GenomeWeb专访路胜CTO和第一作者Wei Wu，揭开液体活检研究成果背后的故事

2021-6-16 09:50| 编辑: 归去来兮| 查看: 2336| 评论: 0|来源: 路胜

摘要: 近日，国际知名生物媒体GenomeWeb对路胜的首席技术官Yukti Choudhury和研究第一作者Wei Wu进行了深度采访，并报道了路胜在2021 ASCO年会公布的液体活检最新研究成果，以下文章转载自GenomeWeb。在前不久举行的美国临 ...

近日，国际知名生物媒体GenomeWeb对路胜的首席技术官Yukti Choudhury和研究第一作者Wei Wu进行了深度采访，并报道了路胜在2021 ASCO年会公布的液体活检最新研究成果，以下文章转载自GenomeWeb。

在前不久举行的美国临床肿瘤学会（ASCO）年会上，精准医学企业路胜（Lucence）及其合作方分享了两份研究摘要，详细介绍了使用 LiquidHALLMARK监测非小细胞肺癌（NSCLC）患者的治疗结果，以及在其他癌种中发现与癌症相关的生物标志物等临床应用。

路胜在ASCO年会上发表的研究摘要(#3042)，与加利福尼亚大学旧金山分校（UCSF）的Dr. Trever Bivona Lab合作完成，第一作者Wei Wu来自加州大学旧金山分校癌症基因研究组，该研究采用基于 LiquidHALLMARK的61个基因定制panel来监测NSCLC患者的疗效。

研究团队共收集了142例晚期NSCLC 亚洲患者的血液样本，88例患者（62％）接受了一次或多次治疗。该研究使用 LiquidHALLMARK 对晚期 NSCLC亚洲队列的突变情况进行了分析，并将结果与 2017年团队发表在 Nature Genetics上的白种人晚期NSCLC患者的研究数据进行了比较。

团队发现亚洲队列与白种人队列之间存在一些差异。亚洲队列中同时发生 KRAS 和 EGFR 突变（4%）的比例高于白种人队列（0.56%）。NSCLC亚洲患者的EGFR 突变频率是白人非小细胞肺癌患者的三倍。此外，亚洲队列中的 CTNNB1 和 SMAD4 突变频率低于白种人队列。

在GenomeWeb的采访中，Wei Wu表示：“我们想了解晚期肺癌在治疗过程中的演变、新突变是如何产生的，以及它与耐药性的关联，我们也尝试了解和比较白种人队列和亚洲人队列之间的基因差异以及这与治疗结果之间的关系。”

研究还发现，与治疗无应答者相比，接受一线或二线治疗的 ICI 治疗应答者表现出更高的突变等位基因频率或 MAF 分布，以及更少的突变。因此，LiquidHALLMARK可能有助于识别出与靶向治疗相关的生物标志物比例较高的肺癌患者。

基于该项研究结果，Wei Wu旨在观察患者生存状况的差异，若能够获得无病生存期或总体生存期数据的话。由于参考数据来自不同的cfDNA 诊断平台（Guardant Health 的 Guardant360 检测），Wei Wu 计划在后续研究中使用 LiquidHALLMARK 比较两个数据集。

另一篇研究摘要(#3062)中，研究人员在1338例癌症患者的血浆样本（来自肺癌，乳腺癌，结直肠癌和其他18种癌种；其中86.3％是转移性肿瘤）。该研究采用路胜的LiquidHALLMARK分析循环肿瘤DNA的基因组变化。LiquidHALLMARK涵盖了80个与特定癌症类型相关的基因，在检测单核苷酸变异和插入缺失方面，最低检测限保持在0.1%的变异等位基因频率。

路胜的首席技术官兼联合创始人 Yukti Choudhury博士在采访中表示：“很多患者用了其他检测确诊癌症，也接受了治疗，但随后出现了疾病进展。” ，“我们的液体活检不需要大量DNA材料，使用少量的血液就能完成检测，监测疾病。”

Choudhury博士指出，LiquidHALLMARK在检出对临床治疗有指导意义的突变有很高的灵敏度，75% (484) ctDNA阳性的肺癌患者有至少一个或多个与靶向治疗相关的突变。该团队还发现，近30%接受 EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)治疗的肺癌患者出现了EGFR TKI 耐药相关突变。

此外，团队在44.2％的HR +乳腺癌中检测到ESR1和/或PIK3CA突变。Choudhury博士在采访中指出这些患者可以用 alpelisib（诺华公司的 Piqray）治疗。

Choudhury博士在采访中表示：“我们对突变进行表征，以了解它们对什么药物敏感。这是液体活检的一大用处，但需要足够灵敏的检测才能发现治疗后可能出现的变化。” Choudhury博士还强调，在20例未知肿瘤原发病灶的病患中，她的团队将潜在的肿瘤来源范围缩小了。

“一些突变具有特定肿瘤类型的特征，例如，如果是特定的 KRAS 突变，我们可以将其范围缩小到胰腺癌和结肠直肠癌，”Choudhury博士解释说。“一个特定的突变能够帮助确定这个突变是来自于哪种原发肿瘤。” 因此，研究人员认为使用LiquidHALLMARK结合其他临床信息可能有助于临床医生在诊断时缩小癌症范围并促进为患者做出适当的治疗决定。

路胜的创始人兼CEO陈民汉医生在邮件采访中表示:“这些研究突出了该公司液体活检在分析肺癌突变的检测能力。公司将继续探索该检测在诊断血液癌症和微小残留病灶的性能。”

“我们还将开发用于早期癌症检测和治疗选择的新型液体活检，用测序结合细胞成像发现早期癌症，预计会从肺癌开始继而应用到其他主要癌症，如乳腺癌、结肠癌和血液癌。”

对于LiquidHALLMARK未来的发展，路胜CEO陈民汉预计在未来两年内，LiquidHALLMARK的影响力会逐步扩大到南美、亚洲、非洲和欧洲。

LiquidHALLMARK是路胜的旗舰液体活检测试，能够全面检测癌症相关生物标志物，该检测由路胜专有的扩增子NGS核心技术AmpliMark支持。LiquidHALLMARK涵盖血浆循环肿瘤DNA中的80个基因，包括10种基因融合，3种致癌病毒。在检测限为0.1％的变异等位基因频率时，LiquidHALLMARK仍然能保持> 99％的灵敏度，并且能靶向检测单核苷酸变异（包括顺反），插入和缺失，拷贝数变异，微卫星不稳定性，基因融合和病毒。

声明：

1、凡本网注明“来源：小桔灯网”的所有作品，均为本网合法拥有版权或有权使用的作品，转载需联系授权。
2、凡本网注明“来源：XXX（非小桔灯网）”的作品，均转载自其它媒体，转载目的在于传递更多信息，并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责。其版权归原作者所有，如有侵权请联系删除。
3、所有再转载者需自行获得原作者授权并注明来源。