除了BRCA1/2，乳腺癌还有哪些常见突变？

7月27日，美国临床化学学会年会上，来自巴西Hermes Pardini研究所的研究人员展示了他们的最新研究。Giovana Torrezan及同事对12名没有携带BRCA1/2突变的乳腺癌病人进行基因筛查，以期发现其他乳腺癌相关的突变。在此项筛查中，他们发现了8个意义不明的突变。研究人员对这些突变进行二次检测，认为一些突变被归类为良性，而其他的则为可能致病突变。

乳腺癌是最常见的女性肿瘤，大约有5%-10%的肿瘤具有遗传性。而在近一半的遗传性乳腺癌中，患者都携带有BRCA1/2基因突变。同时，其他类型的基因突变也与患病风险有关，这对乳腺癌的诊断是一个挑战。Torrezan和她的同事开发了一个基于二代测序的检测panel——BCP2（Breast Cancer Panel 2），能对15个基因进行检测，其中包括ATM, CHEK2, PTEN, RAD50, TP53等基因。

2014年1月，研究人员就曾使用BCP2对12名没有BRCA1/2突变的患者进行了筛查。研究人员抽提患者的外周血从中获得DNA样本，随后使用Thermo Fisher 的Ion PGM测序仪进行测序，并使用Sanger测序进行验证。研究人员通过文献检索对这些突变可能的意义进行了报告，将这些突变分为3类：1、阳性结果：已知致病突变（发生在BRCA1/2上的突变 ）；2、意义不明的突变（除BRCA1/2以外的基因突变）；3、阴性结果：既不属于已知致病突变，也不属于意义不明的突变。

最新的这项研究中，12位接受筛查的病人中有4位没有发现临床突变，在另外8名患者中，1位患者检测到未知意义的临床突变，4位患者的ATM基因发现意义不明的突变，3位患者的PALB2基因发现意义不明的突变。研究人员认为，检测结果显示为阴性的患者也可能携带有未检测到的基因突变。

一些意义不明的突变是新被发现的错义突变或低频错义突变。Torrezan表示，在她准备演讲稿时，对这些突变进行了重新检索，发现一些意义不明的突变在数据库里的标注发生了改变。例如，PALB2和CHEK2的未知意义的突变被分别重新分类为良性和致病突变。这说明要想了解这些突变的意义，生物信息分析工具要跟上数据库更新以及对不同突变功能研究的步伐。