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肺癌相关基因检测的重点问题和进展

2018-1-17 10:13| 编辑: 小桔灯网| 查看: 2044| 评论: 0|来源: 微信公众号Haalthy

摘要: 本文来自微信公众号Haalthy Haalthy=Happy+Healthy的组合,代表着快乐和健康,我们的愿景是提高肺癌治愈率。肺癌患者或家属可以通过Haalthy找到最前沿的治疗方案和科学数据,也可以与其他患者、家属和全球最顶尖 ...
Haalthy=Happy+Healthy的组合,代表着快乐和健康,我们的愿景是提高肺癌治愈率。肺癌患者或家属可以通过Haalthy找到最前沿的治疗方案和科学数据,也可以与其他患者、家属和全球最顶尖的医生进行线上交流。

今天,Haalthy邀请到严令华老师,在群里与大家共同探讨《肺癌相关基因检测的重点问题和进展》。下面我简单介绍一下严老师。严令华,医学博士,7年肺癌临床工作经验,5年大型外企抗肿瘤药物,产品管理经验,现任格诺思博生物科技有限公司副总裁。好的,下面我们有请严老师。

/嘉宾严令华自我介绍


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感谢Haalthy的邀请,能够给我这样的机会来讲一讲目前最火热的精准医疗,因为我之前听Haalthy的主持人说,这里主要都是患者,有少量的医生,因为题目定的是“液态活检的最新进展”,我想我就跳出这个领域,讲一些关于基因检测的,各个群友或者是肿瘤患者最关心的关于基因检测的一些问题。


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首先,我做一下自我介绍,我姓严,我叫严令华,我个人的经历是7年的肺癌临床医生,工作单位是上海市肺科医院,师从周彩存教授,是6年的大型药企的市场部的工作经验。几乎所有的产品都是靶向治疗产品,其中2013年成功的在中国上市了赛可瑞(克唑替尼),在中国我作为全国的品牌负责人,上市了赛可瑞这个产品。所以对基因检测领域和靶向治疗,特别是肺癌领域的基因检测和靶向治疗是非常熟悉,我个人去年加入到格诺生物,具有一年的基因检测的经验。目前,格诺生物是唯一获得CFDA批准的CTC检测的试剂盒的公司,是目前所有的液态活检领域除了强生以外,唯一获得国家药监局批准的。我还有一个特殊的身份,也使得我更能从患者中体会到各个患者的感受,主要是我个人有10年的肿瘤患者家属的经验。

/为什么需要基因检测



接下来,我主要讲一些肺癌相关基因检测的一个大的问题,包括一些最新进展。第一个问题是说我们肺癌患者为什么要进行基因检测。

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以前肺癌是按照组织学类型分的,(包括)鳞癌、腺癌、小细胞肺癌以及鳞腺混合癌等等,但是大概从前年开始,肺癌已经正式成为了一类驱动基因的疾病。什么叫驱动基因呢?就是说有这个基因变异存在,肿瘤就会生长,如果不存在这个驱动基因,那么这个肿瘤就不生长,肺癌已成为所有肿瘤里驱动基因最明显的这样一个实体肿瘤。基于此就是说像右边的这张图是来源于美国的LCMC研究,我们可以看到,蓝色这条线是Driver with targeted therapy,就是说他有驱动基因,而且接受过靶向治疗的;下面一条绿色的是有驱动基因,不接受靶向治疗的;还有一条黑色的线是代表没有驱动基因的患者,或者说没有检测到驱动基因的患者。我们可以看到检测到驱动基因的患者,接受了靶向治疗,他的中位生存时间可以达到3.5年,较检测不到驱动基因,或者检测到驱动基因没有接受靶向治疗的患者,他的时间要延长足足有一年。患者如果能够达到1年生存期的第一步就是基因检测,所以目前来说,所有的肺癌患者不管是从NCCN指南,美国的ASCO指南包括中国的国家肺癌诊疗规范,诊疗指南,所有的诊疗指南都是推荐常规基因检测的。当然,这个基因检测目前主要是集中在EGFR和ALK里面。

/哪些检测项是有意义的?

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这张幻灯是2015年的,我更新稍微慢了一点,但是基本上2016年的这张图也是一样的,我估计很多患者都看到过这样的图。目前,肺癌大概有7种基因变异,其中包括EGFR突变、ALK融合、HER2突变、BRAF突变、MET的扩增,当然还有MET的突变、ROS1的融合和RET的融合,这些突变目前都有相关的药物的治疗推荐。就肺癌来说,我个人觉得如果患者要测基因,那么就仅仅这7个基因,基本上已经完完全全足够了,理由主要是下一张幻灯片。

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我们可以看到EGFR驱动基因,ALK,当然HER2,还有BRAF,ROS1,这些基因大部分发生率在中国患者人群里面除了EGFR,大部分是在30%以上,KRAS是在10%,当然,KRAS没有一个明确的治疗药物,ALK大概在5%-8%左右。除了这些比较常见的突变或者说变异以外,其他所有的变异的发生率仅仅只在1%-2%左右。那么这些发生率与我们选择基因检测的策略是非常相关的。我总结上面两张幻灯片,我想表达的意思就是说,在肺癌里面,大家不要去检测过多的基因,其实检测7-8个就已经全了。那么在7-8个基因里面我怎么样选择检测策略也是非常重要的。

/何种方法检测?

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我既然选择检测,那么我就要知道用什么方法进行检测。在这里我们可以看到这样一个坐标轴,横轴是灵敏度,纵轴是全面性,所谓的全面性就是涵盖基因的数量多少,在左下角我们看到IHC,FISH就是免疫组化,或者免疫荧光,还包括定量PCR和一代测序,这是在左下角的。这部分技术其实很多都是目前现有的基因检测里的金标准,比如说一代测序,其实是EGFR基因突变的金标准,当然ARMS,PCR也是金标准。比如说ALK的 IHC和ALK的FISH,就是ALK融合基因金标准,但是他们的问题在于他们的灵敏度相对有限,而且全面性不够,每次只能检测单个基因的变异。但是原来在肺癌里面只有一个EGFR突变,所以这个矛盾显得不是这么的突出,但是我们发现越来越多的驱动基因以后,一次检测多个基因的需求就出现了。

基于这种需求,大家都非常熟悉NGS,所谓的二代测序。那么NGS最终的原理是一个PCR的过程,它的一个优势和技术改进点就是把所有的DNA打断,加了一个通用的接头,然后进行PCR的扩增,技术层面我就不多讲了。但是NGS分为三个层面,第一个是全基因组测序,就是测肿瘤患者的DNA;第二个是测全外显子,测肿瘤患者的mRNA;第三个叫目标区域富集的NGS,英文叫CAPP, capture-based的NGS。

那么,为什么我们现在有这样多的血检的NGS,我们可以看到目标区捕获的NGS的全面性和灵敏度其实是非常适中的,这个是2014年发表的一篇Natural medicine,由美国的一位科学家发明的这种技术,目前我们在市面上几乎所有的NGS检测都是使用这一类技术,这一类技术在提高敏感性的同时,又相对保证了全面性,所以这是现在临床应用最广泛的。比如说大家现在经常会听到的400个基因检测或者300个基因检测,只要告诉你基因数字的,比如400个,300个,200个,100多个,告诉你基因数字的,99%都是用目标区域富集的NGS检测。它的优势是在于它可以同时检测多个基因的变异,但它的劣势是准确度没有经过大规模的临床验证,而且它的质控目前存在一定的问题。

/何时需要检测?

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这个什么时候需要检测,是我个人的一些观点,供大家借鉴。其实需要依据肺癌患者的疾病阶段,看最左边,疾病阶段分为肺癌刚确诊的时候,第二个靶向治疗耐药以后,第三个是尝试了很多治疗都没有效果了以后,就是所谓的肿瘤终末期,分为这三个阶段。那么肺癌刚确诊了以后,不同的时期,选择的标准和检测方法我个人认为都是不一样的。比如说肺癌刚确诊的时候,它的检测方法我个人觉得如果考虑经济因素的话,单个基因检测未尝不是一个好方法,因为在中国女性的腺癌患者里面,她的EGFR突变概率达到了60%,如果加上ALK的话,基本上达到了70%左右的发生率,那么这70%左右的发生率几乎涵盖了驱动基因的90%。也就是说,只有80%的人有驱动基因,单个检测这两个基因,已经涵盖了70%的概率,如果不考虑经济因素的话,我个人比较建议传统方法。但是如果你觉得经济没有任何问题的话,单次选择NGS也不是这么大的一个问题。在这一类患者里面,检测标本其实是非常重要的,就是通过什么东西去检?那么我个人认为在肺癌刚确诊时,大家一定要用组织,而且一定要用病理科老师、病理学老师评估过的组织去做检测。这时候我个人不太推荐血浆,除非有一小部分患者是无法接受组织活检的,最后检出驱动基因的成功概率,如果是单个基因检测大概在50%左右,如果多个基因检测大概在70%左右。也就是说,10个里面有7到8个患者能够检测出驱动基因,如果是做基因检测的话。但是我前面所说的仅指腺癌,鳞癌和小细胞肺癌,特别是小细胞肺癌是不推荐基因检测的,鳞癌如果是纯鳞癌的话,原则上至少是不推荐多基因检测的。

第二个阶段是靶向药物的耐药,基因检测如果突变,使用靶向药物耐药,耐药以后,我个人比较推荐是多基因检测。但是这个多基因检测呢,我个人认为跟传统意义上的多基因检测不一样,它其实指的是一个基因比如说EGFR,一个基因里面的多个突变位点,指的不是EGFR耐药的患者再去测ALK,再去测ROS1,不是这个意思。它指的是如果EGFR基因突变的患者耐药了,最好把EGFR的络氨酸基酶域所涵盖的外显子全部测一遍,因为这里面很可能就有耐药基因。在这里面它的检测样本我个人觉得组织和血浆都可以,取组织毕竟在活检是个创伤,但是有组织最好,如果取不到组织的时候,血浆是一个非常完美的替代。在这种情况下,大概有30%的患者能够检测出耐药基因,那么可以选择相应的靶向治疗。就是比如说耐药后,做驱动基因的检测,大概只有30%的人,可能我还高估,大概只有30%的人,能够帮你去解决问题,检测出敏感突变,检测出对你有治疗意义的突变。第三个阶段是肿瘤的终末期,这个时候,患者一般情况比较差,这个时候就是NGS,就是涵盖基因范围越广越好,甚至如果有办法的话,你去做全基因组测序,或者是全外显组测序都没有问题。因为这个时候其实你是想万一成功,拿个药试试看,其实你的范围越广越好,在这个时候我也不推荐大家选组织,这个时候血浆远远要好于组织,但是很可惜的是你做这样一个检测,你选对了一个非常有意义的突变,最后选择了相关的靶向药物治疗有效,这种成功的概率我个人的职业生涯里没有听到过。当然我也不能说没有,所以我把它定义为小于1%的概率,就是肿瘤的终末期,所有的靶向药物都已经用完了,这个时候想通过NGS来找一个非常特异性的突变来指导他的治疗,那么这时候的概率其实是非常之小的。

/血液检测还是组织检测?

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血液检测还是组织检测的问题,大家都想知道无创和组织,其实无创和组织其实不是一个相对竞争的概念,它其实是一个相互互补的概念.第一个大家一定需要明确就是组织检测是金标准,就是说你有组织,尽量去拿组织。第二个我举个比喻,血液检测相当于是钓鱼,就是说,首先如果我钓到鱼了,我就可以说这个池塘里就是我这个肿瘤组织里一定是有鱼的,所以ctDNA如果检测出阳性,基本上就等于组织是阳性的,第二个ctDNA如果是阴性的,其实不等于组织是阴性的,因为我钓不到鱼,不能证明这个池塘里就一定没有鱼,这是非常好的一个比喻。ctDNA的检测方法有各种各样的敏感性,总体而言,如果EGFR突变以后,ctDNA检测的敏感性方法不同,但是基本上是在60%-80%左右。也就是说,ctDNA如果检测不出,就是它的假阴性率在20%-40%,各种方法不同,假阴性率也不同。

/CTC液态活检在肺癌中的应用

那么讲完了ctDNA,讲完基因检测以后,接下来我要讲一讲CTC,就是循环肿瘤细胞。循环肿瘤细胞它也有相关的一个应用环境。

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CTC和ctDNA的不同,CTC就是在一管血里面,就是大家看到这当中有一管血,这一管血离心以后,沉淀下来的就是CTC,浮在上面的就是里面还含有ctDNA,ctDNA是肿瘤细胞破了以后的一些DNA片断,CTC是一个完整的一个肿瘤细胞。举个例子来说,CTC相当于是一个完整的人脸,ctDNA是相当于人脸上的某个器官.那么这两者之间的区别。这两者功能上的运用是ctDNA它主要是涵盖肿瘤的分子生物学、遗传学特征,特别是分子遗传学特征,这是ctDNA的特点。那么CTC毕竟是一个完整的肿瘤细胞,它主要是与肿瘤的发生、发展程度是密切相关的,而且ctDNA它是用number of mutant molecules来评估的,也就是说它可以定性,阴性或阳性,CTC是可以用数字来衡量的,就是用CTC的细胞数来衡量的。所以CTC很难去定性,它大部分用来定量,就是说4个,5个,6个,对于晚期肿瘤患者或者疑似肿瘤患者,有CTC的临床价值。

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这张幻灯片主要说明一个问题,就是说CTC治疗以后,不管什么治疗,就是你接受治疗以后,如果CTC下降这部分患者,他的疗效好。每位患者在接受治疗以后,都会考虑我的疗效怎样,都会问医生,我的疗效怎么样。其实大家不会看胸部CT,大家一定会看一个数字,就是CTC的数字,就是比如说治疗前是10,但是治疗后是3或者4,那么你的疗效就一定是不错的,至少你的疗效一定好于CTC升高的患者,它能够帮助大家评估接受治疗的疗效。


相同的SD,这我写的比较专业,所谓SD也就是说你的病灶没有增长,就是说你的病灶在治疗前是2公分,治疗后也是2公分,那我怎么知道这个病灶效果好不好呢?因为胸部CT只能帮助医生来评估肿瘤的大小,但是肿瘤的活性状态,可以通过CTC来评估。也就是说胸部CT是能衡量一个人的身高,比如说这个人是长1米8还是长1米7还是长1米6,但CTC可以衡量一个人100米跑的快慢。比如说CTC衡量1米7的人跑的比1米8的人要快,它是衡量功能的。那么在评估疗效过程当中,我们可以看到,如果相同是病灶没有增长的患者,就是说治疗前是3公分,治疗后也是3公分的这部分患者,如果他的CTC是下降的话,那么这个患者的疗效要优于CTC上升的患者,这一部分患者检测CTC非常有价值。


我们可以看到CTC主要结合胸部CT,它把原来胸部CT缩小和胸部CT不变的这两类患者切分成了四类不同疗效的患者,胸部CT肿瘤缩小的患者和胸部CT肿瘤不变,CTC上升或者下降的4类患者。那么在这类CTC它可能会帮助大家起一个作用,就是说你在治疗效果没有办法去评判,就是CTC就是一般的胸部CT没有办法评判的时候,刚才我说大小一致的这种情况,或者说虽然有些缩小,但缩小的不是很明显的情况下,这个时候就通过CTC的数值的变化,就能够帮助医生或者患者来评估这个治疗方案的有效性,来决定这个治疗方案到底是停药还是继续用这个药治疗。

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目前我们在液态活检领域,格诺生物的CTC是唯一获得CFDA批准的CTC注册证。第十五张幻灯片就是讲讲CTC和ctDNA的不同临床应用价值,那么CTC毕竟是一个完整的肿瘤细胞,所以它在疑似肺癌的辅助诊断,在早期肺癌,就是手术切完以后,我要知道我是不是复发了,我想提前知道我是不是复发,这时候检测CTC比较好。在晚期肺癌患者里面,它的疗效评估是CTC的重点,ctDNA因为它含有肿瘤的遗传学特征,所以它在治疗方案的选择,特别是靶向药物治疗方案的选择和耐药机理新药研发上面,这个时候大家更应该去测ctDNA的基因变异。

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最后总结是CTC与ctA在非小细胞肺癌领域可发挥很大的作用。格诺生物的靶向PCR、CTC检测技术已经获得CFDA的批准,主要用于辅助诊断和化疗疗效的评估,刚才说了主要是评估肿瘤的功能状态,就是你的肿瘤病灶没有明显变化,但是你测一个CTC能帮你区分一下它是疗效好还是疗效不好。ctDNA主要是用于驱动基因的指导靶向治疗,那么耐药机制的探索方面,ctDNA的优势要明显优于CTC。我的讲话完了,感谢各位的聆听。



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