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论微生物质谱的正确使用姿势—— 《MALDI-TOF MS在临床微生物鉴定中的标准化操作专家 ...

2019-4-24 08:20| 编辑: 小桔灯网| 查看: 2001| 评论: 0|来源: 梅里埃诊断

摘要: 为了进一步规范化微生物质谱的临床应用,由卫生部临检中心胡继红教授联合国内多位专家编写的《MALDI-TOF MS在微生物鉴定中的标准化操作专家共识》近日发表在中华检验医学杂志2019年4月刊上,在2016年《中国临床微生 ...

为了进一步规范化微生物质谱的临床应用,由卫生部临检中心胡继红教授联合国内多位专家编写的《MALDI-TOF MS在微生物鉴定中的标准化操作专家共识》近日发表在中华检验医学杂志2019年4月刊上,在2016年《中国临床微生物质谱应用专家共识》以及2018年《MALDI-TOF MS病原体鉴定质量保证专家共识》的基础上,此次的共识文件更加全面和细致的对于在临床应用MALDI-TOF MS的环节进行了标准化的定义和指导,将为微生物工作者提供更加详尽的指导方针。

共识分别从样本的培养条件、前处理方法、上机流程、结果的解读和审核、鉴定结果的报告原则、质量控制和日常维护几个方面对微生物质谱的操作使用过程中的关键步骤进行了详细描述,针对容易出现的问题进行了阐述和建议,对于微生物人员的日常工作更具参考性。

随着微生物质谱在临床使用的不断普及,标准化应用已经成为当下亟需解决的问题。本期公众号就结合此次《共识》中的内容为大家呈现并解读一部分信息。大家可以通过点击“阅读原文”获取完整版共识文件进行学习哦。

样本的培养

  1. 强调了MALDI-TOF MS的分析对象必须是经培养分纯的微生物,而不能是临床样本或混合培养物

  2. 应尽可能选择非选择性的培养基,减少对图谱质量的影响

  3. 不同微生物应遵照相应的培养时间以获得足够生物量的蛋白

小梅点评


很多情况下没有获得理想的鉴定结果时,是否应该先检查一下培养物的生长情况和纯度呢?毕竟目前MALDI-TOF MS的分析方法还是针对单个细菌的,所以保证细菌的纯度和量还是很重要的哦!

样本前处理

  1. 不同的微生物应参照不同的前处理方法,进行必要的灭活、提取

  2. 靶板的涂布需要做到均匀且避免交叉污染

  3. 特殊的粘液型菌落或干燥型菌落可使用特殊的处理方法

  4. 操作过程中需注意生物危害和化学危害

小梅点评


为什么有时候某些细菌用MALDI-TOF MS鉴定总是不能获得足够多的蛋白峰呢?先检查一下有没有使用正确的前处理方法吧!对了,操作过程中一定要注意生物安全和化学品安全。VITEK MS为丝状真菌和分枝杆菌提供了标准分装试剂盒,使用更加简单,鉴定更加高效。

上机鉴定

  1. 定标是检查关键仪器参数的必要步骤,和质控不同,需每批次进行

  2. 定期进行仪器校准

  3. 图谱的获取推荐按照标准采集路径进行,应获得足够多的数据后再进行分析

小梅点评


不管使用何种质谱系统,定标、校准可是日常必须要完成的步骤,不能因为麻烦就省略哦!不过如果使用VITEK MS就不用担心了,靶板上专门预留了定标用的检测孔,如果定标都没有通过,系统可是不会出具任何鉴定结果的。

结果解释

  1. MALDI Biotyper系统的结果需要注意分值和一致性,以判断可报告的水平

  2. VITEK MS系统的结果解释

  3. 对于低置信度结果的原因分析及处理

小梅点评


结果的解读往往是用户容易忽略的内容,要知道,并非MALDI-TOF MS系统出具的任何结果都可以直接报告临床的,对于鉴定结果的置信度、一致性都需要在报告前认真审核并考虑可能性,需要在排除干扰后重新测试以获得更高置信的结果。如果排除了所有因素后依然不能获得一个高度置信的结果,则需要选择其他的方法以辅助确认。基于完善的数据库和权重矩阵算法的VITEK MS能够最大程度提供高度置信且唯一的鉴定结果,从而减少用户进行复查或补充试验的情况,让结果的报告更具可信度。

鉴定结果的报告原则

  1. 从临床的诊断及治疗角度决定报告到种/亚种水平或属/复合群水平

  2. MALDI-TOF MS总是存在局限性,不同系统间的差别取决于数据库的完整程度和质量,包括菌种覆盖、建库菌株数量及来源以及图谱采集的质量

小梅点评


并非所有情况下鉴定结果都必须要报告到种水平,但某些情况下必须要报告到种甚至亚种水平。这也要求微生物工作者在使用新的鉴定技术时具备更高的临床意识和思维,即需要考虑鉴定结果对于临床的诊断和治疗上会产生怎样的影响;同时不同MALDI-TOF MS系统所基于的数据库也不同,工作者在使用前应进行详细的了解,包括其特殊的限制性信息等。VITEK MS的数据库正是基于多株细菌建立的图谱数据库,并不断更新完善以覆盖新出现的临床病原体及菌株信息,因而系统的部分局限性也随着数据库的不断完善而得到解决。

性能验证、质量控制及日常维护

  1. 性能验证包括准确性的验证和重复性的验证,应根据情况选择进行完整的性能验证或部分的性能验证

  2. 阳性质控应选择有代表性的标准菌株进行,阴性质控应针对重复用的靶板和可能污染的试剂进行

小梅点评


性能验证的内容可详细参考CLSI M58中的内容和《MALDI-TOF MS病原体鉴定质量保证专家共识》;对于质控,目前需要引起大家关注,很多实验室错误地认为定标就是质控,其实并非如此。定标是针对仪器状态选择相应的参考系,而质控是对整个检验过程的验证,因此质控应该完全模拟真实临床样本的检测。阳性质控针对待检测的细菌范围内选出的代表性菌株进行试验;而阴性质控则是用以证明所使用的耗材无污染且不会对实验产生干扰而进行的空白试验,尤其对于重复使用的耗材如靶板而言是非常必要的,针对耗材污染的问题,VITEK MS推荐使用一次性靶板以及开瓶即用的试剂也是能够有效减少这种机率的。

共识的内容只有寥寥数千字,而对此共识的学习和掌握却是一个长期的过程,很多内容还需要用户在使用过程中不断体会和积累经验,可以肯定的是,这是微生物质谱在标准化过程中走出的重要一步,梅里埃也将紧随脚步帮助和支持所有的质谱用户真正实现使用过程中的标准化、规范化,最大程度发挥微生物质谱的临床价值。

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