菠萝| 基因测序报告，这本“天书”该怎么读？

如果你花钱请大仙算了一卦，但完事儿后，他不给你好好解卦，却直接丢给你一本根本看不懂的“解卦大百科全书”，你想不想骂人？

现在的基因测序服务经常就是这样。

基因测序，一个火得不行的词，不管是癌症病人，孕产妇，还是普通老百姓，都或多或少会接触到这个词。国内各种基因测序公司如同雨后春笋一般，刺溜一下就冒出来了。

基因测序本身是个非常好的东西，正在迅速改变大家的生活，我举双手双脚赞成靠谱测序的的应用推广，尤其是在癌症（比如遗传基因检测），优生优育（比如测罕见遗传病），和微生物学（比如感染诊断）。

癌症是基因测序的第一大市场。现在对很多癌症病人，尤其是乳腺癌、肺癌、直肠癌病人，基因检测几乎是必做的。

但无论什么应用，基因测序有个最大的问题：普通老百姓看不懂结果，必须请专业人士咨询指导。

但目前多数公司“管测不管说”，“管杀不管埋”，测序结果出来后直接丢一堆分析表格给顾客。很多客人看到结果后，开始恶补生物医学知识，最后仍是一知半解。有人向我感慨：“菠萝，我真后悔当年高中生物课没好好上。”为了让大家感觉好一点，菠萝可以放心的说，即使你当年高中生物课好好上了，你还是看不懂。

要正确理解基因测序结果，必须要有长期的生物学，尤其是遗传学的训练。在免费咨询了几十份基因测序结果以后，我发现，这也许是解决广大生物同学就业难题的好机会！

“21世纪是生物的世纪”，这句话把一群人忽悠进生物专业已经20年了，而这群人在寂寞中隐忍不言，就是在等大家看不懂基因测序结果的那一天。

基因测序结果长哪样？癌症病人基因测序结果到底有多复杂？ 下面是一份我咨询过的肺癌基因测序报告的第1页（一共35页）：

能读懂的请举手！

有多少人拿到这个报告，放眼只看到了“肺癌”“基因”“药物”这几个词？

全外显子是啥？NCCN是啥？杂合多态性和纯合多态性是啥？ADH1B基因是啥？R337C突变是啥？非移码插入突变是啥？基因扩增1.8倍是啥？丰度是啥？

一句话，我的家人到底应该怎么治？

别说普通大众，很多医生或生物专业的人都不能完全搞懂这些玩意儿。

有人也许能一眼看到“EGFR基因，DdelinsDG第20外显子非移码插入突变（丰度44%）”是最关键的，其它很多信息对确定治疗方案并没有什么卵用。但这需要很多年的专业训练。

对于大众，这样一份35页的报告，如果没人解读，对于大众无异于天书。

有人可能会说，基因检测结果的读者其实应该是医生，而不是病人或家属，稍微复杂一点无所谓。但如果我花了1万多块钱，我还是希望能懂一些东西，不是么？何况，万一医生也搞不懂呢?

基因测序结果怎么读？现在很多公司推广基因测序来进行癌症风险评估，或者筛查。下面是一位mm花6千元买来的“女性癌症风险评估套餐”结果。

该套餐测了20个和乳腺癌、卵巢癌相关的基因，结果测出了p53这个著名癌症相关基因突变，具体是p.Pro72Arg：说明这个基因第72位的氨基酸由脯氨酸（Pro）变成了精氨酸（Arg）。p53可是和癌症相关最重要基因之一。这下把mm吓坏了。

这突变是啥意思？mm心想先看看结果解释吧。不看不要紧，看完更晕，第3条说：“Pro72Arg与乳腺癌风险具有显著相关性”，第4条说：“Pro72Arg与乳腺癌患病风险无关”。

这不是自相矛盾么？有风险还是没风险？

mm打电话去给客服，客服说：“抱歉，我也看不懂。”

菠萝拿到后，一时也不确定，去做了好一会儿功课。最后解读了三点（前方高能预警：此处开始有大量专业词汇，只是为了严谨，读者可以跳过，直达下一部分）：

1：Pro72Arg根本就不算是突变，而是自然发生的“基因单核苷酸多态性（SNP）”。这个多态性，简单来说，就是指正常人群之中，有些人p53基因第72位是脯氨酸，有些人是精氨酸，但重要的是，无论哪种，都是正常蛋白，不是突变蛋白！这就像有些人是A血型，有些是B血型，虽然不同，但都是健康的。

2：报告里面的第3条和第4条显然是互相矛盾的，这说明研究论文里对Pro72Arg到底是否增加癌症风险没有定论。

基因相关研究中这类矛盾的结果非常多！那怎么判断哪边观点比较靠谱？

最安全的办法当然是去读那些论文。但如果读不懂呢？那就看文章发表时间！比如这里，说Pro72Arg增加癌症风险的文章大多发表在2005年之前，而说它没有增加风险的文章则是最近10年的[1]。

请注意，一般来说，如果新旧研究论文水平类似，而且结论相反的话，菠萝会选择相信新文章！

原因有二，首先科学是不断进步的，新的知识和技术往往让研究更全面、完善、准确；另外新文章在发表之前，要经过专家审稿。如果新文章结论和以往的相反，作者必须提供大量证据来说服专业审稿人。新文章得以发表，说明专业人士认可新的研究结论，而旧的结论不准确。

3：即使相信Pro72Arg增加癌症风险，这位mm也是很安全的，因为她是杂合子，而不是纯合子。生物学上，人是二倍体，每一种基因都有两份，一份来自爸爸，一份来自妈妈。 p53基因也是一样，如果两个p53基因第72位都是都是脯氨酸，那就是脯氨酸纯合子，如果都是精氨酸，则是精氨酸纯合子。而这位mm是杂合子，说明她的爸妈给了俩不同的p53。提出Pro72Arg增加乳腺癌风险的旧文章，说的是精氨酸纯合子的患癌风险，比杂合子或脯氨酸纯合子略高[2]。没有任何文章说杂合子会增加癌症风险。

综合上面三点，我告诉这位mm：“放心，没事。”

基因测序公司的咨询师应该做的事情，我代劳了。

靠谱的基因测序咨询师在哪里？既然测序结果的解读如此重要，基因测序公司为什么不多雇一些专业人士做咨询师呢？

我能想到的有俩原因：第一，顾客群没有强烈要求，没必要去自我折腾，增加成本；第二，找不到合适的人；其中后者可能是主要原因：

1、中国目前没有基因咨询师这个专业，也没地方考证，公司不知道应该找什么样的人。

2、基因咨询基本就是接电话，感觉和淘宝客服很像，不符合科学家追求自由和清高的天性。

3、国内基因测序公司还在群雄混战阶段，大家都在专心做市场，做后台基因咨询不受重视，收入也不高，有这功夫，还不如去开Uber呢。

因此，基因测序后的咨询，现在是市场上很大的空白，但我认为同时也是很好的机会。首先做好咨询客服的测序公司很可能积攒良好口碑，占领先机，成为测序界的“海底捞”。同时，不做测序，而专注做专业基因咨询，也许有机会占领后期市场，并衍生出新产品，甚至垂直逆向整合。

21世纪什么最贵？人才！尤其是能解读基因奥秘的人才。

所以，请珍惜你身边每一位学生物的同学吧！各位看官请记得分享这篇文章，让更多人了解基因测序的小小奥秘。

如果你或者身边的朋友有基因测序咨询方面的问题，不妨把报告结果给菠萝丢过来看看：pineapple.onc@outlook.com

健康君编辑 | miffyyz

参考文献：

1： TP53 mutations in human cancers: origins, consequences, and clinical use.Cold Spring Harb Perspect Biol. 2010 Jan;2(1):a001008.

2：Role of a p53 polymorphism in the development of human papillomavirus-associated cancer.Nature. 1998 May 21;393(6682):229-34.

关于本文

封面和文内图片由作者提供。

本文作者菠萝，清华大学生物系本科，美国杜克大学癌症生物学博士，现在美国加州从事癌症新药开发，著有科普书籍《癌症.真相》。

本文文字为作者原创，授权发表于“健康不是闹着玩儿”微信公众号，任何其他媒体（包括线上线下平台和公众号等）申请转载，需联系“健康不是闹着玩儿”，联系邮箱：hi@jiankangkp.com

关于“健康不是闹着玩儿”

“健康不是闹着玩儿”：顶尖名校毕业的生物医学博士们，明明白白地把健康和疾病讲给您听。

关注我们，第一时间知道健康流言真假！

有问题，想加入我们，请联系：hi@jiankangkp.com

关注原创健康科普：长按二维码，或者请加 “jiankangkp”或者“健康不是闹着玩儿”。