ISPD产前诊断基因组测序的最新声明—pES、检出率+31%、CMA不能少

2022-5-30 15:21| 编辑: 归去来兮| 查看: 2396| 评论: 0|来源: 章博讲遗传

摘要: pGS虽然检测范围更广，阳性率更高，但是不好解释的不明确结果、偶然发现、意外发现也会多很多。

近日，ISPD(国际产前诊断协会)在官方刊物上发表了“关于产前诊断中使用基因组测序的最新声明”用以取代2018年的旧版本声明，对于产前诊断中使用基因测序给出了方案和一系列建议。具体内容可以看原文（https://obgyn.onlinelibrary.wiley.com/doi/ftr/10.1002/pd.6157），机翻的论文截图后面也贴了。这里讲一些我觉得有意思的地方。

是pES不是ES。

产前诊断中的基因测序，依据测序范围和数据量的不同，有基因组测序（GS、genome sequencing）、外显子组（ES、exome sequencing）、临床外显子组（CES）、组合测序（panal）等，和产后儿童或成年人基因测序的命名方式一致。但是，因为产前诊断时分析方案与产后存在相当大的不同，一般都集中在产前诊断可分析基因范围内，方式也是产前特有的。所以，产前ES、GS等可以单独标注为pES、 pGS等、加以区分。（挺重要的一点，这样就能把产前、产后两种不同方案的ES分开了，交流沟通分析起来会容易很多，而且也为未来拓展做了准备。赞！）

pGS虽然检测范围更广，阳性率更高，但是不好解释的不明确结果、偶然发现、意外发现也会多很多。所以现阶段，pES是应用最广泛的。

pES额外增加检出率：31%（15~42%）

胎儿超声异常，且染色体核型、基因芯片（CMA）正常时，pES额外增加的阳性率约为31%。不同的超声异常行测序检测时，阳性率各不相同。

单纯NT增厚时阳性率最低，仅增加2%；单纯肾脏泌尿系超声异常时，为9%。单纯骨骼异常时，检出率可增加53%。

（别被数字给迷惑了，虽然单纯肾脏回声增强时检出率能达到72%，不过病例数较少，需要酌情参考；就我们经验而言，这块阳性率挺低的。另外，虽然仅仅NT增厚时，pES的检出率增加不多，才2%；但是考虑到后期出现其他超声异常、超声检查不慎漏掉其他异常等情况；做上pES也是应该的，毕竟NT+其他异常的额外检出率可以+26%）

Trio pES优先

父母胎同时做pES（Trio pES）很重要，实在不行的话，起码是胎儿pES+父母特定位点复核。

（虽然Trio pES的检出率比单独胎儿做pES高很多（统计数据认为能翻倍），但是因为涉及到费用翻倍的问题，我们在临床实践中想要说服父母一起做检查一直是非常困难的事情；看来老外也有同样的困扰）

团队分析+全面咨询

检测前、后需要整个医疗团队共同分析、报告，检测、分析人员需要能够获取第一手的临床信息。（看过我前面一些文章的读者一定深有体会，分析人员团队合作+主观努力+足够的临床信息实在太重要了）

检测前后需要跟孕妇及家属全面、详细、个性化地进行分析、咨询、解释。包括结果定义，不明确结果、次要结果、意外发现、非亲生父母、数据库存储使用等，都应该仔细沟通清楚。（搞遗传咨询的专科医生如果没有专门培训，也看不明白pES、pGS的结果，所以由懂行的人进行详细的解释非常必要。就我个人而言，一段时间不学习就会有明显有跟不上趟的感觉，进展实在太快了。）

在pES之前或同时进行CMA检测

pES可否检测所有CNV？这个问题还没有肯定的结论。所以，不管pES做不做，CMA都是需要做的。

（费用又是个问题了，从我们的经验来看，pES做CNV不是测不到，是测到的太多，真真假假混在一起分不开。要想可靠的CNV，起码现阶段还是得依靠CNV seq或者CMA）

pES的适用情况

超声异常或家族史；现阶段还缺乏足够人群数量进行前瞻性研究的数据、故暂不支持穿刺时常规进行pES，除非有家族史支持某些胎儿期无症状的疾病。

（如果超声水平达不到、或者穿刺时超声还没异常、或者就是产前超声没异常的（比如β重型地贫），就不关注了，然后就生个异常宝宝出来？穿刺都已经做了，就不给查，最后来一句，因为发病率低，为了替你着想，没给你查，所以抱歉，只能算你倒霉。坦白讲，有点别扭，是不是可以再主动一点。pES不可行的原因是缺乏表型支持、等于全是次要和意外发现，没法分析。那是不是可以缩小范围；比如搞个pESCS，prenatal exomesequencing for carrier screen之类的，ES既然能加p、自然也能加CS，而CS领域在业界还是有不少积累的，这是不是就解决了呢？）

还有一些遗传学知识，可以关注本公众号看看

后面是机器翻译的，原文请到官网阅读下载。

https://obgyn.onlinelibrary.wiley.com/doi/ftr/10.1002/pd.6157

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