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IVD前沿丨NGS检测可以拯救几代人的生命!

2024-7-8 18:00| 编辑: 归去来兮| 查看: 467| 评论: 0|来源: 基因talks

摘要: NGS正在为肿瘤精准医疗铺平道路!


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NGS正在为肿瘤精准医疗铺平道路!

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在这个医疗科技日新月异的时代,每一个微小的进步都可能成为拯救生命的钥匙。


NGS,即二代测序,可大规模平行测序DNA/RNA,现已广泛应用于肿瘤细胞衍生的DNA/RNA检测。随着测序成本的下降和临床可及性的提高,NGS技术已无缝融入到肿瘤诊疗的常规流程之中。


近日,《临床肿瘤学杂志·精准肿瘤学》(JCO Precis Oncol发表了一篇Case Report,对一例晚期前列腺癌男性患者的NGS检测应用和家系分析做了详细报道,表明NGS检测可以拯救几代人的生命。1


▲ NGS检测可以拯救几代人的生命


01

前列腺癌

不容忽视的男性健康杀手




前列腺癌(PCa)是威胁男性健康的重大隐患,仅在美国,每年就有数十万新增病例。尽管局部性前列腺癌的治愈率极高,但一旦进入转移性阶段,治疗难度和生存挑战便大幅增加。而BRCA1/2基因的突变,更是早期侵袭性前列腺癌的罪魁祸首,其中BRCA2更为常见。


既往研究显示,约1.2%的前列腺癌患者中携带BRCA2胚系突变,也就是家族遗传下来的BRCA2突变。如果携带BRCA2胚系突变,到65岁时罹患前列腺癌风险增加8.6倍,绝对风险约为15%;到80岁时罹患前列腺癌的风险为20%~60%。因此,尽早识别家族遗传因素对于确定治疗方案和患者总生存率非常重要,尤其是对于转移性或淋巴结阳性的前列腺癌患者。


▲ BRCA1/2基因突变罹患前列腺癌的风险


02

NGS检测

精准医疗的先锋




面对这一挑战,NGS(Next-Generation Sequencing,即二代测序)作为现代分子生物学领域的一项重大飞跃,凭借其“无与伦比的精准度和“前所未有的全面性,正重塑着肿瘤学诊断与治疗的格局。这项技术不仅极大地提升了我们对肿瘤基因变异、遗传机制及生物标志物理解的深度与广度,还为实现肿瘤的精准治疗及预后评估开辟了全新的路径。


NGS技术可同时检测多个癌症相关基因,能够在短时间内揭示肿瘤基因组的复杂景观,包括点突变、插入缺失、基因重排/融合及拷贝数变异等多种类型的变异。其检测样本类型包括活检或手术的组织样本,也可在组织样本不足或无法提供的情况下,检测血液中的ctDNA。


NGS检测有三种策略,包括NGS panel、WES和WGS,策略的选择取决于临床的用途和可用的资金。


当前,NGS已成为前列腺癌治疗领域的“超级侦探”。


▲ NGS指导肿瘤的个体化治疗


03

案例报道

从绝望到希望的转变




近日,《JCO Precis Oncol》分享了一个关于NGS检测如何改写一位85岁前列腺癌患者及其家庭命运的感动故事。


故事的主人公是一位85岁的老先生,因前列腺特异性抗原(PSA)的显著异常升高而进一步确诊为晚期转移性前列腺癌,随后踏入了医院的肿瘤内科。他有慢性免疫性血小板减少症和基底细胞癌的病史。家族中唯一值得注意的是父亲患有头颈癌。


考虑到转移性的疾病,在医生的建议下,患者接受了血液ctDNA-NGS检测(Guardant360),以期指导针对性的靶向治疗。


Guardant360是一款基于NGS平台的血液ctDNA检测产品,评估83个基因,包括bTMB,MSI,HRR基因集和NTRK基因融合等。该检测可提示体系变异和部分胚系变异信息,如高度怀疑是胚系变异,可在适当临床情况下考虑进行确认性检测。


Guardant360 ctDNA-NGS检测分析显示:BRCA2基因S1982fs突变突变频率48.7%),其他生物标志物(包括bTMB或MSI)要么无法评估,要么未检测到。这一发现不仅对他的治疗计划至关重要,更意外地揭示了家族中潜藏的癌症风险。


医生迅速制定了以雄激素剥夺疗法(ADT)为核心的治疗方案,并辅以地诺单抗预防骨骼相关事件。如果ADT治疗未达预期,医生已准备好采用PARP抑制剂与ADT相结合的先进疗法。这种基于基因检测结果的个性化治疗方案,正逐步成为癌症治疗的新趋势。


考虑到BRCA2基因S1982fs突变频率接近50%,高度怀疑可能是胚系来源。随后医生为了确认是胚系突变还是体系突变,进行了胚系BRCA1/2基因检测(Invitae BRCA1/2)。


Invitae BRCA1/2是一款基于NGS平台的BRCA1/2胚系基因检测产品,包括BRCA1/2基因全外显子及外显子两侧10-20bp内含子序列。该产品不适用于肿瘤组织中的体系突变检测。


Invitae BRCA1/2-NGS检测分析显示:BRCA2基因11号外显子发生胚系c.584del杂合突变p.Ser1982Argfs*22),与Guardant360检测结果一致。该变异是致病性的,会致使BRCA2基因产生过早的蛋白翻译终止信号,进而导至蛋白质产物缺失或紊乱。于是,医生建议对患者及其家人进行广泛的遗传咨询。


进一步的家系检测发现,患者50多岁的女儿同样携带这一BRCA2突变,随后在及时的乳腺x线检查中被诊断为乳腺癌,并立即开始治疗。


试想,如果没有这次NGS检测的契机,这一威胁可能继续隐藏在家族中,悄无声息地影响着几代人的健康。目前尚不清楚其他家庭成员是否也接受了胚系基因检测。


04

基因检测的力量

超越治疗的本身




这个故事不仅仅是一个关于精准治疗的案例,更是对基因检测重要性的深刻诠释。基于NGS检测的结果,医生为患者量身定制了治疗方案,从ADT到联合TKI,每一步都充满了科技与关怀的力量。更重要的是,这一发现也让患者的家族成员有机会接受基因检测,提前预防或干预,避免了悲剧的重演,可以说拯救了几代人的生命。


随着医学研究的深入,国内外不断发布新的胚系基因检测指南,特别是针对乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌和前列腺癌等常见肿瘤。这一变化,正是基于对基因在癌症发生发展中重要作用的认识不断加深。


NGS检测不仅仅是一项医学技术,它更是连接患者、家庭与医生的桥梁,传递着爱与希望的火种。它让我们相信,通过科技的力量,我们可以更好地守护每一个生命,让健康与幸福成为每个人生活的常态。


让我们共同期待,更多生命的奇迹在NGS这里诞生!





当然,我们知道,现在很多基因检测公司都会同时做胚系对照分析(tumor-normal),也就是可以同时兼顾靶向治疗和遗传分析。但是,当前肿瘤基因检测市场“混乱”,由之前的重视质量慢慢演变成看重价格,低廉的结算价格导至很多公司可能不会再去做胚系对照检测分析了(tumor only,仅通过数据库过滤),因为胚系检测也需要成本。如此,临床在选择基因检测产品的时候还是最好提前确认下产品的检测内容,是否包含遗传分析部分(是否送对照样本)。





参考资料: 

1.Mahdi, Taha,Berkeley, Sirmans,Kayla, Haines et al. Next-Generation Sequencing Testing Can Save Generations of Lives.[J] .JCO Precis Oncol, 2024, 8: 0.

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