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用全自动测序技术重新定义病原体检测的边界

2025-5-7 15:34| 编辑: 归去来兮| 查看: 154| 评论: 0|来源: 我是建设者

摘要: 或许将重新定义精准感染管理的未来。

国内媒体还没有太多报道过Clear Labs这家公司,这是一家以全自动NGS平台为核心的美国公司。全自动、端到端、病原体检测、mNGS、超1.8亿美元融资...当所有这些关键词集中到一家公司身上,那么它一定值得被说道(了解)一下。



本质上,通过整合机器人技术、纳米孔测序或Illumina测序、并与云端生物信息学分析流程,Clear Labs将复杂的基因组分析流程简化为进样-出结果的一站式解决方案。

这家公司创立于2014年,当时基因组测序正处于一个关键的转折点,成本下降的速度甚至超过了摩尔定律。Clear Labs 联合创始人Sasan Amini 看到了在临床市场之外开发下一代测序技术应用的机会,在此之前他在 Illumina 的高级研究部门工作。Amini和联合创始人Ramin Khaksar教授看到了NGS在食品安全领域的应用机会,希望通过创新NGS技术应用以帮助食品品牌减少召回,并降低食源性疾病和疫情的发生。因此,Clear Labs 应运而生。

回顾Clear Labs过去十年的成长史,可以看出其发展经历了三次关键转型。

自创立至新冠疫情前,Clear Labs基本上都是在做技术跨界,将NGS从科研仪器改造为食品行业标准化工具,通过自动化降低操作门槛,用检测+数据服务绑定客户。在这个过程中,它创建了全球最大的分子食物数据库,发布了用于食品安全市场的多个产品,包括Clear Safety这款用于常规病原体检测的自动化食品安全平台,旗下的沙门氏菌检测和李斯特菌检测均获得AOAC认证(Clear Safety沙门氏菌后续也获得批准用于检测家禽和家禽加工环境中的沙门氏菌)。在此过程中,Clear Labs  Oxford Nanopore建立了分销合作伙伴关系,利用纳米孔长读技术提供全面集成的样本洞察解决方案。在全球食品安全领域,随着NGS 技术的需求不断增长,Clear Labs 的客户也遍布了几大洲。

在新冠疫情的背景下,Clear Labs也抓住公共卫生实验室的紧急需求,将其技术快速适配至新冠病毒监测,证明测序技术可规模化应用于突发公共卫生事件。20209月,FDA授予其Clear Dx SARS-CoV-2新型描述性诊断试剂盒的紧急使用授权 (EUA)2021年初,Clear Labs又推出了全新的快速 WGS 工作流程可以实时识别SARS-CoV-2 变异以及未来的突变。Clear Labs 是唯一一家提供用于交钥匙诊断的全自动NGS平台的供应商。2022年底,Clear Labs  Illumina 建立分销合作伙伴关系,将SBS测序技术纳入其完全集成的平台。

2023年至今,Clear Labs处于临床破局的阶段,它瞄准医院感染防控的空白,推出感染源追踪、耐药基因分析功能,并通过与FDA合作进入监管通道,为未来临床诊断许可铺路。

从食品安全检测起家,到疫情期间转向COVID-19监测,再到如今进军临床感染防控市场,Clear Labs通过整合的自动化与云端分析致力于降低测序门槛、剥离技术复杂性,让基因组学技术从实验室走向产业一线,希望真正实现测序的民主化。

无论是食品行业还是医疗卫生领域,传统检测有三大痛点:成本高、耗时长、依赖专家。传统PCR检测仅能提供是否存在病原体的二元答案,假阳性/假阴性率高;全基因组测序(WGS)虽精准,但需纯培养样本、流程复杂且成本高昂。而Clear Labs的解决方案可以说是直击这些痛点。

其全自动化平台Clear Dx整合了DNA提取、文库制备、测序(支持IlluminaOxford Nanopore设备)及云端分析,30分钟手动操作即可启动,10-24小时输出结果。单次运行可处理12个样本,覆盖沙门氏菌、李斯特菌等食源性病原体,以及新冠病毒、抗生素耐药基因等临床靶标。最终检测成本基本与PCR持平(约170-200美元/样本),但准确率大大提升(>99.9%)。

从早期产品Clear Safety帮助食品厂商快速筛查污染物、追溯污染源,到新冠期间美国60%的公共卫生实验室采用其系统进行COVID-19监测,再到现在主力医院内病原体传播链追踪、耐药基因监测、实现精准防控,Clear LabsNGS的应用场景不断进行了拓展。

这也使得Clear Labs成为资本的宠儿,其融资史堪称NGS技术商业化的教科书案例。

  • 2014-2018年(早期):累计融资4500万美元,主攻食品安全检测市场。

  • 2020年(疫情转折点):获得1800万美元战略融资,快速推出COVID-19纳米孔测序检测系统,获FDA紧急使用授权。

  • 2021-2025年(爆发期):C6000万美元、D3000万美元,引入摩根士丹利、T. Rowe PriceCounterpoint等机构,估值跃升,瞄准潜在市场更大的临床检测、医疗监测领域。

Clear Labs十年间累计融资超1.8亿美元,投资方涵盖Khosla VenturesGVGoogle风投)、腾讯、RedmileIllumina前高管等等,凸显技术认可度与临床化转型的决心。

Clear Labs交钥匙NGS 平台完全自动化了整个测序工作流程(包括将 DNA 测序数据转化为基因组洞察的过程),这为 NGS 检测的速度、效率和简便性树立了新标杆,同时降低了成本、提高了准确率,让更多机构能够获得高质量的诊断服务,具有改善医疗保健结果的潜力。Clear Labs在美国拥有重要的业务,正在逐渐向包括欧洲和拉丁美洲在内的新地区进行国际扩张。

Clear Labs的这一故事可能带给行业几个启示。

一是技术产品化的能力很重要。不管是说全自动化、无人值守,还是说端到端、交钥匙,如何将前沿技术封装为标准化、易操作的产品,这可能是攻克B端市场的关键。通过提供稳定一致、操作容易上手、结果容易解读的产品来实现价值的最大化。这背后可以是生态合作、技术整合,就像Clear LabsIlluminaOxford Nanopore等上游厂商的OEM合作,通过整合技术也快速整合了行业资源。

二是跨界思维不容小觑。食品安全公共卫生临床医疗,场景的转换,相同的技术技术复用,结果是撬动了更大的市场。相比在一个市场内暗无天日地竞争,适当地转换场景,可能会有不一样的技术或认知优势。

还有就是,从检测工具智能防控网络Clear Labs的野心已经不仅仅是卖设备卖解决方案,而是要成为病原体数据的核心枢纽。在微生物耐药性危机与新发传染病频发的当下,这种技术-数据-决策的闭环能力,或许将重新定义精准感染管理的未来。

参考:

https://www.clearlabs.com/company/

https://www.genomeweb.com/sequencing/clear-labs-expand-foothold-sequencing-based-pathogen-testing


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