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行业首家!无毒、无臭、无需避光的预混RNA建库试剂盒重磅推出! ...

2023-9-20 15:29| 编辑: 归去来兮| 查看: 1491| 评论: 0|来源: 翌圣生物

摘要: 这个毒性以及需要避光的罪魁祸首就是放线菌素D。


你在进行RNA建库时,是否遇到过这样的困扰:
  • RNA实验时,有些试剂打开一股臭味袭来,尤其是样本很多时,这酸爽简直能把人带走,让人不得不怀疑这试剂是不是有毒性;

  • 建库试剂要求避光,总不能全程黑灯熄火操作吧?

这个毒性以及需要避光的罪魁祸首就是放线菌素D。






那么,建库试剂盒中为什么要加放线菌素D呢?

相关资料显示,放线菌素D(Actinomycin D)又称更生霉素,分子中含有一个苯氧环结构,通过它连接两个等位的环状肽链。此肽链可与DNA分子的脱氧鸟嘌呤发挥特异性相互作用,使放线菌素D嵌入DNA双螺旋的小沟中,与DNA形成复合体,阻碍RNA多聚酶的功能,抑制RNA的合成,特别是mRNA的合成。通俗点来说就是,放线菌素D能抑制聚合酶在合成cDNA一链的过程中同时合成cDNA二链,这样,在二链合成时才能使用dUTP替换dTTP。放线菌素D的添加对链特异建库效果较好,能明显增加建库试剂盒的链特异性。

加了放线菌素D的建库试剂盒,能简便实验流程。链特异研究时,链特异性也大幅度提升,在RNA相关的科研上,算是核心之一了。


进口试剂商NEB公司的RNA建库试剂盒,也做了对比,含放线菌素D和不含放线菌素D,链特异性上差别很大。


图.N*公司对是否添加放线菌素D的对比实验结果

(图片来自NEB官网)


从图中可以看到,90%以上的reads都比对到了预期的正义链上,说明含放线菌素D的测序文库的链特异性良好。


但是,放线菌素D有它自身的弊端:有一定毒性,还需要避光。在目前这种预混版建库试剂盒甚至是板式建库试剂盒需求与日俱增的时代,需要避光限制了板式试剂盒的进步。

现在,再也不用担心放线菌素的问题了翌圣生物酶进化平台ZymeEditor进化了一款新型酶,该酶替换了放线菌素D的功能,且无臭无毒,还无需避光,并且链特异性上还更胜一筹,再也不用担心健康问题和避光问题了!

翌圣生物,注重客户体验,在RNA建库试剂盒的研究上,一直在不断突破。


图.翌圣RNA建库试剂盒进化轴


什么?不含放线菌素D的试剂盒性能怎么样?我们来上一波数据吧,用数据说话。


图.含放线菌素D和不含放线菌素D的试剂盒使用同一样本不同投入量的链特异性对比


使用旧版试剂盒(含放线菌素D)和新版试剂盒(不含放线菌素D)在分别投入10 ng、1 μg和4 μg进行建库时,文库产量相当。


图.含放线菌素D和不含放线菌素D的试剂盒使用同一样本不同投入量的链特异性对比


使用旧版试剂盒(含放线菌素D)和新版试剂盒(不含放线菌素D)在分别投入10 ng、1 μg和4 μg进行建库时,链特异性相当。在低投入时,新版不含放线菌素D的试剂盒链特异性更高。



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