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王辰院士特邀报告:推动病原学分子诊断在我国的规范开展

2018-11-14 00:00| 编辑: 小桔灯网| 查看: 2567| 评论: 0|来源: 微远基因

摘要: 2018年11月9日-10日,中国工程院医药卫生学部主办的“第九届中国分子诊断技术大会”在广州召开。中国工程院副院长,中国医学科学院/北京协和医学院院校长王辰院士作《推动病原学分子诊断在我国的规范开展》的特邀报 ...

2018年11月9日-10日,中国工程院医药卫生学部主办的“第九届中国分子诊断技术大会”在广州召开。中国工程院副院长,中国医学科学院/北京协和医学院院校长王辰院士作《推动病原学分子诊断在我国的规范开展》的特邀报告。

王辰院士指出,在2016年全球死亡原因统计中,下呼吸道感染位居第四,导至全球约300万人死亡,腹泻病,结核病也占据前十位置。全球细菌耐药防控的严峻形势,需要以Population medicine的理念进行感染性疾病诊疗和抗菌药物管理。在临床诊疗方面,对于重症肺炎,发热待查,脓毒血症和脑膜炎等疑难危重感染的病原诊断能力严重不足。约有30-40%的病例不能明确感染病原体,造成严重的医疗,经济和社会负担。因此,迫切需要精准而规范的病原分子诊断方法。

在回顾了涂片,培养,免疫学检测等传统病原体检测方法之后,王辰院士重点阐述了分子诊断技术的发展与进入临床病原诊断的历程,分析了正在快速进入临床的分子POCT(多重病原体Panel检测)和基于高通量测序的病原宏基因组检测(mNGS)。根据具体临床需求,应当考虑不同层次分子诊断技术的复杂性与适用性。

王辰院士引用Nature Microbiology的综述,探讨了基于高通量测序的病原宏基因组检测(mNGS)在临床病原体检测中的应用价值。mNGS是一种不需要培养,直接广泛分析临床样本中微生物组的高通量测序方法,可以检测样本中存在的细菌,真菌,病毒和寄生虫等病原体。理论上,mNGS在病原体的诊断,耐药基因分析和新发病原体等方面具有优势,但在理论可行性和现实可行性之间需要深入而全面的临床评估。

王辰院士引用了2014年《新英格兰医学期刊》发表的案例,用mNGS 方法在48小时内检出钩端螺旋体,帮助临床精准诊断14岁联合免疫缺陷综合征男孩感染病原体。而2018年,梅奥诊所发表了一篇mNGS用于人工关节感染诊断大样本对比的文章,指出与传统培养方法相比,mNGS的特异性和敏感性有显著提高。

王辰院士特别引用了中国医学科学院北京协和医院的研究成果,包括神经内科关鸿志教授在2015年开展的中枢神经系统感染宏基因组学多中心研究的系列成果和重症医学科隆云教授的脓毒血症诊断研究。指出目前中国在mNGS方法学研发与临床数据积累方面具有一定的领先优势,需要进一步加大研究力度和深度。

王辰院士提出,鉴于目前mNGS的技术复杂性与经济成本,此方法学的临床适应征主要有三个方面:1. “难”:不明原因发热的疑难感染;2. “重”:急性危重感染,包括重症肺炎,脓毒血症,脑膜炎等;3.“特”:特殊感染人群,包括器官移植,HIV患者,免疫力缺陷患者等。

王辰院士提到,临床诊疗也要与时俱进。2018年4月,高通量测序技术首次被写入《中国成人医院获得性肺炎与呼吸机相关性肺炎诊断和治疗指南 (2018年版)》,与传统诊断方法结合,更加有力支持临床。

对于未来技术发展,王辰院士也谈到了从病原基因测序到基因编辑的发展方向。在2018年CRISPR-Cas12a/13a/14的最新发展,可以分别针对dsDNA,RNA,ssDNA序列进行目标性检测,有望成为更加特异,更加灵敏,快速简易的分子POCT诊断平台,在病原诊断方面有巨大的应用潜力。

在报告的最后,王辰院士提出AI for AI (Artificial Intelligence for Anti-Infection)的远景,需要结合病原基因组学,医学影像智能识别和电子病历文本挖掘等多维数据分析,才能够实现医学人工智能辅助的感染精准诊疗体系。感染性疾病精准医学必须依靠多学科协作(MDT)才能有力推进。

感染,曾是人类面临的致死率第一的疾病,抗生素的发明,使医生在面对先前束手无策的感染时,第一次获得了有效的治疗手段。然而抗生素的过度使用,导至了严重的耐药问题。王辰院士指出:“部分临床医生在出手抗生素的时候,对病原上的根据,从思想意识到真正执行上是远远不足的”。为了提高全社会合理使用抗生素的意识和水平,自2015年以来,每年11月的第三周,是世界卫生组织(WHO)确定的“世界提高抗生素认识周(World Antibiotic Awareness Week,WAAW)”。积极响应WHO号召,在2018年“世界提高抗生素认识周”之际,中国也推出了主题为“细菌耐药防控,中国在行动”的宣传片来帮助大家提高合理使用抗生素的意识和水平。


遏制耐药,中国在行动》

遏制耐药,合理使用抗生素从感染病原精准检测开始,新的分子诊断技术(多重病原体Panel检测)和基于高通量测序的病原宏基因组检测(mNGS)将助力感染性疾病的精准诊治。


微远基因专注于基因科技与精准医疗,拥有两大核心技术平台:基因编辑技术(CRISPR)快速诊断平台与临床宏基因组测序(mNGS)平台。微远通过独立医学检验所或医院联合实验室的业务模式,为医院和患者提供临床检测服务。

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