扎克伯格背书，云平台全球追踪传染病

近日，Chan Zuckerberg Biohub（CZ Biohub）和Chan Zuckerberg Initiative（CZI）宣布启动IDseq，它是一个开源的云分析平台，有潜力改变世界范围内人们检测和应对传染病爆发的能力。在德国柏林举行的盖茨大挑战会议（Gates Grand Challenges meeting）上，Biohub的联合总裁兼加州大学旧金山分校（UCSF）的生物化学和生物物理学教授Joseph DeRisi博士宣布了这一消息。

CZ Biohub是家独立的非营利性医学研究机构，它与加州大学伯克利分校 (UC Berkeley)、斯坦福大学(Stanford University) 和UCSF有合作关系。该组织的目标是综合科学，技术和人的能力来治愈、预防或管理人们一生中的所有疾病。CZI则是Facebook创始人Mark Zuckerberg及妻子Priscilla Chan博士在2015年12月创立的慈善组织，汇集了世界一流的工程、资金、影响力、政策等资源。CZI的重点领域包括支持基础生物医学研究，以及通过个体化学习来支持教育等。

IDseq最初是DeRisi博士在UCSF实验室的一个研究项目，它能快速分析特定样本中病原体的海量基因组数据，无论样本是细菌、病毒，真菌还是寄生虫。通过识别引起疾病的病原体，IDseq可以提供具有可行性的报告，描述在世界各地的实验室和诊所中所发生的具体实际情况。“病原体不会受地理边界限制，” DeRisi博士介绍说：“在一个社区中出现的传染病可能会影响到周边的国家和地区。全球卫生界需要能够快速共享数据，用来跟踪疾病暴发或新出现疾病的情况。通过IDseq，我们希望能促进由数据驱动的决策，帮助人们更好地管理抗生素、调整免疫资源优先级，以及决定病媒控制和监测工作。”

IDseq已经在现实中证明了检测疾病的能力。在最近的一个试点项目中，孟加拉国儿童健康研究基金会的Senjuti Saha博士利用IDseq，确定了在孟加拉国最大的儿科医院患者的脊髓液中存在蚊虫媒介的病毒性基孔肯雅热（chikungunya disease，亦称“屈公热”）。根据这些信息，后续测试确定了同一时期的病例也患有神经侵袭性基孔肯雅热，这些患者之前曾被标记为“神秘病例”。“这令人大开眼界，”Saha博士说：“以前认为，基孔肯雅热只在非常罕见的情况下是神经侵袭性的。但IDseq提供的数据则表明不然，它帮助医护人员理解了原因未知的大脑感染。这将能够为决策者提供信息，并启动适当的循证案件管理。”

“IDseq的最终愿景是让它成为全球实时病原体检测的仪表板。这是史无前例的创举，它可能是我们在治愈、预防或控制所有疾病的能力方面向前迈出的重要一步。这些正是我们在创办Biohub时所构思的进步类型。” Chan博士评价说，她与丈夫Mark Zuckerberg两年前共同承诺投入6亿美元用于建立Biohub。

为了更广泛地使用IDseq和有价值的进行实地反馈，比尔和梅琳达盖茨基金会（Bill & Melinda Gates Foundation）近日宣布将为全球卫生工作者提供新的资助机会。获奖者将获得DeRisi博士及其在Biohub的传染病团队的分子生物学和生物信息学培训，免费访问和使用CZI支持的IDseq平台的权利，以及在他们自己的国家开始工作所需的必要设备和用品。这些合作伙伴关系将为产品开发提供有价值的反馈，帮助IDSeq最终公开供全球卫生工作者使用。

“IDseq快速的云分析平台和病原体基因组测序功能可以为全世界的实验室和诊所提供支持，这将能让该技术实现其承诺的潜力，也能帮助确定新生儿和婴儿的未知传染病原因，”比尔和梅琳达盖茨基金会的发现与转化科学主任Chris Karp博士说：“我们从一线专业人员手中学到的知识将为下一代的准备工作提供信息，帮助直接投资上游发现平台，用于新型疫苗和其他干预措施。”

“IDseq是推动全球健康的有力武器，”CZI科学主管Cori Bargmann博士说：“通过揭示全球病原体分布的趋势，我们可以帮助疾病管理和政策决策，最终可以挽救数千人的生命。”

来源：药明康德