脑脊液mNGS的阳性报告应如何进行临床解读？

脑脊液mNGS的阳性报告应如何进行临床解读？

临床需要综合流行病学史、临床表现、影像学、脑脊液学与血清学等检查结果，对脑脊液mNGS检测报告进行解读，尽量充分利用传统的微生物鉴定方法验证mNGS结果。阳性结果解读需要关注：微生物是否具有人类神经系统侵袭性(嗜神经性)的生物学特征，患者临床表现是否和微生物的致病特性一致，报告微生物是否和其他病原学检查结果一致。

// 报告的微生物具有神经侵袭性，且与临床经验诊断相一致，可初步确定其为责任病原体。脑脊液mNGS检测到肺炎链球菌、脑膜炎奈瑟菌、单纯疱疹病毒(HSV)1型、HSV2型、水痘-带状疱疹病毒等病原体时多属于这种情况。

// 报告的微生物和传统微生物检查结果一致，表明其在样本中存在，报告微生物是责任病原体的可能性很大。

// 当脑脊液中检出非人体定植菌且环境中不常见的微生物(例如单核细胞增生性李斯特菌、猪带绦虫、广州管圆线虫、阿米巴等)时，有可能是责任病原体，因此阳性报告就应该考虑其致病可能。

// 某些微生物(例如结核分枝杆菌、诺卡菌、某些真菌)的生长特点和结构特点导至其核酸提取的难度较大，检出的特异性序列数可能少，因此，阳性报告就应该考虑其致病可能。结核分枝杆菌的特异性序列数可以低至1个；隐球菌的特异性序列数可以低至1~2个；白色念珠菌的特异性序列数可以低至6个；单核细胞增生性李斯特菌可以低至8个；诺卡菌可以低至12个。

// 部分DNA病毒可在CNS潜伏，阳性结果需要综合临床病情来判断其是潜伏感染、病毒携带状态还是活动性感染。例如：脑脊液EB病毒核酸阳性，可以见于潜伏感染、活动性感染、EB病毒相关淋巴细胞增殖性疾病以及EB病毒感染相关神经免疫性病。

// mNGS检测出阳性微生物但是传统微生物检查结果阴性时，需要根据检出微生物致病特性，结合临床综合评估其致病可能。

// 报告微生物有可能来源于环境污染或者腰椎穿刺点附近皮肤定植，不同的患者和就诊场所其微生物种类不同，临床医生可以和检测机构沟通确定各自的背景微生物，但是，在人体免疫功能受损时，某些定植微生物也可能是致病菌。

// 若同一患者的同类标本多次送检，在检测条件一致的情况下，同一种微生物序列数的变化可以辅助判断疗效。

// 对于免疫功能缺陷的患者，易发生CNS机会性感染(JC病毒、CMV、隐球菌、弓形虫等)，且临床表现不典型，要高度重视报告微生物的致病可能。