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捕获XBB等多个毒株!华大智造支撑广州市八医院新冠变异监测

2023-1-16 09:36| 编辑: 归去来兮| 查看: 912| 评论: 0|来源: 小桔灯网

摘要: 而MGI MetargetCOVID软件支持批量样本的快速分析,可实现新冠病毒的准确分型。




2023年1月8日起,我国对新型冠状病毒感染实施“乙类乙管”。新冠疫情防控进入新阶段,国家疾控部门进一步完善新冠病毒变异监测的工作方案,在本土病例监测方面,每个省选择了部分的城市和医院作为监测哨点,对门诊病例、重症和死亡病例开展一定数量的新冠病毒感染病例的采样和序列测定。



近日,广州医科大学附属市八医院(以下简称广州市八医院)作为”入境患者定点收治医院“,一直动态监测新冠病毒变异的趋势,基于华大智造的MGISEQ-2000基因测序仪、ATOPlex RNA多重PCR建库试剂盒套装V3.1以及MetargetCOVID软件,在收治的境外输入新冠病毒感染者中检测出了BQ.1.25、XBB.1、XBB.2等奥密克戎亚型变异毒株。

测序报告显示测出BQ.1.25、XBB.1 、XBB.2变异毒株


华大智造MGISEQ-2000是一款灵活高效的测序平台,搭配2种通量的载片:大载片(FCL)和小载片(FCS),可独立上机,单次运行数据产量可从55Gb到1,440Gb。ATOPlex RNA多重PCR建库试剂盒套装V3.1(简称ATOPlexV3.1)采用328对混合引物(平均扩增178bp)来捕获新冠病毒全基因组序列信息,对于低浓度、易降解的样本友好、具有极高的灵敏度。而MGI MetargetCOVID软件支持批量样本的快速分析,可实现新冠病毒的准确分型。

基于华大智造MGISEQ-2000、ATOPlexV3.1及MetargetCOVID软件的测序组合,广州市八医院单次完成96*个新冠样本的测序工作,得到病毒序列全长覆盖率达到99%以上,测序效率高,测序结果质量优异。

广州市八医院工作人员在华大智造MGISEQ-2000上操作新冠样本测序


早在2021年5月,华大智造启动为广州市八医院提供新冠病毒测序工具。2021年5月21日至2021年6月18日,广州市八医院共确诊159例新冠Delta毒株病例,广州市八医院联合广州医科大学附属第一医院等单位采用华大智造的ATOPlex技术平台和MGISEQ-2000测序仪的测序组合产品成功实现对新冠Delta病毒全基因组的测序、比对、分型和溯源。

广州市八医院工作人员使用MGI MetargetCOVID软件进行样本毒株分型


广州医科大学附属市八医院传染病研究所主任李锋表示:“在监测哨点开展新冠病毒全基因组测序,能够及时动态掌握人群感染发病水平和变化趋势,科学研判和预测疫情规模、强度和流行时间,动态分析病毒株变异情况。华大智造提供的国产高通量测序工具组合准确、高效、操作简便,为新冠病毒变异监测提供了强大的技术支撑。”

近年来,高通量测序技术在病原的监测和溯源以及公共卫生事件的应对中发挥着极其重要的作用。华大智造始终致力于成为“生命科技核心工具缔造者”,针对医疗机构、公共卫生机构开展新型冠状病毒感染疫情监测的需求,持续提供实时、全景、全生命周期的测序产品组合,助力病毒变异监测,赋能传染病防控的“医防结合”。

*MGISEQ-2000基因测序仪单次运行可实现384-3072个新冠样品的测序。

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