近期，Nature Medicine连发2篇液体活检相关研究，刷爆了大家的朋友圈，也刷新了大家对于cfDNA基因检测的认知。 “ cfDNA超深度测序得出重要结论：超过50%的ctDNA突变源自白细胞、而非肿瘤细胞，即为“假阳性” 由纪念斯隆·凯特琳癌症中心（MSKCC）和GRAIL公司联合研究发表，使用一种超深度测序法（测序深度为6000*），通过对124名晚期肿瘤（包括乳腺癌、肺癌、前列腺癌）患者的cfDNA、配对组织及白细胞测序分析，来研究cfDNA突变的真正来源，并明确临床测序方法测得ctDNA突变的真实性。
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点击查看大图 刷新认知的结论：
“ 《自然》打开另一扇门： CTC携带更全面的肿瘤基因信息更全面，CTC高通量测序可更早的预测复发和转移 《自然. 医学》上发表的另一项研究，由英国肺癌研究联盟（TRACERx）发表，研究结果显示基于CTC的高通量测序（CTC-NGS）可提供更全面的肿瘤基因信息，可前瞻性了解基因变异信息，比临床影像学可提早10个月预测肿瘤复发；更重要的是肿瘤进化分析表明，CTC与转移灶是同一进化分支，即表明CTC可能为肿瘤复发的始祖细胞。
研究共纳入了100位早期非小细胞肺癌患者。研究者运用高通量测序技术对肿瘤组织（原发灶多个部位、转移灶）和液体活检标本（CTC和cfDNA）进行基因分析，以及ctDNA、CTC与原发肿瘤、转移病灶的基因变异信息进行对比分析。研究表明，早期肺癌CTC能有效预测手术后的生存和复发。 令人惊艳的结果（一） CTC与原发组织的突变一致性为79%，与转移组织的突变一致性为91%
令人惊艳的结果（二） 肺癌早期CTC与10个月后转移灶基因突变一致性达到91% ▲向右滑动查看全部 令人惊艳的结果（三） 肺癌早期CTC与转移灶属于同一肿瘤进化分支，是肺癌复发的直接原因 ▲向右滑动查看全部 “ 循环肿瘤细胞（CTC）往往代表肿瘤侵袭能力最强的亚克隆细胞群。与 cfDNA相比，它具有完整的肿瘤细胞（包括DNA、RNA和蛋白），携带更全面的肿瘤基因遗传特征。CTC不仅能携带原发肿瘤的突变信息，也能携带数月后发生的转移灶突变信息，这提示了CTC在克服肿瘤时空异质性，提供肿瘤实时、全景基因突变谱的独特优势，CTC甚至为提前预知转移机制、明确遏制转移的治疗靶点、降低肺癌术后复发率方面，展现了巨大的临床应用潜能。 随着液体活检行业和测序技术的快速发展，CTC测序作为监测癌症进展和进化机制研究有效且独特的工具，近年来已成为肿瘤领域前沿科研的新宠。 CTC高通量测序(CTC NGS)研究 CTC 特有的生物学特性 CTC是完整的肿瘤细胞，携带肿瘤的全部基因遗传信息，包括基因组、转录组和表观遗传组学，可提供更全面的遗传信息供科学研究；在临床上，CTC的体细胞变异与原发灶、转移灶具有高度相关性，研究表明可用于临床肿瘤的复发和转移监测和预后。 关于CTC测序的研究报道 随着二代测序技术和单细胞技术的发展，目前对于CTC基因测序研究，也越来越多。 2015年Oncotarget曾报道 ，晚期前列腺癌CTC与组织之间全基因组织测序的相关性。结果显示：86%的CTC突变可溯源到原发组织、转移组织。其中，与原发组织的一致性为17%，与转移组织的一致性为8%，三者同时携带的突变为61%。研究结果表明，CTC携带原发组织、转移组织、更全面的肿瘤基因信息，可进行肿瘤进化分析。 2016年，112名转移性乳腺癌患者研究，对其中5名乳腺癌患者的CTC、CFDNA、和原发组织进行NGS测序分析。 2018年，CANCER RESEARCH报道研究显示，对12名晚期乳腺癌患者的CTC与转移组织，进行NGS突变和CNV检测，其一致性为85%。
Cell Biol Toxicol (2018) 34:405–415 点击查看大图 CTC高通量测序，集科研和临床应用的双重价值于一身 CTC 作为完整的肿瘤细胞，携带有肿瘤全部的基因遗传特征，所特有的生物学特性，使其具有cfDNA和组织以外的独有优势，可作为有效补充服务于科研和临床。 01 NGS和单细胞技术的快速发展，可获得CTC完整 随着NGS和单细胞技术的快速发展，可获得CTC完整基因组信息，与原发灶、转移灶进行对比分析；CTC NGS检测作为临床监测肿瘤进展和预后的工具被临床应用。 FD Luca et al.报道发现，在基线CTC的体细胞变异中没有，而在化疗后CTC中出现新的体细胞突变(De Luca et al. 2016)。如在所有治疗后CTC中，HER2 p.V777L均能检测到，表明这个突变可能在治疗抵抗中具有重要作用。 02 CTC测序，可前瞻性了解治疗压力下的肿瘤基因变异，为下一步临床用药选择提供指导 随着不同药物治疗的压力下，肿瘤基因会发生新的变异，CTC可动态、实时的监测肿瘤基因变异、了解肿瘤的进展，如可能是在治疗前/后发生或消失的临床相关突变。从而，为临床下一步用药提供参考依据。 03 CTC测序，有助于探索转移发生的分子机制 CTC NGS被成功用于监测转移肿瘤和复发肿瘤的基因组变异分析，研究肿瘤在治疗过程中肿瘤演化、基因表达变异及EMT的机制。CTC代表更具攻击性的肿瘤细胞，是肿瘤转移的关键步骤，CTC基因组测序可对肿瘤进化过程、了解转移机制提供更多信息；以及指导下一步治疗（可针对该克隆进行）都具有重要意义。 04 CTC测序，揭示肿瘤生物学特性和进化论的的有效工具 与原发肿瘤、转移肿瘤的单独测序相比，CTC测序可以提供更多肿瘤内部异质性的信息。 肿瘤细胞不断获得新的体细胞突变，不同亚群细胞通过选择以提高适应能力和生长优势，了解肿瘤内异质性和进行对肿瘤复发的早期检测和提高治疗有效率具有重要意义。 Cell Biol Toxicol (2018) 34:405–415 ▲向右滑动查看全部 参考文献
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