灵敏度可达1ppm，超灵敏液体活检平台牛！

NeXT Personal技术以全基因组数据为基础，结合了超深度测序与噪声抑制算法，将循环肿瘤DNA (ctDNA) 检测的灵敏度提升至1–3 ppm。NeXT Personal平台通过对患者肿瘤和匹配的正常组织进行全基因组测序，识别出约1800个信噪比最高的突变位点，据此设计个性化的检测探针，并从血浆中检测ctDNA。使用面板进行基因组靶富集，然后进行超深度测序。NeXT Personal随后收集来自体细胞目标的肿瘤来源信号。该过程与噪声抑制方法相结合，使NeXT Personal能够实现用于疾病分层、治疗监测和MRD检测的超灵敏ctDNA检测（图a）。

作者使用NeXT Personal分析了171例TRACERx患者手术切除肺癌前收集的血浆样本，包括94例LUAD患者（29.8%为I期，30.9%为II期，39.3%为III期）和77例非LUAD患者（28.6%为I期，40.3%为II期，31.2%为III期）。NeXT Personal面板设计中纳入了中位数1,800个特异性体细胞变异，其中97.83%来自非编码区，预测定制面板的LOD中值为1.33 ppm。中位数DNA输入量为23.5 ng。

81%的LUAD患者（图c）和100%的非LUAD非小细胞肺癌患者（图d）术前血浆样本中检测到ctDNA（1.66-253,826 ppm）。在57%的pTNM I期LUAD患者的血液中检测到ctDNA，在79%的pTNM II期LUAD中被检测到。而之前的研究表明，pTNM这类肿瘤的ctDNA很难（14%）在血液样本中检测到。 

作者评估了术前ctDNA对患者分层的能力。使用术前ctDNA阴性患者与ctDNA水平低于检测中位数（ctDNA低）和高于检测中位数（ctDNA高）的患者进行比较。结果显示，与ctDNA低的患者和ctDNA高患者相比，术前ctDNA阴性的患者有明显改善的OS。ctDNA水平低于80 ppm的存在仍然是不良OS的预后(图b)。这表明，在低于80 ppm的肿瘤分数下，此超高灵敏度检测方法可以识别一组极低风险的LUAD患者。

与LUAD患者相比，非LUAD患者的预后与术前ctDNA水平升高之间的相关性大大降低；ctDNA水平对非LUAD患者的临床结果没有明显的影响。这突出了非LUAD与LUAD中ctDNA与疾病生物学之间的根本不同的关系。

NeXT Personal是一种基于全基因组的肿瘤信息平台，能够可靠地检测血液中1-3 ppm（0.0001-0.0003%肿瘤分数）的ctDNA。这种超高灵敏度可以达到99.9%的特异性，且可以应用于次优DNA输入量。通过对来自TRACERx研究的171例早期肺癌患者的分析，此方法在81%的肺腺癌（LUAD）患者中术前检测了ctDNA，其中包括53%的病理性TNM (pTNM) I期患者。在这项研究中，检测到极低水平ctDNA的患者比那些没有检测到ctDNA证据的患者的临床结果更差。这表明，有一小部分极低风险的LUAD患者只能通过使用超灵敏的ctDNA检测来明确识别，这提高了超灵敏和特异性检测的潜力，可用于预测显示ctDNA释放的I期LUAD的治疗升级。NeXT Personal检测的高灵敏度还表明，在追踪治疗反应和检测复发的最小残留疾病场景中，具有显著的临床益处。

这项工作也有局限性。采用盲法对TRACERx数据进行回顾性分析。未来需要来自前瞻性队列的数据来评估该检测的临床应用。虽然NeXT Personal已经作为临床诊断测试使用，但与其他肿瘤信息ctDNA检测方法一样，它具有更高的复杂性，生产成本更高，并且与非肿瘤信息方法相比，需要更长的周转时间来开发面板并获得临床可操作的结果。