同一样本，两种商业液体活检的结果却大不相同

两名约翰·霍普金斯大学前列腺癌研究人员发现，当他们向两个不同的商业液体活检供应商提交相同的患者样本时，检测结果却存在显著差异。液体活组织检查是肿瘤组织测序的一种新的无创替代方法，旨在特异性检测和测序患者血液中循环的肿瘤DNA。这些结果用于帮助指导医生为患者疾病的每一个阶段定制最佳的治疗方案。

约翰霍普金斯大学Brady泌尿外科研究所的博士后研究员Gonzalo Torga博士和约翰霍普金斯Kimmel癌症中心的Brady研究所和前列腺癌研究主任Kenneth Pienta博士报告了他们的发现。该研究结果于12月14日发表在JAMA Oncology上。他们认为，结果提示对同一癌症患者可能会采取不同的治疗方法，因为这取决于哪家商业提供商进行液体活检。

比较的两个液体活检组是来自Guardant Health，Inc.的Guardant360，其对73个基因的编码序列的至少一部分进行测序，以及来自Personal Genome Diagnostics的PlasmaSELECT，其对64个基因的编码区段进行测序。

两个实验室均获得临床实验室改进修正案（CLIA）的许可，并获得美国病理学家协会的认可，并且报告具有高敏感性（在这种情况下，能够在发生突变时正确识别突变）和高特异性（当这些突变不存在时正确报告为阴性）。

这两家公司在于覆盖到的基因及基因片段之间是有区别的。在研究的40名患者中，只有25名在两家公司覆盖的重叠基因序列中至少报告了同一个基因突变。

即使这些公司从抽取的同一血液中分析DNA，它们的结果也很少相互匹配。当比较重叠基因序列内的结果时，两家公司的结果完全匹配，只有7.5％（40例患者中有3例）的报告突变。在15％的患者中（6/40），两家公司的结果至少符合一项报道的突变。 40％（40/16）的患者中，两家公司均未检测到可能由两组报道的突变。

Torga和Pienta的研究旨在找到最好的商业实验室来测试转移性前列腺癌诊所的患者样本。 Torga说：“我们希望为患者提供最好的选择，所以我们开始同时向两个地方提交样本，以比较结果。“

患者可能对癌症药物的反应不同，这取决于他们在肿瘤中具有何种基因突变。肿瘤学家使用液体活组织检查的结果来查看患者是否对治疗有反应，并监测肿瘤是否正在进展，并且可能需要新的或额外的治疗。如果在他们的肿瘤DNA中发现特定的突变，他们也可以使用结果选择临床试验的患者。

今年早些时候在JAMA肿瘤学杂志上发表的一项小型研究比较了肿瘤组织样本中的突变和来自同一患者的液体活检结果，发现类似的缺乏一致性。

Torga指出，每个商业化的测试花费大约4,000美元，患者通常只将样品送到一个实验室进行测试。 Torga说：“液体活检是一项很有前途的技术，具有极大的潜力影响我们治疗患者的能力，但是这是一项新技术，可能需要更多的时间和经验才能改善。我们不能从这些研究中得知哪个实验室的检测更好，但是我们可以说这些实验室的认证必须得到改善。”

Torga和Pienta表示，他们希望确保肿瘤医生要意识到检测结果不一致之处，以免盲目信任液体活检结果。


参考文献：Gonzalo Torga, Kenneth J. Pienta. Patient-Paired Sample Congruence Between 2 Commercial Liquid Biopsy Tests. JAMA Oncology, 2017; DOI: 10.1001/jamaoncol.2017.4027