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基于磁力富集技术的血浆细菌污染检测

2022-7-6 09:33| 编辑: 归去来兮| 查看: 943| 评论: 0|来源: 小桔灯网 | 作者:动力彩虹

摘要: 血液制品的细菌污染是输血医学中的一个主要问题。


血液制品的细菌污染是输血医学中的一个主要问题。尤其是,输注受污染的血小板(PLT)可能会导至严重的感染和败血症反应。PLT在室温(持续搅拌)下储存5天;因此,细菌可以很容易地从低水平(<1 CFU/毫升)繁殖到高滴度(<10 8 CFU/毫升)。美国食品和药物管理局(FDA)报告称,从2001年到2016年,输血受污染的血小板导至51人死亡。欧盟委员会报告称,2010年至2013年,欧盟有43例输血受到污染;36个涉及PLT污染。虽然只有少数病例,但发病率和死亡率都很高。


为了降低死亡率,需要准确、快速的细菌检测。检测的金标准是血液培养,这是最古老的临床技术之一。然而,细菌生长到可检测的水平通常需要24小时到几天。此外,当使用自动血培养系统时,低细菌滴度和缓慢的细菌生长可能导至假阴性结果。因此,人们致力于快速、灵敏地检测血液中的细菌病原体。强化细菌检测(eBDS)系统通过测量24小时内氧气浓度的下降间接检测细菌,但无法检测厌氧细菌。血小板泛属检测(Pan-Genera Detection)是一种侧向免疫分析方法,在30分钟内分别检测需氧和厌氧革兰氏阳性和阴性细菌中的脂磷壁酸(LTA)和脂多糖(LPS),然而,灵敏度较低(约10^4 CFU/mL),假阳性率较高。


通过聚合酶链反应(PCR)进行核酸(NA)扩增,可灵敏、特异地检测细菌病原体。然而,在PLT生产当天,PCR敏感性不高,因为细菌载量非常低。。此外,PLT含有许多干扰核酸扩增的物质(如免疫球蛋白G)。因此,富集细菌并制备纯化的细菌DNA对于准确、快速检测至关重要。抗体结合磁性纳米粒(Ab-MNBs)的免疫磁性分离(IMS)被广泛应用于分离病原体,从而消除抑制性物质。然而,Ab-MNBs并不能检测出所有引起败血症的细菌;该抗体对1种细菌有特异性,但至少有10种细菌会引起败血症。因此,MNB必须与结合广谱细菌的材料结合。


近日,来自韩国的研究团队在杂志Scientific reports上发表了一篇题为“Molecular detection of bacterial contamination in plasma using magnetic-based enrichment”的文章,在文章中,研究团队开发了一种方法,实时聚合酶链反应(PCR)来检测使用抗生素结合的磁性纳米珠(MNB)富集的革兰氏阳性和阴性细菌。MNB涂有聚乙二醇(PEG),以防止血液成分聚集。超过80%的细菌被MNB捕获,革兰氏阳性和阴性细菌的检测水平分别为10 CFU/mL和100 CFU/mL。这种方法仅需使用少量血液成分,检测时间<3小时。因此,与传统方法相比,使用MNB的实时PCR允许仅使用少量血液成分进行高灵敏度的快速检测。


图片来源:Scientific reports


主要内容


抗生素结合MNB的特性

带有PEG涂层的抗生素结合MNB的合成如图a和b所示。首先,合成平均直径为150 nm的Fe3O4纳米珠,用PEG涂层,并与vancomycin或allantoin连接,以得到MNBs@PEG-Van和MNBs@PEG-Al。(图c)MNB具有典型的核壳结构,即直径150 nm的Fe3O4核和5.5 nm厚的PEG涂层。


材料与MNB(磁性纳米珠)的结合。

图片来源:Scientific reports



MNB富集细菌的效率。

如图a所示MNBs@PEG-Al对在磷酸盐缓冲液(PBS)和单采血浆中添加的大肠杆菌捕获效率分别为90%和80.1%。MNBs@PEG-Van对PBS和单采血浆中金黄色葡萄球菌的捕获效率分别为92.3%和82.1%(图b)。


MNBs富集大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的效率。

图片来源:Scientific reports



用于检测富集大肠杆菌的real-time PCR。

从富集的革兰氏阴性菌和阳性菌中提取DNA并进行实时PCR。如图a所示,在样本培养12小时后检测到102 CFU/mL的大肠杆菌,而图b所示,未被MNB捕获的大肠杆菌仅在10 4 CFU/mL下检测到。如图c所示,在未事先进行样本培养的情况下检测到103 CFU/mL的大肠杆菌,但从101到102 CFU/mL提取的DNA无法扩增。图d显示,当比较含大肠杆菌的单采血浆在104 CFU/mL水平下被MNB捕获(Ct;30.54±0.48)和未捕获(Ct;31.95±0.95)时,Ct值的差异约为1.4,而MNBs@PEG-Al在10 3 CFU/mL的水平下有效捕获了细菌。


大肠杆菌实时PCR检测结果。

图片来源:Scientific reports



用于检测富集金黄色葡萄球菌的real-time PCR。

如图a所示,在样本培养12小时后,检测到101 CFU/mL的金黄色葡萄球菌。图b显示,未被MNB捕获的金黄色葡萄球菌仅在10 4 CFU/mL时被检测到。在未事先进行样本培养的情况下检测到102 CFU/mL的金黄色葡萄球菌,但无法检测到从101 CFU/mL中提取的DNA(图c)。图d显示MNBs@PEG-Van在104 CFU/mL的水平上有效捕获了细菌。


金黄色葡萄球菌实时PCR检测结果。

图片来源:Scientific reports



总结与讨论

当PLT在RT下搅拌储存5天时,即使初始悬浮液中的CFU含量<1 CFU/mL,细菌也会增殖。目前的培养方法培养需要1-5天,数据只有在PLT出库后才可用。其次,需氧和厌氧细菌的培养都需要大量血液(>20毫升)。分子诊断需要小样本量(<1 mL)并在3小时内检测病原体。通过提高细菌富集度来缩短培养时间至关重要。MNB的这种富集需要它们在血液成分中分散,并且vancomycin和allantoin等受体与细菌病原体结合。血浆含有许多蛋白质、凝血因子和IgG;这些很容易吸附到未经PEG涂覆的MNB上。孵育20分钟后,MNB在血浆中聚集,但MNBs@PEG没有聚集。PEG阻止了MNB表面的非特异性结合。将MNB(4×10 9至4×10 12粒/毫升)添加到1毫升含有细菌病原体的单采血浆中。MNB与结合广泛细菌种类的受体结合。vancomycin与革兰氏阳性细菌的肽聚糖层的-Lys-D-Ala-D-Ala结合,同样也与vancomycin耐药细菌结合。革兰氏阴性菌外膜的LPS结构因细菌种类而异,但已知allantoin可以与大多数LPS结构结合,而与菌株无关。


根据当前的FDA指南,检测PLT细菌污染的标准方案基本上包括培养12小时。即使PLT细菌污染的病例较低,但这对于公共健康血液成分的安全验证至关重要。在提取核酸之前,通过MNB富集病原体可降低可能的抑制剂水平,因此,检测时间大大缩短(<15小时)。培养12小时后,大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的富集率均大于80%,检测到的浓度分别为101和102 CFU/mL。未经培养的检测水平分别为10 2和103 CFU/mL。因此,在样本培养12小时后,此方法的灵敏度至少是侧向层析分析试剂盒的100倍,例如血小板PGD试验(检测限=10 4–5 CFU/mL)。此外,这种方法只需要小样本量(<1 mL)来监测细菌污染。这也意味着无需考虑MNB对PLT的不利影响,因为未用于测试的剩余PLT将被输血。现在的目标是进一步提高灵敏度,并设计一个全自动的高通量系统,以方便临床应用。


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