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国产测序仪风云录之齐碳科技V0.9

2022-8-5 17:25| 编辑: 归去来兮| 查看: 363| 评论: 0|来源: 循因缉药 | 作者:星海领航员

摘要: 2014年6月2日,Roche宣布收购Genia,这个纳米孔测序创新研究公司。


免责声明:本人非本文描述之任何公司之关联方、收益方、利益冲突方,未向文中描述之公司索取任何形式之报酬。所有信息均来自公开信息来源,如因此发生泄密皆为各相关方信息保护不力之责任,与本人无关。



意料之外的牛人



    本来按照咱们的常规套路总要扒扒公司创始人、技术、竞争对手啥的对吧。这竞争对手显然是Oxford Nanopore这个唯二中的第一嘛,然而好死不死的又查到了Roche老早就盯上了纳米孔测序。

    2014年6月2日,Roche宣布收购Genia,这个纳米孔测序创新研究公司。你说巧不巧。。。

    2012年Genia刚刚宣布跟Jingyue Ju教授和George Church合作研究这个纳米孔测序,Church教授咱们应该都很熟悉吧?就是那个基因编辑大牛张锋的伯乐,DNA测序和DNA数据存储奠基人、猛犸象复活狂热者。。。人家的被引长这样。。。

    但是!另一位Jingyue Ju(车靖岳)教授才是今天的主角。他就是SBS技术发明者、纳米孔单分子测序发明人、二代测序底层技术奠基人,也是华人科学家之光。他的SBS技术授权给了Intelligent Bio-System后被Qiagen收购。

    最新的一个消息是铭毅智造发布了Uniseq2000测序仪,而铭毅智造正是Ju教授的弟子伍建创办的,这是另外一个故事了(挖坑)。

(Uniseq2000示意图,来自网络)

    更猛的是Ju教授的技术在2021成就了另一家上市公司SingularGenomic。


他家的测序仪长这样:

哎呀,我在这篇文章(大争之世)里面竟然遗漏了它,挖坑挖坑~~~更新更新~~~


扯远了。。。我们言归正传。。。



三足立而鼎成



    谢丹,1981年1月出生于成都(看看人家80后),成都七中理科实验班考取中科大本、硕连读(又是中科大),2006年赴美国伊利诺伊大学香槟分校攻读博士,2011年进入斯坦福大学药学院Michael Snyder教授实验室博后工作,主要从事生物信息学研究。2015年,谢丹在美国已经待了9年,成都的火锅已经让他完全无法再呆下去了(误),于是他回到了成都,受聘于四川大学华西医院继续从事前沿的组学技术研究工作,同时,他也将创业搞纳米孔测序的想法提上了日程。

    做纳米孔测序要解决几个拼图:1,碱基识别算法;2,测序化学系统;3,检测电路,4,控制系统等,谢丹面临的第一个问题就是解决测序的生物化学方法。思绪万千的谢丹像大多数创业者一样,他决定去------party。

    在一个聚会上,他遇到了有些许抑郁的白净卫博士。这个2006年北大本科毕业的同样来自中国的年轻人(推测也是80后)当时在Illumina从事纳米孔测序研究,然而他并不开心,所以就与谢丹聊了起来。没想到这一聊还真有戏!随后两人在圣地亚哥一家咖啡馆里敲定了合作计划,可以视为齐碳的“咖啡馆的第一次亲密接触”。

    谢丹回国后除了在川大的科研之外还在琢磨他的创业计划,他想起了那个睡在自己上铺的兄弟、成都七中的同班同学胡庚,于是有了齐碳的“咖啡馆的第二次亲密接触” 。

这个舍友不简单啊,毕业于清华大学,2003年免试硕博连读,师从杨士元教授,请大家记住这个名字,自行百度。俩人扯完家常就聊聊近况呗,谁知这次会面之后不久胡庚直接找上门来跟谢丹说,兄弟咱们这个项目有搞头!至此,三足俱而鼎成。

(以上绝大部分为公开、真实数据,微量演绎)

        2016年9月26日,成都齐碳科技成立。

    后来另外一位联合创始人王琎是2019年加入的,根据专利推测应该是电子电路方面的专家。



绕不开的ONT



    说起纳米孔测序,那必须得说Oxford Nanopore Technology(ONT,下同)啊,2021年10月13日,该公司在伦敦证券交易所挂牌上市一周后(不太懂英国股票规则),报价为54镑,市值42.9亿英镑。

    他们的入门级产品甚至低至1000刀一台,就像一个U盘一样,仅重87g,最长测序长度4Mb以上,工作的时候连上电脑就能开工,随时随地,甚至包括在太空。

    以后有机会再详细讲讲这家公司吧,反正就很神奇。

    哦对了,咱们的例行彩蛋、吹水小素材也来自这个公司,注意看它的大股东名单:

没想到腾讯这么支持我们这个行业,泪目啊。。。


(ONT MinION芯片)



打个擂台


    虽说拿齐碳这种尚在研发阶段的产品跟ONT已经上市经过市场折磨的产品对比不太公平,但是。。。大家都这么过来的嘛,比比就习惯。

    另外,齐碳公布的信息不太多,大家凑合着看,错了欢迎打脸

    我们用齐碳最新产品QNome3841hex公开资料来跟ONT的MinION进行对比。

    从命名上来看,QNome3841hex是指384个孔道的1个芯片,六联并联测序,挺好猜。目前没看到齐碳的测序速度资料,最大读长略逊于ONT,这与纳米孔蛋白、试剂稳定性等等都有着关系,不过,2020年5月QNome9604还只能读到290Kb。

    在2021年12月10日的发布会上QNome3841(不带hex)的读长内部数据也才300Kb,这才半年就飙升到了2Mb,显然是有关键技术突破了。





豪华股东阵营



    根据爱企查的数据,百度风投在2018年就投了齐碳,难道是因为腾讯投ONT刺激的?另外我们看到了高瓴创投、华盖资本等。高瓴自不必说,鼎晖都快投了100家上市公司了。华盖在咱们行业内也是鼎鼎大名,华大智造就有它一份。

    雅惠精准医疗也不是泛泛之辈,臻和、菲沙基因都有他的影子。所以从投资人的构成来看,大概率在齐碳产品稳定后会导入这些股东的资源,至少销路问题不大。




尾声



    从应用场景来看,纳米孔测序的实时性、小体积、长度长在某些领域有着无可比拟的优势,特别是野外场景下,几乎无可取代。    

你要说风险嘛,那就是会不会跟ONT产生专利纠纷,ONT在专利方面可是有着优秀的战绩。

另外一个要说的是。。。咱还是不要说世界唯二了,全国唯一了。。。首先2018年咱不就有了Quantapore了嘛还是老熟人百度风投投的,还有北极光。。。

    国内嘛2021年还有个今是,还是谢总美国校友创办的。

    你看,博后都在一个地方。。。这伊利诺伊大学香槟分校看来特产不是香槟而是测序仪还是咋地。。。不过邹博士的渊源是咱们开头提到的Roche,那就是另外一个故事了。。。



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