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访福建省肿瘤医院许春伟博士:新型NGS技术临床应用前景广阔,肿瘤精准医疗未来可期!

2019-12-26 10:28| 编辑: 面气灵| 查看: 2872| 评论: 0|来源: 转化医学网

摘要: 问许博士您好,我们得知刚刚发表在Clinical Chemistry上的一篇文章中提到,通过DNA+RNA同时测序来检测癌症组织中的基因融合和碱基突变,这是一个创新的工作。您是文章共同一作,您能否谈一谈“双核酸模板”测序的意 ...




许博士您好,我们得知刚刚发表在Clinical Chemistry上的一篇文章中提到,通过DNA+RNA同时测序来检测癌症组织中的基因融合和碱基突变,这是一个创新的工作。您是文章共同一作,您能否谈一谈“双核酸模板”测序的意义在哪里?



我们知道基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个癌基因,是大规模探测突变的强有力工具,但在融合/重排检测方面由于假阳性等各方面原因仍具有一定挑战,靶向二代测序是一种能够综合鉴定肿瘤生物标志的方法,根据不同的变化情况,起始检测材料可为DNA或RNA,但分别进行两次检测由于样本量缺少的问题常常不可实现,进而延误或完全没有检测到关键变异事件,特别是那些有效的可靶向治疗的融合事件,因此双核酸模板单次检测是实际工作中迫切需求的。



能否介绍一下,您在这项工作中负责哪部分内容?在您看来,这项工作可能为医疗行业带来什么样的改变?



我的专业是病理学,一直在从事病理科实践工作,在这项工作中,我主要从分子病理的视角进行了方案设计。坦率地说,我看到的很多方法是不太经得起临床实践考验的,或者要在后期不断磨合才符合要求。所以一开始就把临床实践积累的经验带进方案设计,重点考虑如何能够减轻而不是增加病理工作的负担,是我们这项工作的一个突出亮点。这个效应在论文的很多细节都可以体现出来,如对样本年限的评估、质控方法的确立、强调操作的简便易用、对千差万别样本的容忍、强调检测范围须聚焦可用药或耐药靶点、以及检测结果的可靠及可验证。此外,我还负责报告位点的医学解读,临床病理分析以及统计工作。


我认为这项工作给医疗行业, 特别是肿瘤靶向诊治领域带来的影响是深远的,获益的不仅是患者也是病理医生,因为它解决了临床工作中晚期肿瘤病人由于穿刺样本少、只可做一种NGS检测,所造成的众多可治疗靶点阳性患者漏检的问题。另外,病理科日常工作繁重,如果分别开展DNA和RNA两项高通量测序,项目会有很多实际困难,而这个“一管双检”的创新方法为病理科工作提供了很大的便利。



作为肿瘤病理学专家,您认为目前在临床上,NGS测序发挥了多大的作用?整体效果如何?有哪些需要解决的问题?



当今,肿瘤诊治已迈入个体化及精准医学的时代,从“一刀切”向“针对每一个病人的具体病情,正确选择并精确地应用适当的治疗方法”发展,这对进一步提高治疗的有效性降低不必要的药物副作用、及节约医疗支出都有着深远的意义。肿瘤的精准医疗是一项系统工程,包括精准诊断、精准治疗、精准管理多个环节,均以精准的肿瘤基因检测为基础。生物技术的进步使得探索具有临床意义的基因异常变得可能。临床肿瘤学实践中,基因检测已成为精准诊治的前提和核心之一, NGS在开展精准诊治实践与试验研究中有着广阔前景,能更好的帮助临床医生在实际临床患者诊疗中,提升诊断水平,做出合理正确决策,提高患者生存质量。


NGS技术正处于不断的发展和完善过程中,我们需对NGS技术现状有正确的认识。在过去十年,肿瘤学界的研究和应用显示:在恰当的技术条件下,NGS确实能够高通量地检测分析肿瘤中的驱动基因变异或治疗性靶点,给部分患者带来治疗和生存的获益。目前关于NGS出现的问题和解决方法,中国肿瘤驱动基因分析联盟推出的中国首部《NGS技术在肿瘤精准医学诊断中的应用专家共识》里面说得比较清楚,主要由36条声明组成,最重要的就是临床肿瘤诊断应用的NGS 项目应符合相应的诊断技术标准。影响NGS结果的限制性因素包括:平台类别、靶区域富集方法、文库构建及扩增效率、测序数据量、生物信息学分析流程等。在临床应用之前,对于特定突变位点的NGS检测结果,在低质量数据条件下应采用其他方法进行结果验证。检测实验室的专家、肿瘤患者的主诊医师与患者应就开展肿瘤NGS分析的利弊进行充分沟通和知情同意,同时让临床医师了解特定NGS测试项目的医学意义。


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