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《新冠肺炎实验室检测技术指南》的演化解析(一)

2021-5-31 15:51| 编辑: 归去来兮| 查看: 2130| 评论: 0|来源: 原博士带你做检测

摘要: 当前一边是全球每日新增新冠确诊病例仍处在高位,另一边是我国疫情总体平稳,疫苗免疫数量一骑绝尘。这既是我国制度优势的结果,也是整个检测行业全产业链多年积累厚积薄发的结果。希望大家积极去打疫苗,使我国早日 ...

    当前一边是全球每日新增新冠确诊病例仍处在高位,另一边是我国疫情总体平稳,疫苗免疫数量一骑绝尘。这既是我国制度优势的结果,也是整个检测行业全产业链多年积累厚积薄发的结果。希望大家积极去打疫苗,使我国早日达到群体免疫。



一、背景

    2021年5月11日,国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制综合组发布了《新型冠状病毒肺炎防控方案(第八版)》。我满怀着当年追剧的激动心情立刻下载学习,第八版是目前几个版本里修改最多,最完善的一个版本。《新型冠状病毒肺炎防控方案》中的《新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测技术指南》(简称“指南”)可以说是中国检测行业应对新冠肺炎的成功经验集成。指南从第一版到第八版是从不知所措到从容应对;从基本原则到细节不断完善,可操作性越来越强。甚至有些内容新一版本直接否定前一版本的要求,这在以往的官方文件中是很罕见的,但是这也恰恰体现了这一些指南的求真务实和生命力。这篇文章我以我自己浅薄的见解去为大家解读这一系列指南的进化历程。



二、演化历程

发布时间
防控方案
技术
主要内容
2021.5.11第八版
附件10
样本采集(增加物体表面和污水标本)、新冠病毒的实验室检测(核酸检测、病毒全基因组测序和血清抗体检测)和实验室活动的生物安全要求(实验活动、样本处置和实验室废弃物处理及实验室污染的处理
2020.9.11

第七版

附件6
样本采集、新冠病毒的实验室检测(核酸检测、血清抗体检测)和实验室活动的生物安全要求(实验活动和样本处置
2020.3.7.

第六版


2020.2.21.第五版附件4
样本采集、实验室检测、实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸和病原生物安全实验活动要求
2020.2.6.第四版附件4 第四版
2020.1.28.第三版附件4 第三版
2020.1.22.第二版第二版
没找到
第一版


    1.第二-五版

    2020年1月22日到2020年2月21日,仅仅一个月的时间,新型冠状病毒肺炎防控方案就从第二版更新到第五版,这一个月也是中国疫情最严重的时期。指南第二版主要有四部分内容:样本采集、实验室检测、实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸和病原生物安全实验活动要求。首次明确了新型冠状病毒感染的常规检测方法是通过实时荧光RT-PCR鉴定。核酸检测方法主要针对新型冠状病毒基因组中开放读码框ORF1ab和核壳蛋白N。”确定了针对ORF1ab和N基因双基因检测的要求和引物探针的序列。第二-五版基本结构未发生变化都是基于第二版的不断补充完善的过程,到第五版已经趋于完善。

    1.1样本采集

    与第二版相比较,样本采集部分:样品类型由上呼吸道标本、下呼吸道标本、血液标本、血清标本,第三四版增加了眼结膜标本和便标本,但是第五版又删除了眼结膜标本。

    样本采集方法部分第二到第四版本均提到“聚丙烯纤维头的塑料杆拭子”,第五版以后仅描述为拭子。(虽然不提了,但是后续还是基本使用了聚丙烯纤维头的塑料杆拭子

    第三版开始拭子采样“使用了将拭子头浸入含3ml病毒保存液(也可使用等渗盐溶液、组织培养液或磷酸盐缓冲液)的管中,尾部弃去,旋紧管盖”(病毒保存液开始广泛应用)

    第五版的样本采集处理中增加了痰消化液储存液和粪便标本处理液配方和咽、鼻和肛拭子的采样细节。

    血液标本由第二版的“建议使用含有抗凝剂的真空釆血管”修改为“建议使用含有EDTA抗凝剂的真空釆血管”(肝素抗凝剂抑制qPCR反应)

    标本包装方面增加了“涉及外部标本运输的,应根据标本类型,按照A类或B类感染性物质进行三层包装
   1.2新型冠状病毒的实验室检测

    在“同一份标本中新型冠状病毒2个靶标(ORF1ab、N)特异性实时荧光RT-PCR检测结果均为阳性。”基础上增加了一个条件“两种标本实时荧光RT-PCR同时出现单靶标阳性,或同种类型标本两次采样检测中均出现单个靶标阳性的检测结果,可判定为阳性”。

    1.3实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸

   结果判定部分增加了“注:如果用的是商品化试剂盒,则以厂家提供的说明书为准。

    1.4病原生物安全实验活动要求

   与第二版比较在进行病毒培养和动物感染实验方面增加了“实验室开展相关活动前,应当报经国家卫生健康委批准,取得开展相应活动的资质

  第二版对于灭活材料的操作“感染性材料或活病毒在采用可靠的方法灭活后可在BSL-1实验室操作。修改为“感染性材料或活病毒在采用可靠的方法灭活后进行的核酸检测、抗原检测、血清学检测、生化分析等操作应当在生物安全二级实验室进行。”


    2.第六版

    第六版的画风是这样的,没有技术指南的内容。

    


    3.第七版
    第七版发布时我国的疫情已经基本得到了控制。第七版的最大变化是由四部分内容:样本采集、实验室检测、实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸和病原生物安全实验活动要求。变为了样本采集、新冠病毒的实验室检测和实验室活动的生物安全要求。

    3.1样品采集中的样本类型增加了肛拭子和尿标本

    3.2血清抗体检测

    新冠病毒的实验室检测中除了实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸还增加了血清抗体检测;

血清抗体检测(胶体金、磁微粒化学发光、ELISA)用作新型冠状病毒核酸检测阴性病例的补充检测,在疑似病例诊断中与核酸检测协同使用。实验室确认阳性病例需满足血清新型冠状病毒特异性IgG抗体阳性或恢复期较急性期4倍及以上升高。

    3.3样本处置

    实验室活动的生物安全要求上增加了样本的处置。各省级卫生健康行政部门要根据疫情防控需要和实验室生物安全有关要求,及时研判提出新型冠状病毒实验室检测生物样本处置意见。对确需保存的,应当尽快指定具备保存条件的机构按照相对集中原则进行保存,或送至国家级菌(毒)种保藏中心保藏;对无需保存的,由相关机构按照生物安全有关要求及时处理



    4.第八版

    如果说前二到七版仅仅是量的变化,到了第八版则产生了质的飞跃。它已经不是一个技术指南而变成了一个技术指南的集成,里面的很多内容已经直接与一系列相关的标准相关联。指南的结构仍然是样本采集、新冠病毒的实验室检测和实验室活动的生物安全要求三部分内容,每一部分都进行大幅的增加。样本采集部分增加了物体表面标本和污水标本的内容,新冠病毒的实验室检测中除了实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸、血清抗体检测还增加了病毒全基因组测序,核酸检测中增加了实验室功能分区、详细检测流程和质控的要求;实验室活动的生物安全要求部分除了实验活动和样本处置和实验室废弃物处理及实验室污染的处理。

   

    新冠对于所有的检测人来说机遇大于挑战,每个人都应该在这样的机遇中尽快完成知识的更新,技术的升级以应对即将到来的大浪淘沙。下一篇会重点讲解第八版的内容,敬请期待。


参考文献:

[1]  关于印发新型冠状病毒肺炎防控方案(第八版)的通知http://www.gov.cn/xinwen/2021-05/14/content_5606469.htm

[2]   关于印发新型冠状病毒肺炎防控方案(第七版)的通知http://www.gov.cn/xinwen/2020-09/15/content_5543680.htm

[3]  国家卫生健康委办公厅关于印发新型冠状病毒肺炎防控方案(第六版)的通知http://www.nhc.gov.cn/jkj/s3577/202003/4856d5b0458141fa9f376853224d41d7.shtml

[4]   国家卫生健康委办公厅关于印发新型冠状病毒肺炎防控方案(第五版)的通知http://www.gov.cn/zhengce/zhengceku/2020-02/22/content_5482010.htm

[5]   国家卫生健康委办公厅关于印发新型冠状病毒肺炎防控方案(第四版)的通知http://www.gov.cn/zhengce/zhengceku/2020-02/07/content_5475813.htm

[6]   国家卫生健康委办公厅关于印发新型冠状病毒感染的肺炎防控方案(第三版)的通知http://www.nhc.gov.cn/jkj/s7923/202001/470b128513fe46f086d79667db9f76a5.shtml

[7]   新型冠状病毒感染的肺炎防控方案(第二版)http://www.nhc.gov.cn/jkj/s3577/202001/c67cfe29ecf1470e8c7fc47d3b751e88.shtml

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