂?
2017 发表的这项研究,16个突变,用的是 Natera 的 Signatera , 而2023年的50个突变,一看便知是燃石的PROPHET,额,开个玩笑,用的是Inivata RadaR(现在归属NeoGenomics)。

在LOD95的情况下,前者可以检测出万分之一的VAF,后者则可检出十万分之八的VAF。Personalis 的性能可以变态到什么程度呢?
通过追踪大约 1800 个突变,在LOD95的情况下,可以做到检出VAF为百万分之四。
模拟投入 1ng DNA 的情况下,检出下限可以探到十万分之一。通过模拟测试,specificity 直接干到了99.98%……

这种数量级差别的性能提升,又会给分析结果带来什么变化?
于是,他们挑选了TRACERx IA到IIIA期肺癌患者,分析术前血。

可以看出,NeXT Personal 的 ctDNA 检测率明显更高,尤其是在腺癌患者中。
之前的两种检测方法对非腺癌中 ctDNA 的检测率相对较高,均为 92%。NeXT Personal ctDNA 检出率为100%。
而腺癌中的差异更为显著,Personalis的ctDNA总检出率为81%,Inivata和Natera检测方法的检出率分别为42%和19%。
当研究人员将患者按分期划分,NeXT Personal 在 52% 的 I 期、88% 的 II 期和 100% 的 III 期中检测到了癌症信号。

有了这样的检测优势,再去根据ctDNA的状态进行分组生存分析,就是要看临床性能。
这些手术前ctDNA阴性患者的五年总生存率为100%,无复发生存率为94%。相比之下,手术前ctDNA阳性的患者五年内癌症复发的风险很高。


值得注意的是,这些高风险患者使用其他 MRD 检测方法不会被称为 ctDNA 阳性。同样分类标准的生存曲线,在之前的文章数据中是这样子。

即便在非腺癌中,根据ctDNA的进行区分,也可以做出接近显著的OS结果。

虾仁最怕猪心,更狠的来了。
Personalis 决定把2023年 Inivata 检测过的 ctDNA 小于十万分之八的样本重新拿过来,按照自己检测的「真阴性」和「阳性」再进行一次分析。
结果如下图,自己的真阴性样本在生存曲线中是天花板直线,而先前实际是MRD阳性的患者,则在5年的RFS和OS中掉得非常明显。

这个结果说明了什么?
如果你无法检测到这些病人的分子残留病灶,如果他们被错误分组和定性,就有极大可能在未来改变医生对他们的看法和可能采取的治疗方式。
以上还都是在术前基线分析,如果考虑到后续随访监控又会如何?
TRACERx 与 Personalis 正在进行一项合作,研究人员在跟踪大约450名患者中每名患者的350个特异突变,进而评估 NeXT Personal 在手术后和监测过程中是否也会产生类似的临床影响。



用正确的方法证明自己正确


回到开头我们说的,对于终极目标是指导患者升阶降阶治疗的产品,会影响患者治疗方案的检测技术,性能永远越灵敏越好。

只不过,如果真想突出性能,就应该像 Personalis 尽可能选一个合适的比较方案和对象。

道理不难懂。

想证明一个高中生成绩优秀,就不能去和小学/初中时候的自己比。退一步,如果一定要和初中生比,也要想尽办法找到初中学习最好的那个。

不然,即便大家做的是同一套高考模拟题,也会有人说这个比较没意义。

放到 MRD 产品策略,基本公认检测性能最好的个性化位点监控,卷性能,还要和固定化 panel 比,就要想尽办法用最拿得出手的 panel 产品。

还想让更多人服气,铁了心也要和市面上其它个性化监控策略产品比。

在同一个标准下,你能测万分之一,我能测十万分之一,这就是性能优势。我测出来的阴性是真阴性,患者五年生存100%,这就是性能优势转化为临床优势。

再进一步,我把你检测限以下的阴性样本拿回来,还能分出真阴性和之前的漏检阳性,同时它们各自的临床表现依旧是天花板和楼梯线的区别,这是真大腿。

写到这里,熟悉MRD研究的小伙伴应该看出来了莫非我在阴阳怪气

哎?难道你说的是?

是,也不是。

一方面这确实是为什么我之前一直没有解读这篇文献的原因之一。但说说简单,在国内目前实际的环境下,即便燃石想这么做,也许各种因素混杂在一起也很难执行下去。

这种比法他们不是没做过,也不是没赢过。2022 年 FDA 牵头的检测性能比较就是如此。

只不过今年 Cancer Cell 的 MEDAL 研究出来,即便着实回答了不少MRD现阶段的真实问题,碰到较真的医生还是会少一点底气。

以及,当专家共识的及格线是万分之二,做到十万分之二就够了么?

至少现在看 TRACERx 的数据,还不够,做到百万分之几以及 1ng 投入量情况的十万分之几仍然有意义。

话还得说回来,十万分之二不够,如果还有谁继续宣称检出是稳定在万分之二的,尴尬。

共识是特殊阶段的产物,只要阴性结果在五年生存分析中还不是天花板,性能之争就可以继续。



写在最后

以及,对于癌症患者来说。影像学看不见不代表健康,如今分子残留病灶检不出也不代表绝对的健康。

各家产品吵来吵去的时候,也许癌症患者已经进入了薛定谔的猫的状态。即便做了手术,等待着他们的永远是下一次 MRD 结果,这样真的是最好的么。

最后,希望看重性能的产品请继续坚持下去,不要妥协道:不是超高灵敏度卷不起,而是万分之二更有性价比。


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