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新闻 | 对于新冠Delta变异株,研究人员依旧知之甚少!

2021-7-9 11:01| 编辑: 归去来兮| 查看: 1644| 评论: 0|来源: 开发与验证

摘要: 图 |7月5日晚,王予波在瑞丽市主持召开疫情处置工作现场会,国家指导组组长、国家疾病预防控制局副局长孙阳,云南省副省长宗国英、李玛琳,省政府秘书长杨杰出席会议自从被称为Delta(B.1.617)的SARS-CoV-2变体去年 ...

图 | 7月5日晚,王予波在瑞丽市主持召开疫情处置工作现场会,国家指导组组长、国家疾病预防控制局副局长孙阳,云南省副省长宗国英、李玛琳,省政府秘书长杨杰出席会议


自从被称为Delta(B.1.617)的SARS-CoV-2变体去年年底在印度首次被报道以来,它已经扩散到其他几十个国家,包括美国、新加坡和英国,它在一些地区已经成为主导。


此后,研究人员确定了三种亚型,即B.1.617.1(“初始”B.1.617)、B.1.617.2和B.1.617.3,每种亚型的基因构成略有不同。


他们现在正急于调查这些变体,并研究它们可能如何对已经扩散到国家的新冠大流行产生影响。关键问题仍然是“这些变种的传播速度有多快?”、“它们逃避免疫的潜力有多大?”以及“它们是否会导至更严重的疾病?”


这项研究的很多形式是标准的流行病学研究,通过检测确认COVID-19病例,确定造成感染的变体,并将这些数据与人们的临床症状和疫苗接种情况进行交叉对比。


研究人员还可以从基因组测序数据中得到启示,确定哪些突变存在于B.1.617亚型中,并将这些突变与更早的变体中的突变进行比较,这些变体的行为被更好地理解。



传播性更强

COVID-19 Delta

研究人员对单个突变进行研究,因为它们各自都有被认为可能赋予更高的传播性的特性。传播性,用于衡量变异体在人与人之间传播速度的单位,的提高可能会加速疾病的爆发,这可能会给卫生保健系统和疫苗接种计划等应对措施带来更大的压力。


例如,B.1.617.2变体有名为452R和478K的突变,这两个突变都与传播性增加有关,它们改变了病毒用来进入人体细胞的尖峰蛋白。


研究人员还能够迅速追踪B.1.617.2的传播,因为它的基因组包含一个标记,而主导的B.1.1.7变体缺乏这个标记。


这种标记,通常被称为“S基因靶点”,的存在可以在一些用于确认COVID-19病例的PCR测试结果中看到,因此研究人员可以使用阳性的S基因靶点作为代理,快速绘制B.1.617.2的传播图,而不需要对样本进行全面测序。


S-基因测试和来自英国病毒样本的更详细的测序数据都表明,B.1.617.2正在超越其他两种B.1.617亚型,并取代B.1.1.7,2020年底在英格兰东南部发现的变体,成为该国新冠感染的最常见变体。


现在,在整个英格兰,预计50%的感染将是B.1.617.2变体,在网上分享的对英国测序数据的分析表明,B.1.617.2感染的数量每天可能比B.1.1.7感染的数量快13%。


在5月12日发表的一份报告中,一个由英国政府咨询委员会筹建,名为the Scientific Pandemic Influenza Group的模型建立小组提到,根据现有数据,B.1.617.2的传播性比B.1.1.7高50%,这是一种“现实的可能性”。


研究人员表示,50%传播性提高的预测听起来完全合理,而且随着数据的增加,这个预测将或获得越来越多的证实。

| 7月5日,瑞丽防疫人员在整理检测样本,图源:新华社




免疫逃逸

COVID-19 Delta

研究人员热衷于解决的另一个问题是,疫苗是否会对B.1.617变体保持有效。如果这些毒株中的任何一个能够逃避疫苗接种所赋予的免疫保护,或者以前接触过这种病毒,它们可能会引发新的重大感染浪潮,并破坏放松封锁和其他限制的计划。


从理论上讲,B.1.617.2在英国的加速传播,那里50%以上的人口至少接受了一剂COVID-19疫苗,可能表明有能力逃避疫苗保护。但还需要进一步的数据来证实。


5月中旬来自英格兰西北部疫情热点地区博尔顿的初步数据显示,那里因B.1.617.2引起的COVID-19而住院的大多数人没有接种过疫苗。在18个住院病人中,约有5人对该变体检测呈阳性,他们只接种了一剂疫苗,只有一人接种了两剂。


同时其他数据也显示,英格兰西北部的B.1.617.2变体感染最初集中在青少年身上,他们没有常规接种疫苗。尽管该变体随后扩散到了三十多岁和四十多岁的人身上,但那些可能接种过两剂疫苗的五十多岁的人感染率较低,这是一个比较好的消息。


基因测序数据表明,与B.1.617.1的传播相比,B.1.617.2的快速传播不太可能对疫苗接种工作构成问题。在B.1.617.2中发现的452R和478K突变都与疫苗逃逸以及传播性增加有关。


但是B.1.617.1还带有一个不同的突变,称为484Q,它与疫苗逃逸有更大的关联[1],这个突变在B.1.617.2中没有发现。


令人欣慰的是,并没有发现B.1.617变异亚型中存在增加疾病严重程度的突变。


研究人员目前正在进行实验室测试,检查抗体对不同病毒变体的中和程度。5月17日发表在Nature Medicine上的一项研究表明[2],这种测试对现实世界的免疫保护有“高度的预测性”。


其中一些实验室研究表明,疫苗对B.1.617.1亚型的效果可能较差[1],但对B.1.617.2的类似实验结果尚未公布。英格兰公共卫生局5月23日发布的数据表明,辉瑞公司和牛津-阿斯利康公司的疫苗在两剂后对B.1.617.2有效。



建立未来的新冠传播模型

COVID-19 Delta

一些关键的不确定性仍然存在,包括B.1.617.2的传播性比其他变体,如现在在英国和其他许多国家建立的B.1.1.7变体,提高了多少?到底是50%,还是10%,或者是60~70%,这个必须有一个明确的结果。


这样才能使研究人员能够建立更准确的模型,了解这些变种可能对包括英国在内的正在成为主导的国家的爆发产生的影响。提高20%和提高50%之间的差异非常巨大,一个就像温和的浪潮,而一个就像滔天巨浪,会对政府部门制定政策时产生巨大的影响。


同时,关于疫苗“有效”的结论也显得模棱两可,不够明确,这令人非常担心。因为有效性有一个范围。疫苗效力的研究往往集中在预防严重疾病和死亡的能力上。但同样重要的是要知道接种疫苗的人是否会在不生病的情况下感染B.1.617.2变体,并将其传染给他人。


但这些,目前都还不清楚,那么,疫苗是否能带来群体免疫力,还需要打个问号。


但Delta变体在英国的爆发,带来了一个深入研究的机会,继续从英国的疫情中收集流行病学数据将有助于回答这些问题。它还将有助于预测B.1.617变种在其他国家的潜在影响,特别是发展中国家,这些国家还没有广泛地获得疫苗。


参考文献

[1] Collier, D. A. et al. Nature 

https://doi.org/10.1038/s41586-021-03412-7 (2021).

[2] Khoury, D. S. et al. Nature Med. 

https://doi.org/10.1038/s41591-021-01377-8 (2021).


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