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恒温+CRISPR,或将重构病原体分子诊断市场

2025-4-29 14:41| 编辑: 归去来兮| 查看: 87| 评论: 0|来源: IVD工具人

摘要: 从使用场景的可能性来判断,恒温+CRISPR的应用占比将会远超PCR。

作者:IVD章北海

分子检测市场


据头豹研究院的数据显示,2024年国内分子诊断总体市场规模已经达到277亿,增速24%,分子检测是当前IVD细分领域增速最高的市场。

随着病原体检测市场的不断扩容,分子诊断市场在自动化,快速检测两个方面取得了跨越式的发展。分子诊断从过去的环节自动化进化到全流程自动化,检测时间从2-3个小时缩短到30分钟左右。自动化、全流程化、快速检测、正是当下分子诊断试剂的发展趋势。

目前市面上的分子检测产品,大多数都是经典的PCR检测产品,检测系统复杂,设备成本过高,限制了其在基层单位和现场环境的使用。

恒温核酸检测无需升降温,检测设备相比PCR便宜、简单、使用场景更为广泛,一直在农业,畜牧业,宠物检测等多个应用领域广受欢迎。但是恒温扩增的特异性一直被行业诟病。一个技术的发展和应用,往往不是恒速发展,而是跳跃式的。

2012年,CRISPR基因编辑技术面世,恒温检测迎来真正被大规模应用的机会。

预扩增+CRISPR的检测灵敏度

早期的恒温检测技术由于技术本身的限制,容易出现假阳性。CRISPR技术横空出世之后,业内尝试采用恒温扩增方法进行预扩增+CRISPR切割放大的方法提升检测体系的灵敏度和特异性。没想到,结果出乎意料的好,检测灵敏度甚至到了单拷贝级别。

目前应用广泛的分子预扩增体系,包含聚合酶链反应(PCR)、环介导等温扩增(LAMP)、重组酶聚合酶扩增(RPA)、核酸依赖扩增技术(NASBA)、链置换扩增(SDA)和指数扩增反应(EXPAR)等。

下表中罗列了部分已报道的CRISPR检测与不同预扩增方式联用的相关参数及灵敏度。


恒温扩增+CRISPR的应用

鉴于预扩增+CRISPR检测体系在使用应用场景中展现出的高灵敏度和特异度,以及恒温系统在检测方面的低成本,易普及,好操作的特点,国际大厂纷纷布局相关的恒温检测专利和应用。可以预见的是,未来分子病原体检测,恒温扩增+CRISPR必有一席之地。

体外诊断一哥,罗氏,也已经布局CRIPSR,就其最新公布的专利WO2025036740A1,可以看到将PCR与CRISPR组合起来后,实现了单个DNA分子的超高灵敏度检测。

在应用端,也已经有公司在积极布局。FDA近期授予分子诊断公司intellliGenome的CRISPR-TB血液检测系统“突破性医疗器械认定“,它可通过人血清或者EDTA血浆样本中的cfDNA检测结核分歧杆菌。该检测系统单台设备成本700美金,单次检测成本为2.7美金,结核检测的灵敏度高达81%,比X-PERT 68%的检测灵敏度高出13个百分点,更是远远高于结核培养55%的灵敏度,同时特异性达到94%,已经达到WHO关于非痰液样本TPP的质量标准,在实际的临床检测中,显示出极高的应用价值。

恒温检测系统在CRISPR的加持之下,同时具备了高灵敏度,高特异性,设备和试剂成本低廉,检测时间快等多项优点。因此,未来的病原体核酸检测市场,PCR一定会受到恒温+CRISPR的强烈冲击。


国内相关市场布局

国内目前在恒温+CRISPR应用布局的厂家相对较少,伯杰医疗是其中最为知名的一家。早在2021年,伯杰医疗就已获批国内首个RPA+CRISPR双技术平台NOVA-X8检测系统。

X-8采用经典的磁珠法进行核酸提取,RPA+CRISPR的双系统进行核酸信号的放大和处理,具有超高检测灵敏度和特异性。根据报道,X8平台的新冠检测试剂临床灵敏度为97.77%,临床特异性为100.00%,总体符合率达到了98.89%。

这还仅仅是四年前的初代试剂,现在又过去这么久了。很难想象恒温+CRISPR已经到什么阶段了。


冲击PCR检测市场?

恒温扩增试剂上下游产业链已逐步成熟,随着未来恒温扩增核心专利的过期,恒温检测+CRISPR一定会在更多领域展现得天独厚的优势。快速,灵敏,特异,耗时短,便宜,兼容后端多种判读方式,多重优势集一身。

在现场检测,大规模筛查,偏远地区检测,国际欠发达地区的病原体检测上,其应用优势非常突出。从使用场景的可能性来判断,恒温+CRISPR的应用占比将会远超PCR。

参考文献:

1、KAMINSKI M M, ABUDAYYEH O O, GOOTENBERG J S, et al. CRISPR-based diagnostics [J]. Nat Med, 24(6): 702.

2、Sci. Transl. Med.17,eadp6411(2025).DOI:10.1126/scitranslmed.adp6411

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