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肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)

2020-11-16| 编辑: 归去来兮| 查看: 360| 评论: 0|来源: 基因talks

摘要: "中国首个TMB检测及临床应用专家共识出炉,离合规不远了......"2020年的11月11日,《中国癌症防治杂志》正式发表了《肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)》,为了让大家能够享受“双十一活动” ...


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中国首个TMB检测及临床应用专家共识出炉,离合规不远了......

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2020年的11月11日,《中国癌症防治杂志》正式发表了《肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)》,我们一起简单领略下该TMB专家共识的主要8条共识要点:


首先,TMB作为近几年免疫治疗疗效敏感性评估的关键生物标志物,已成为临床基因检测的标配,但检测方法、阈值和报告格式缺乏统一标准。此TMB专家共识结合中国实践,为临床提供了8条TMB检测及应用共识推荐:


1

专家共识1:TMB一般是指特定区域内体细胞非同义突变的个数,通常用每兆碱基有多少个突变表示(XX 个突变/Mb)。TMB 评估受样本质量和数量、检测基因组大小、生信分析方法等多种因素影响,临床应用前应了解TMB 的适用范围。不同检测方法获得的TMB应进行系统评估,判断是否具有可比性。TMB 数值可反映肿瘤内产生肿瘤新抗原的潜力,与DNA修复缺陷密切相关,在多种肿瘤中dMMR和MSI-H患者具有较高的TMB。


2

专家共识2:tTMB是一个新兴的独立ICIs 治疗疗效预测标志物,与多种肿瘤类型ICIs 单药或两种ICIs联合治疗的疗效相关,已证实可作为泛癌种免疫治疗疗效的预测标志物。推荐既往标准治疗后疾病进展且没有更好替代疗法的实体瘤患者,尤其是高TMB的患者进行TMB检测,有助于扩大免疫治疗获益人群。中国人群TMB的独立预测价值仍需更多前瞻性研究验证。


3

专家共识3:目前研究证据显示在NSCLC中bTMB与tTMB 具有显著相关性,但bTMB检测无统一标准。多项回顾性研究发现高bTMB与NSCLC患者接受单药ICIs治疗获益显著相关,但尚未获得高级别前瞻性临床研究证实。


4

专家共识4:推荐使用近期石蜡包埋肿瘤组织样本进行tTMB 检测,待检测组织应首先完成病理质控并确保恶性肿瘤细胞数能够满足检测要求。为过滤胚系突变对后续tTMB评估的影响,应采集患者外周血、唾液或正常组织作为对照样本。建议优先采用NMPA批准上市的核酸提取试剂盒进行基因组DNA提取,tTMB检测实验室应根据实际需求建立合适的DNA样品质控标准和操作流程,对待测DNA样品纯度、浓度及片段化程度进行严格质控。肿瘤原发灶与远处转移灶组织均可用于tTMB评估。


5

专家共识5:采用靶向测序Panel进行TMB 评估时,建议与WES评估的TMB进行一致性评价靶向测序Panel覆盖范围原则上不应<1.0Mb最低有效测序深度应≥500X。建议进行TMB检测的靶向测序Panel尽可能涵盖患者更多的其他分子遗传信息,包括可指导靶向治疗的驱动基因突变、与基因变异产生相关的免疫治疗正向预测因子以及可能的免疫治疗负向预测因子。目前已有多款NGS测序仪获国家NMPA批准用于临床基因检测,不同实验室可依据样本量、时效要求选择不同测序平台。


6

专家共识6:基于靶向测序Panel的TMB检测应以WES检测为金标准,纳入影响蛋白质编码的体细胞突变,应保证检出突变频率>5%的体细胞突变,以保证TMB检测值的准确性和稳定性;应依托ICIs疗效随访数据库对基因组比对和突变检出算法开展标准化研究;Panel检测区域可影响TMB值,应通过至少1 000例WES数据予以校正。同时建议使用对照样本过滤胚系变异。


7

专家共识7:TMB值在不同癌种中存在显著差异,应依据ICIs临床疗效确定阈值,才能最大可能筛选出ICIs治疗的潜在获益人群。值得注意的是,不同靶向测序Panel的TMB检测体系之间TMB阈值不能通用。


8

专家共识8:TMB报告内容除重点描述TMB计算原则和数值外,还应针对癌种的免疫治疗意义进行解读;同时还需系统评估Panel检测的各种驱动基因突变情况,以全面解患者的肿瘤生物学特征,建议应用分子肿瘤诊治专家组模式(MTB)进行临床辅助决策。

在中国,目前还没有基于肿瘤组织或血液的NGS大panel产品获批,虽有多家肿瘤基因检测公司正在积极注册申报NGS大panel,但仍缺乏相应的标准化,尤其是TMB的检测评估标准化。相信此次《肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)》的发布,有助于推动NGS大panel检测(包括TMB)的标准化发展和建立,合规不再远了!


看看自己处在注册申报哪个阶段呢


参考资料:

1.中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会遗传性肿瘤标志物协作组,中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会分子病理协作组,《肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)》,《中国癌症防治杂志》.

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