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深度测序表明BRCA1和 BRCA2并不是乳腺癌检测金标准

2014-9-17 18:04| 编辑: 小桔灯网| 查看: 958| 评论: 0|来源: 测序中国

摘要: Myriad 遗传学实验室利用新一代测序技术在遗传性乳腺癌研究中发现了除常见的BRCA1和BRCA2基因外的其他基因。 本月,贝斯以色列女执事医疗中心Myriad实验室和哈佛医学院在Cancer上发表文章,利用新一代测序技术对1 ...

Myriad 遗传学实验室利用新一代测序技术在遗传性乳腺癌研究中发现了除常见的BRCA1和BRCA2基因外的其他基因。

本月,贝斯以色列女执事医疗中心Myriad实验室和哈佛医学院在Cancer上发表文章,利用新一代测序技术对1781位乳腺癌患者的25个基因进行测序,发现9.3%的病人发生BRCA1和BRCA2突变,4.3%的病人发生其他基因的突变。

Myriad负责临床发展的副总裁Anne-Renee Hartman认为他们的研究表明,用新一代测序进行基因检测比只针对一个基因的检测更有优势。

研究人员在两个不同的患者群体中进行基因测序。第一组包括1781名非犹太裔乳腺癌患者在Myriad实验室,进行BRCA1和BRCA2检测。第二组377名BRCA1和BRCA2阴性的患者进行基因检测。在第一组病人中,241人至少一个基因突变。165人主要是BRCA1和BRCA2突变。有76人携带至少一个BRCA1和BRCA2以外的基因。

第二组检测对象是已经被确定为非BRCA1 和BRCA2突变患者,研究人员发现2.9%病患携带其他乳腺癌和卵巢癌致病基因,0.8%病患发现其他癌症易感基因。

通过检测,研究人员发现癌症突变不一定和家族癌症病史相关。如在第一组测试中,有5个患者有Lynchs综合征(遗传性非息肉性结直肠癌综合征 )基因的突变,但他们没有卵巢癌家族史,还有1个病人有结肠癌有关的突变基因。在第二组中,有3个病人发现了黑色素瘤和结肠癌有关的突变基因。

Hartman 说,“这样的结果不是偶然,这提醒我们不同的肿瘤类型可能会有相同的突变发生。这些突变不仅对被检测的患者有意义,对患者的家庭也有也是有意义的。”

每个组里都有约41%的病患没有显著的突变,Hartman 认为这个比例如此高是符合预期的。她认为这个结果可以减少30%的预测。

科罗拉多大学儿童医院的肿瘤顾问Kami Schneider虽然没有参与这项研究,但是她表示高比例的不明变异对临应用将是障碍。“特别有高达40%的概率发现不明致病基因和13%的概率找到致病突变。”在进行BRCA1/2检测中,应有9%的概率找到一个突变,发现不明致病基因的概率只有2%。

Schneides注意到“基于二代测的癌症检测还是有很多地方不是很清楚,尤其是做癌症风险预测的时候,我们很难定义患病的概率是20%、40%还是80%。”

Hartman说,他们现在正在对一些意义不是很明确的突变进行研究,以便更好的区分它们,更深的了解基因突变对癌症影响。尽管新增加一个癌症基因预测需要进行四项研究,但还是要清楚的让病人知道他们面临着哪些风险,以及该怎样应对这些风险。公司正在考虑增加基因测序数量,开发新的基因检测,并且在未来的几个月内他们将发布结肠癌检测。



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