PertDiffBench：单细胞扰动响应预测中扩散模型的基准评测

事件概述

相关报道显示，研究提出PertDiffBench这一标准化基准，用于在单细胞与bulk RNA测序数据上评估扩散模型在转录组扰动响应预测中的表现，涵盖常规预测、对未知细胞类型/物种/药物/时间点的泛化，以及对特征维度、输入表示、噪声类型和基因顺序的压力测试。结果显示扩散模型整体未呈现稳定优势：scGen在常见任务中仍是强基线，scDiffusion在部分泛化场景更具竞争力，直接在表达空间运行的简单DDPM在时间插补任务中优于更专门模型，且性能对表示选。

从行业视角看，该事项可作为观察体外诊断相关技术、产品或市场变化的线索，实际价值取决于其落地进展。

产业观察

新品和获批信息有助于观察企业在检测项目、方法学和应用场景上的布局变化。

文章来源

https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.13.732013v1