前列腺癌是一种常见而复杂的恶性肿瘤，严重威胁男性健康。全球范围内，前列腺癌占男性肿瘤年新发病例第二位，死亡原因第五位。初诊的前列腺癌大多对雄激素剥夺治疗（ADT）敏感，但随着病程进展，几乎都会进入预后较差的去势抵抗性前列腺癌（CRPC）阶段，尤其是转移性去势抵抗前列腺癌（mCRPC）。同源重组修复（HRR）是DNA双链断裂的重要修复途径，HRR相关基因突变会导至基因不稳定并促进肿瘤生长。研究显示，在mCRPC患者中，HRR基因突变大约占到20%-30%。既往研究提示PARP抑制剂在HRR突变的mCRPC中显示了抗肿瘤活性与安全性。 PROfound研究是第一个在前列腺癌领域利用分子分型指导靶向治疗的阳性结果Ⅲ期临床研究，不仅为PARP抑制剂在前列腺癌的治疗提供了有力的临床证据，也为前列腺癌的基因检测方法进行了全面的探索。尽管肿瘤组织样本是分子检测的金标准，但在临床诊疗中因为样本质控问题难以常规开展检测。临床上适合NGS分析的样本类型优选新鲜组织标本，也可选用FFPE样本、肿瘤细胞学样本及血浆（游离DNA/RNA）等。对于新鲜组织，可采用冷冻切片染色评估样本中的肿瘤细胞含量，对于FFPE样本，制作石蜡切片时，切取5片连续切片，其中1片进行HE染色评估肿瘤细胞的含量。除了样本组织类型，其他因素也会影响NGS结果。2022年发表在Clincal Cancer Research(IF:12.531)的一篇文章报道了PROfound研究中4000多名接受筛选的mCRPC患者肿瘤组织样本基因检测情况，讨论了真实世界中分子检测所面临的困局。
研究方法 研究纳入携带1-15个HRR基因突变、既往经二代抗雄激素药物（恩扎卢胺、阿比特龙）治疗进展的mCRPC患者。根据基因突变类型不同，分为两个队列。队列A患者至少携带BRCA1、BRCA2或ATM基因突变其中之一，队列B至少携带其他12个基因突变（BRIP1、BARD1、CDK12、CHEK1、CHEK2、FANCL、PALB2、PPP2R2A、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD54L）其中之一。 研究结果 总结 PROfoud研究表明，基因检测来识别HRR基因突变是可行的。送检的样本会经过病理评估、DNA质量评估、测序质量评估等严格的质控步骤，每一步都会有一部分样本因质控不合格而无法获得NGS结果。样本储存年限、肿瘤纯度和DNA产量是影响NGS结果的三大要素。如果有多个样本，当这些样本的肿瘤纯度相近时，则考虑选择较新鲜的样本。对于储存年限超过5年的样本，则考虑使用肿瘤纯度最高的样本，或者样本来源为淋巴结等肿瘤细胞含量较高的组织。对于新收集的样本，使用福尔马林固定和避免脱钙处理（对于骨组织样本）有助于保持核酸的完整性。高质量的肿瘤组织样本是获得NGS结果和筛选可能从奥拉帕利治疗中获益的mCRPC患者的关键。 裕策生物NGS检测质控流程 目前NGS检测的样本来源主要为组织、细胞、体液，收集的样本需经过前处理、核酸提取、核酸质控、文库构建、文库测序、数据分析等步骤。裕策生物旗下深圳裕康医学检验实验室（以下简称：裕康医学实验室）有着严格的质控标准，曾在多次室间质评中获得国际认可。 近日，裕康医学实验室病理图像判读水平获得CAP认可，为患者提供准确客观的病理诊断结果，从而使更多肿瘤患者能够获益，为精准诊疗保驾护航。
裕策生物NGS检测流程 CAP NEO-A 2022成绩单 |
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