Sequenom质谱法分析DNA甲基化

原理：

亚硫酸氢盐处理目标DNA，把没有甲基化的C统统转化成U

用带P7启动子的PCR引物扩增目标片段

扩增的片段再通过P7启动子转录出RNA

RNA用针对U碱基的特异裂解酶进行打断

打断后的片段用质谱进行检测

G碱基比A碱基重16个质量数

如果原来是甲基化的C，质谱中会检出G

如果原来是没有甲基化的C，质谱中会检出A

根据含G峰和含A峰的面积比较，可以推断出原来的样本中有多少是甲基化的，又有多少是没有甲基化的

                                                                             来源：陈巍学基因