技术原理及研究路径 本技术将内标(IS)加入到样本核酸中并进行mNGS检测。通过分析软件将IS结果生成微生物拷贝数定量回归曲线,再通过定量曲线计算样本中微生物的拷贝数。本研究以ddPCR结果为标准,评估KingCreate-Quantification system(KCQ)的准确性、稳定性和临床应用可行性。 研究结果 l 定量准确 本研究以ATCC标准品MSA-4000作为参考品,对KCQ的定量准确性进行测试。结果发现KCQ定量准确性高,对IS投入量的兼容性好。 l 宿主影响低 mNGS易受到宿主核酸背景的影响,本研究通过模拟高宿主背景(85~95%)和低宿主背景(5-15%)评估KCQ的稳定性。结果显示KCQ在高宿主背景和低宿主背景样本中均能准确定量。 l 不同数据量兼容性好 本研究评估了1~50M Reads下KCQ的稳定性,结果显示不同数据量下KCQ定量结果无显著的差异。 l ddPCR临床比对无显著差异 为确定临床样本中合适的内标投入量,本研究对0.2µL-30µL的IS投入量进行了梯度测试,结果表明投入量若大于4µL则会抢占微生物测序数据量,投入量若低于2µL则IS各梯度检出稳定性(Cv)较差,因此临床测试中选用2µL投入量作为标准。在临床测试中本研究评估了血液、拭子、肺泡灌洗液、脑脊液等36例临床样本,共检出477个微生物靶标,其中83个微生物靶标经过ddPCR的定量,结果显示KCQ与ddPCR的相关系数为0.97。 金圻睿微生物NGS定量技术KCQ在本研究中完成了分析性能的确认和临床小试。结果表明KCQ具有精准的定量功能和良好的稳定性,可实现对临床样本mNGS检测中微生物的准确定量。 金圻睿MetaCAPTM介绍 MetaCAP™(Metagenomics CAPture)是在常规mNGS的基础上,基于探针捕获技术全面升级的新一代病原核酸测序产品。MetaCAP™综合病原关注度及病原特性,设计重点富集3000+种病原的百万捕获探针,结合差异去宿主技术,双向富集样本中的病原体序列,在实现DNA和RNA同步检测的同时,显著提升病原体及关键耐药、毒力信息的检测灵敏度,进而实现从病原、药物等多个维度提升感染精准诊疗。 应用范围
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