临床上需要这样的全外显子捕获产品：SureSelect 临床研究外显子组 V4 ...

在临床检测中，我们非常担心检测所用的全外显子在致病区域没有设计探针，特别是某些基因的内含子区域，这些内含子基因变异可能会影响 RNA 剪接。

例如最近新华医院临床遗传中心余永国团队在对本中心既往 10 年遗传层面未确诊的 96 例高丙氨酸血症（HPA）患者，用二代测序筛查了 PAH 全基因（包括编码区和非编码区）的变异，发现了多个位于深部内含子的变异。

然后对可疑变异进行体外 minigene 验证，明确了 12 种位于 PAH 基因深部内含子的致病变异，进一步提高了 PAH 基因的突变检出率，将本中心 HPA 患者的遗传检出率从 95.3% 提高到 99.3%^[1]。

而 SureSelect 临床研究外显子组 V4 在查询了权威数据库后，额外增加了 ClinVar、HGMD 及 ACMG secondary findings 的 73 个相关基因非编码区变异，配合内含子筛选生信分析流程，相比常规全外显子可以有效提高相关遗传病的阳性检出率。

全外显子相比全基因组来说，其中一个短板是不能明确大片段 CNV 的断裂点，特别是一些多见的遗传病，比如杜氏肌营养不良症，马凡氏综合症，肌肉萎缩症，Ehlers-Danlos 综合征，Charcot-Marie-Tooth 病，Von Hippel-Lindau 综合征，威尔逊氏症，多发性内分泌，腺瘤病 (MEN) 视网膜母细胞瘤，早衰症，Fanconi 贫血，先天性膈疝，儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速等。

就拿 DMD 基因来说，三分之二的致病变异来自缺失与重复，所以外显子水平的 CNV 检测就需要特别被关注，而全基因组除了依靠测序深度来判断缺失重复之外，还可以依赖断裂 reads 和配对距离异常的 reads 来判断，并且可以直接找到断裂点^[2]，SureSelect 临床研究外显子组 V4 针对 41 个经常发现大片段 CNV 的基因设计了几乎完全覆盖整个基因区域（包括内含子区域）的探针，能够实现与全基因组相同的检测效能。

SureSelect CRE V4 对小型基因组的覆盖能够提升重要罕见病相关的大片段致病性变异的检出

临床上线粒体 DNA （mtDNA）致病性突变已发现近百种。

2015年，美国权威机构——美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）编写和发布了《ACMG遗传变异分类标准与指南》。核基因组（nDNA）上变异分类可通过该指南进行，然而线粒体基因组（mDNA）变异分类仍存在较大困难（因为线粒体基因组有很多不同于核基因组的特点：母系遗传，mtDNA的多拷贝性，变异存在异质性，组织分布差异，阈值效应，随机分离等）。

2020 年，包括 Lee-Jun C. Wong 在内的多位专家在遗传学权威杂志《Genetic in Medicine》^[3]和《Human Mutation》^[4]发表了线粒体基因组变异的分类标准。在临床上线粒体突变导至的疾病临床表型多样，不能忽视对线粒体 DNA 的检测，SureSelect 临床研究外显子组 V4 全面覆盖所有 37 个线粒体基因，不遗漏线粒体突变。

SureSelect CRE V4 对线粒体基因组等的覆盖

SureSelect 临床研究外显子组 V4 由安捷伦与世界知名临床分子遗传学家、美国埃默里遗传学实验室前执行主任 Madhuri Hegde 博士及其团队合作开发，是专业医学洞见和安捷伦十余年捕获探针合成经验的完美结合；2016 年推出的 CRE V2 在就是当时临床研究中覆盖最为全面的人全外显子组产品，CRE V4 则在 CRE V2 基础上结合最新临床需求，进一步在基因内容选择、探针合成与铺设、NGS 湿实验流程、实验室自动化等层面进行了更迭与创新，更加适用于遗传性疾病临床研究。