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新品上市|Takara一站式PGT-A研究解决方案

2022-12-19 16:14| 编辑: 归去来兮| 查看: 3165| 评论: 0|来源: 小桔灯网

摘要: 一时间,“辅助生殖“这个名词再次打破特定圈层,进入大众视野。


前段时间,一则“辅助生殖在杭州可报销”的新闻成为了热点议题。据浙江日报消息,明年起,参加杭州市商业补充医疗保险“西湖益联保“的居民,在2023年度实施辅助生育的参保市民,将可获得最高3000元的报销,这意味着辅助生殖费用支持政策逐渐落地。

一时间,“辅助生殖“这个名词再次打破特定圈层,进入大众视野。


01

揭秘辅助生殖

辅助生殖技术(包括人类辅助生殖技术和人类精子库)是指运用医学技术和方法对配子、合子、胚胎进行人工操作,以达到受孕目的的技术,分为人工授精技术、体外受精-胚胎移植技术及相关衍生技术【1】。其中体外受精-胚胎移植技术及其各种衍生技术(In vitro fertilization, IVF)近些年来备受关注。简单的说,就是大家耳熟能详的试管婴儿技术。

试管婴儿技术的分类

随着IVF技术的不断成熟和应用,有越来越多的不孕不育夫妇受益。其中,PGT技术被广泛应用于IVF临床妊娠率的提高、单基因病和染色体病的预防以及人类白细胞抗原(HLA)配型等医疗目的。


02

PGT-A技术

PGT的分类

染色体非整倍体是导至自然流产和IVF-胚胎移植失败的重要原因。PGT-A作为一种有效的胚胎植入前染色体筛查技术,可有效减少因植入异常胚胎而造成的反复种植失败、反复流产和出生缺陷等,减少患者身心伤害。

PGT-A技术检测方法

PGT-A技术常见的检测方法包括荧光原位杂交(FISH)技术和微阵列比较基因组杂交(aCGH)技术。随着高通量测序技术(NGS)的发展,人们将目光转向NGS方法,以期进行更正确的评估。

在生殖医学的研究领域,每一个决定可能都是推动一项实验发挥其最大潜力的机会。


03

PGT-A解决方案:

Embgenix PGT-A Kit(RUO)

Takara Bio致力于通过卓越的技术来支持生殖健康研究,提供可靠的实验结果。近期推出的Embgenix PGT-A Kit(RUO)是一款科研用途的PGT-A分析试剂盒。利用核心技术PicoPLEX进行全基因组扩增(whole genome amplification, WGA),同时整合专有的文库构建技术和定制的生物学分析软件,可以正确识别24条染色体上的染色体非整倍体情况,包括21三体综合征。此外,还可以识别节段性非整倍体(segmental aneuploidy )和嵌合体 。

产品特点

提供端到端的PGT-A分析流程

EmbgenixPGT-A Kit(RUO)可以从滋养层胚胎(TE)活检样本或gDNA起始,进行完整的PGT-A分析流程,包含全基因组扩增,文库构建以及染色体非整倍体分析。

准线性预扩增,保证扩增的均一性

由于每个细胞中的DNA非常少(皮克级),远没有达到测序所需的样品量,因此需要先对单细胞内的DNA进行WGA,而这一过程必须尽可能避免样本的损失和污染,并尽可能保证扩增的均一性等,这都是极其困难的!使用Takara Bio的核心技术PicoPLEX技术,可以对细胞裂解后获得的DNA模板使用准线性扩增方法进行预扩增,并在每个循环最后形成一个不能被进一步扩增的发夹结构,这样做的好处是有效避免PCR过程中可能引入的扩增错误无限放大,避免序列偏向性。 

删繁就简,2 h内完成Illumina文库构建

使用特别的文库构建技术及双端特殊index(UDI),简化了测序文库流程。在建库阶段(DNA片段化、末端修复、接头添加、PCR扩增和index添加) 采用单管操作、无需接头稀释且过程中无需磁珠纯化的系统,建库总时长与手动操作时间短,可以尽可能的减少样品损耗!

专门开发的软件提供PGT-A数据分析

测序后,可以使用Takara Bio专门的Embgenix Analysis Software (RUO) 进行数据分析。这个软件的算法是基于内部配置的参考基因组,采用bin counts计算CCNs(calculated copy numbers)来确定最终的CNV准确度。该软件允许用户自主选择自动还是手动设置来分析是整个染色体、还是节段非整倍体,或者是嵌合体。而且生成的数据可以在图表中可视化展示。另外,数据分析结果支持下载为PDF报告,也可以根据每个实验室需求进行定制。


数据展示

可靠的非整倍体分析

以含有Chr18三体的gDNA样品起始,使用Embgenix PGT-A Kit(RUO)制备单细胞全基因组文库,并使用Embgenix Analysis Software (RUO)进行非整倍体分析。结果显示,可以准确检测染色体非整倍体。

灵敏的节段性非整倍体分析

对22个具有节段性非整倍体的细胞系(来自Coriell Biorepository ,USA) 来源的gDNA样本,使用Embgenix PGT-A Kit(RUO)进行分析。结果显示,成功检测出所有的节段性非整倍体(CNV大小7.1 Mb至91.4 Mb),并且对于其中的20个样本,可以高准确度预测CNV大小(注:*表示CNV大小低于Embgenix分析软件可以检测的最小标准。**表示CNV在低比对区域。)


Takara Bio’s in-house verification 

Independent testing at Clinical Laboratory A

嵌合体检测

临床实验室A对两种不同染色体非整倍体gDNA样本混合制成的样本进行嵌合体研究。其中一个是Coriell gDNA样品NA05966 (Chr14三体,21.2 Mb) ,另一个是NA10925 (Chr 7单体,16.1 Mb) 的混合物。使用Embgenix PGT-A和另一种 NGS PGT-A的R技术进行分析。结果显示Embgenix PGT-A成功检测到50%和75%的gDNA混合物中代表的节段性嵌合体,而另一种R技术未检测到50%和75%的嵌合体。

对活检样本进行PGT-A分析

临床实验室B和临床实验室C独立进行PGT-A分析。

临床实验室B分别使用Embgenix PGT-A及其分析软件和V产品(含分析软件),对26个TE(trophectoderm,滋养外胚层)样本和8个gDNA样本进行PGT-A分析。结果显示,与临床确立的PGT-A NGS方法的结果一致性为91%(不一致结果的3个样本来自于相同胚胎)。临床实验室B佐证这些样本可能来自具有不同遗传含量的胚胎的一部分。

临床实验室C进行的研究中,使用Embgenix PGT-A和另一种PGT-A NGS方法及分析软件,对来自TE以及 ICM(inner cell mass)的共71个胚胎细胞样本进行分析。结果显示,临床实验室C进行的非整倍性评估显示Embgenix PGT-A分析的结果与已建立的PGT-A方法的结果一致。

下图显示了Embryo 9样本的实验数据。图B、C、D分别是使用V产品及其分析软件评估TE样本的数据,使用Embgenix PGT-A和Embgenix分析软件评估的ICM样本数据以及使用Embgenix PGT-A和Embgenix分析软件评估的TE样本数据。

下图显示了Embryo 47样本的实验数据。图A和B分别是使用已建立的NGSPGT-A方法和软件分析的TE样本数据和使用Embgenix PGT-A和Embgenix分析软件分析的TE样本数据。


04

结 语

综上所述,Takara Bio新推出的Embgenix包括PicoPLEX WGA, Illumina测序文库的制备,以及Embgenix Analysis Software数据分析模块,是PGT-A分析的完整解决方案。可以正确识别24条染色体上的染色体非整倍体情况,并可以识别节段性非整倍体和嵌合体。满足当前和未来PGT-A的临床科学研究。

参考信息及文献来源

1. 中华人民共和国国家卫生健康委员会官网


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关于Takara

Takara Bio中国有两家公司——宝生物工程(大连)有限公司和宝日医生物技术(北京)有限公司。宝生物工程(大连)有限公司是Takara Bio Inc. 在中国的生产基地,宝日医生物技术(北京)有限公司负责Takara Bio Inc.旗下所有品牌在中国市场的宣传及销售。

宝日医生物技术(北京)有限公司成立于2004年1月,公司主要销售生物工程研究用试剂和仪器(包括Takara、Clontech、Cellartis品牌),产品主要包括PCR/qPCR、基因克隆、基因功能研究、蛋白质功能研究、二代测序、干细胞研究等产品及服务,并可提供客户定制化服务。还开展以细胞治疗为中心的生物工程领域的技术开发与服务,销售细胞治疗和基因治疗相关产品。

咨询热线:4006518761,4006518769

公司官网:www.takarabiomed.com.cn

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