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关于核酸检测PCR法……你拍过照吗?

2020-2-9 00:00| 编辑: 小桔灯网| 查看: 2571| 评论: 0|来源: 小妖的闺蜜圈

摘要: 检测有假阴性,可能测不出来,必须用ct诊断等等……小妖收到的留言很多,绝大多数来自于无医药学背景的人。如何让民众明白这个问题……小妖和个别患者家属沟通后,简单说两句。小妖本人在分子实验室待过一年,核酸检 ...

检测有假阴性,可能测不出来,必须用ct诊断等等……小妖收到的留言很多,绝大多数来自于无医药学背景的人。如何让民众明白这个问题……小妖和个别患者家属沟通后,简单说两句。


  1. 小妖本人在分子实验室待过一年,核酸检测DNA不是这次的RNA。我不是生物技术专业的,是药学专业毕业的。这个操作是需要进行培训的。作为同类专业背景的我,当时培训了两周才上岗的。我今天只说DNA的。因为我没有检测过RNA。

  2. 实验流程很简单。不管是唾液、血液……反正是样品,然后提取其中目标的DNA,因为可能提取到的DNA片段很少,所以进行PCR扩增。也就说,把获得的基因片段扩增一百万倍之类的……不停地复制。然后和对照品一起比较,看看序列是不是。如果是,就是阳性。在图谱上,差异是非常大的。

  3. 所有核酸检测试剂盒肯定是出现在病毒之后。不可能未卜先知。因为没有目标,你怎么提取可能的病毒RNA片段?因此很多患者说,为什么平时不多做一点,满足需求。这个是违背科学逻辑的。如果你知道亲子鉴定,亲自鉴定的前提是,你知道人类的基因序列是什么,然后有了父亲的样本,还需要儿子,不然你和什么去比较?也就是说,如果有一滴血,你不知道是鸡鸭鱼肉的,还是人的。那就必须知道人类的基因特征序列是什么,然后提取这滴血里的目标基因,PCR扩增。明确是人之后,看看亲人样本,是不是父子关系。

  4. 有人说,扩增就是给基因片段装拉链头,再复制。一条拉链(如果是双链),一拆二,变成两个半条,然后根据这个半条就装上另一侧的半条。一个过程,一条就变成了两条。所谓的一圈,就是一个过程,一条变两条。1变2,2变4,4变8……一般是30圈。拉链头很重要,如果不对,就不可能匹配上合适的拉链。人的基因和羊的不一样,你怎么判断是人血?就是这样啊。因此必须新冠病毒出现,得到了单纯的病毒序列,我们才知道拉链头是什么,才能取拆分样品里的拉链,把一点点的样品变成一百万倍……如果序列不对,拉链头不对,基本也就扩增不出来了,第一条就装不上。你问单链的怎么办?很简单,就是一半的拉链,先匹配,做成一条完整的拉链,再一拆二,二变四……比如mRNA反转录成单链cDNA之后做PCR,产物是双链DNA。

  5. 因此,不可能在病毒出现之前,就有这个病毒的检测试剂盒。因为你没有拉链头……也不知道应该提取哪些目标基因,一滴血给你,都不知道怎么处理。

  6. 但是,检测手段是常规手段,核酸检测手段不是一个新创造的手段。也就是说,你拍照不好看,你不能说是摄影技术是有问题的。但从第四点你能看到,每扩增一次都需要时间,而且依赖PCR设备(其实就是一个金属加热器,可以设定每个温度几分钟的那种。里面有很多孔,一次性可以放好几个样品,因为要剃度稀释。)因此小妖非常希望快速试剂试纸之类的能推出,类似于验孕棒那种。现在的方法占用设备,时间,需要经过培训的专业人手。现场、快速检测产品势在必行了,当然了,这不容易。一旦做成,时间,人力物力都省,而且可以上门排查。

  7. 假阴性的造成的原因有很多

    没有取到合适样品。这点我深信。因为一开始我们并没有意识到,部分轻症患者口腔里没有,需要取深度痰液,也没说粪口消化道传播,一开始很多检测取样,并没有肛门样品。这是基于我们对于这个疾病的认知。所以你不能说,七次检验都是阴性,最后肛样品是阳性,这是检测手段的问题。如果你取景,现场就没有樱花,你怎么指望照片里有樱花?

    样品处理的专业度。人体的样品是复杂的。小妖个人检测DNA的经验里,样品处理是需要专业度培训的。因为血液、痰液等等,有很多蛋白质,有些操作可能让提取到的样品不纯,有很多干扰因素。类似于你拍照,照片里可能有你,但你在火车站检票口……背景不干净,可能需要重新取样。当然,还有操作不当,导至目标样品破坏的。这个不是检测手段的问题,是处理手法,专业人士的操作问题。因此我非常支持大规模招募技术人员,并且增加检测公司加入。

    公用设备污染。这个在实验室常见。因为每个样品都要使用到水浴加热、PCR设备等等,有时候离心管密封没按好,导至“烤干了”,样品溶液蒸发,污染整台设备,但技术人员没有发现。这个在工作压力极大,设备和人员满负荷运转的时候是可能发生的,我表示理解。排除这些问题,可能就是复检,样品检测两次等等。

    有人质疑敏感度的问题。其实很多人把化学检测的一些概念代到了生物技术手段。怎么说呢,你可以多扩增几圈……小妖以前偷懒,规定要扩增35圈的,我可能就扩增28圈,因为如果是阳性,样品量够,2倍的28次方就绝对够看出来了,这样能省时间……换句话说,我只接受着急了,这种说法。不存在取到样品,扩增2的35次方,然后看不到样品的,然后跟我说敏感度的问题……说化药HPLC是有多少个ppm……你见过检测化学品,扩增,让样品变多的吗?但你现在问我,这个敏感度是百万分之多少?

    引物序列可能不对?我相信我们分离了新冠,并且测序了。不然的话,现在就没有对照序列,也就说,很可能一例都检测不到。但各个公司的探针、引物可能存在不同。这个小妖不能乱说,因为我没看到,也没有比较过。大家选择的片段是不是都一样,这个……理论上应该没有问题的。除非是大数据说明,有一个品牌的试剂盒一个都没测出来,那么他们的家试剂盒有问题。这种问题是系统性问题,有问题就是全部,不可能一两个,一部分能做,一部分不行。

    试剂盒的贮存。我不想再去追究什么捐赠物资处理……但话是实话。为什么2-8摄氏度保存,总是有道理的,毕竟都是氨基酸。

    试剂盒稳定性。和上一个问题有一点类似,就是试剂本身会不会在特殊情况下,温度不适宜的情况下出现问题。一个实验室,都是露天放着,有点还能用,有的试剂盒本身的一些氨基酸出了点问题。

  8. 把CT和核酸检测成功率做对比

    这个做法基本就是无事生非了,还连累了几位一线医生。CT影像学,他怎么确定是哪种病毒感染?其实影像学和核酸检测应该是相辅相成的。部分轻症,无症状可能在CT上看不出来,也或者有其他肺炎、基础疾病的,拍CT分不出来是不是新冠感染。核酸检测,确实无法判断肺部病灶的痊愈也或恶化的情况。这两种手段本来都没有问题,都是成熟的,但被部分一知半解,也或另有所图的人利用了,非得比较。事实上,你就是一个普通的感冒、骨折,怎么判断好不好?可能验血,验尿,拍片……综合后才能告诉你,有没有感染,同时伤口愈合得怎样了,能不能出院。

  9. 所以……你拍不出好看的照片,也许一开始取景地里没有好看的花,一开始角度就不对,处理不当,曝光过度了,一开始就背景太糟乱,一开始胶卷就受潮了……照片只能告诉你,平面影像是这样的,他无法告诉你照片里的两个人是不是父子……但你不能说,摄影技术的发明有问题,是骗子。


我希望我说了一些非该专业人士听得懂的话。

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