因美纳的“mNGS助力精准病原微生物诊断病例系列”准时与您见面,本期,我们将为您带来非结核分枝杆菌相关病例。 分枝杆菌菌种数量目前已经发现超过170种,大多数具有引起人类感染的致病性。非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria, NTM),也称非典型分枝杆菌,是指除结核分枝杆菌复合群(MTC)和麻风分枝杆菌以外的分枝杆菌1。 NTM在我们周围的环境中无处不在,包括水、土壤、动物、植物、乳制品和其他食品,NTM易引起肺部及皮肤感染,引发肺部疾病最为常见2。 自20世纪90年代中期以来,特别是随着艾滋病的流行、器官移植以及免疫抑制剂应用的增多,NTM感染患病率不断上升2。 NTM可以分为快生长分枝杆菌(RGM)和慢生长分枝杆菌(SGM)1。
将患者痰涂片进行抗酸染色,但此方法不能区分麻风分枝杆菌、结核分枝杆菌复合群以及NTM;若抗酸染色为阳性结果,应再进一步利用培养基进行培养,并分离菌株进行PNB(对硝基苯甲酸)生长实验,以此判断此菌株是RGM或SGM以及是否为NTM,并且抗酸染色法存在阳性率不高的缺点。 培养NTM具有挑战性,需要很长的时间(7天到几周)3。 痰检阳性率大多在35%以下4。 宏基因组下一代测序(mNGS)技术测定法增加了特异性和敏感性。
结核分枝杆菌感染与NTM感染临床表现相似,临床医生易将NTM疾病误诊为结核分枝杆菌病或者真菌感染如“孢子丝菌病模式”,采取不当的治疗手段,对患者病情造成不良影响2,甚至并不考虑NTM疾病而直接对患者施用结核杆菌病治疗手段,等患者长期治疗后并未见好转,才重新考虑患者所得为NTM疾病,而此时患者感染部位多已出现实质性损伤、内在病菌药敏反应迟钝等恶性影响5。因此,对感染菌株进行鉴定对于NTM感染性疾病的诊疗至关重要2。 案例一
一例非HIV患者偶发分枝杆菌和马尔尼菲篮状菌的播散性混合感染6
基本信息:患者女性,28岁 主诉:右侧颈部淋巴结肿大约2月,反复发热1月余。 现病史:患者于2017年8月17日入院,右侧颈部淋巴结肿大约2月,反复发热1月余,并伴有双侧腿部红疹、水肿和疼痛性皮下结节。 既往史:2015年有宠物鼠咬伤史。 体格检查:右颈骨淋巴结肿大,双侧小腿有疼痛的结节性红斑。 辅助检查 血红蛋白:9.4 g/dL↓,红细胞压积:28.8%↓,白细胞计数:16.27×109/L↑,中性粒细胞计数:78.6%↑,血小板计数:418×109/L↑。 C反应蛋白:138.15mg/L ↑,红细胞沉降率:88mm/h↑。 HIV血清学:阴性,血清隐球菌荚膜多糖抗原检测:阴性。 免疫球蛋白水平和淋巴细胞亚群正常。 T细胞斑点试验(T-SPOT):不确定。 血、痰、支气管肺泡灌洗液(BALF)培养:阴性,皮肤损伤培养:阴性。 胸部电脑断层扫描(CT)显示右上肺斑片状浸润,肺门和纵隔淋巴结肿大(图1A 和B)。 颈部淋巴结的病理:肉芽肿性炎症,抗酸染色和PAS染色:阴性(图2A 和B)。 EBUS-TBNA活检显示散在的肉芽肿性炎症。
图1:(A和B)显示肺门区淋巴结肿大;(B–E)显示肺门区增大的淋巴结逐渐缩小。 图2:(A和B)H&E染色病理检查(H & E,100×;H&E,400×)提示肉芽肿性炎症。肉芽肿由淋巴结中的上皮样细胞组成。PAS(-)。 脑脊液检查正常,涂片和培养:阴性。 骨髓活检:未发现血液恶性肿瘤细胞,骨髓和淋巴结组织的培养:阴性。 颈部淋巴结病理检查:化脓性坏死性淋巴结炎,无真菌,PAS (-)。 正电子发射断层扫描-计算机断层扫描:右肺门、纵隔、右锁骨上和右颈部多发淋巴结肿大,脾肿大和多处骨代谢增加。 马尔尼菲篮状菌qPCR:1798拷贝/uL;2020年1月的BALF样本的qPCR分析检测:马尔尼菲篮状菌。 淋巴结mNGS:偶发分枝杆菌。
诊断:偶发分枝杆菌和马尔尼菲篮状菌的播散性混合感染。 治疗:给予两性霉素B、伏立康唑(VRC)、利奈唑胺(LZD)和ETM。 转归 图3:(A)胸部CT显示斑片状浸润、带状和结节状阴影、胸腔积液。(A–C)右肺下叶病变,胸腔积液逐渐吸收。 播散性NTM感染的诊断主要基于阳性血培养,其次是骨髓、肝脏和淋巴结组织的阳性培养。在该病例中,脑脊液、骨髓和淋巴结组织等培养均为阴性,淋巴结样本中通过mNGS检测到偶发分枝杆菌,这是感染的最佳证据。同时,通过qPCR检测高拷贝的马尔尼菲篮状菌,最终确定诊断。 案例二
一例堪萨斯分枝杆菌感染和GATA2突变的MonoMAC综合征7 基本信息:患者女性,65岁 主诉:反复发热5月,再发一天 现病史:患者5月前因骨髓母细胞增多、巨核细胞减少而入院,接受了四个疗程的氨磷汀治疗,但症状没有改善。住院期间,患者感染了复发性肺炎,通过多种抗生素治疗缓解。两个月后,发热和肺炎的症状再次出现,发热为38.3–39℃,伴有胸闷、咳嗽、咳痰和气短。 既往史:骨髓增生异常综合征(MDS)病史5年 辅助检查
血细胞计数:淋巴细胞减少和单核细胞减少,白细胞(WBC)计数:1800细胞/mm3,单核细胞计数:0–0.1细胞/mm3;血红蛋白:7.6 g/dL,血小板计数:17×109/L。 B细胞(CD19+)的绝对计数:6×106/L(50–670×106),NK细胞(CD3-/CD16+56+)的绝对计数:34×106/L(40–1000×106/L),CD4+T细胞计数:141细胞/mm3,CD4/CD8:0.99。 脾肿大(大小为4.1厘米)。 铁蛋白:2361.4ng/mL。 EBV-DNA和巨细胞病毒(CMV)-DNA:阴性。 痰培养:肺炎克雷伯菌。 外周血标本测序:堪萨斯分枝杆菌。 外周血NGS:GATA2、U2AF1、SETBP1、KMT2D、 BRAF、EPPK1和ETV6 突变。
NTM种类较多,本文介绍了偶发分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌两种NTM的两个案例,可以看得出来,对于NTM疾病,很多传统检测手段都较难发现病原体,mNGS有助于提高诊断率。临床上类似的有趣的案例还有很多,我们将在今后的系列中继续分享更多的病例,欢迎大家关注。
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