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[分享] PCR实验设计到的概念大全上(太长,分三篇)

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发表于 2018-8-16 10:39 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 萝卜涨价了 于 2018-9-14 编辑

Abundance (mRNA 丰度):指每个细胞中 mRNA 分子的数目。
Abundant mRNA(高丰度 mRNA):由少量不同种类 mRNA 组成,每一种在细胞中出现大量拷贝。
Acceptor splicing site (受体剪切位点):内含子右末端和相邻外显子左末端的边界。 Acentricfragment(无着丝粒片段):(由打断产生的)染色体无着丝粒片段缺少中心粒,从而在细胞分化中被丢失。
Active site(活性位点):蛋白质上一个底物结合的有限区域。
Allele(等位基因):在染色体上占据给定位点基因的不同形式。
Allelic exclusion(等位基因排斥):形容在特殊淋巴细胞中只有一个等位基因来表达编码的免疫球蛋白质。
Allosteric control(别构调控):指蛋白质一个位点上的反应能够影响另一个位点活性的能力。 Alu-equivalentfamily(Alu 相当序列基因):哺乳动物基因组上一组序列,它们与人类 Alu家族相关。
Alu family (Alu 家族):人类基因组中一系列分散的相关序列,每个约 300bp 长。每个成员其两端有 Alu切割位点(名字的由来)。
α-Amanitin(鹅膏覃碱):是来自毒蘑菇 Amanita phalloides 二环八肽,能抑制真核 RNA聚合酶,特别是聚合酶 II 转录。
Amber codon (琥珀密码子):核苷酸三联体 UAG,引起蛋白质合成终止的三个密码子之一。 Amber mutation(琥珀突变):指代表蛋白质中氨基酸密码子占据的位点上突变成琥珀密码子的任何 DNA 改变。
Amber suppressors (琥珀抑制子):编码 tRNA 的基因突变使其反密码子被改变,从而能识别 UAG密码子和之前的密码子。
Aminoacyl-tRNA (氨酰-tRNA):是携带氨基酸的转运 RNA,共价连接位在氨基酸的 NH2基团和 tRNA 终止碱基的3或者 2-OH 基团上。
Aminoacyl-tRNA synthetases (氨酰-tRNA 合成酶):催化氨基酸与 tRNA 3或者 2-OH基团共价连接的酶。
Amphipathicstructure(两亲结构):具有两个表面,一个亲水,一个疏水。脂类是两亲结构,一个蛋白质结构域能够形成两亲螺旋,拥有一个带电的表面和中性表面。Amplification (扩增):指产生一个染色体序列额外拷贝,以染色体内或者染色体外 DNA 形式簇存在。
Anchorage dependence (贴壁依赖):指正常的真核细胞需要吸附表面才能在培养基上生长。
Aneuploid (非整倍体):组成与通常的多倍体结构不同,染色体或者染色体片段或成倍丢失。
Annealing (退火):两条互补单链配对形成双螺旋结构。
Anterograde (顺式转运):蛋白质质从内质网沿着高尔基体向质膜转运。
Antibody (抗体):由 B 淋巴细胞产生的蛋白质(免疫球蛋白质),它能识别特殊的外源“抗原”,从而引起免疫应答。
Anticoding strand (反编码链):DNA 双链中作为膜板指导与之互补的 RNA 合成的链。
Antigen (抗原):进入基体后能引起抗体(免疫球蛋白质)合成的分子。
Antiparallel (反式平行):DNA 双螺旋以相反的方向组织,因此一条链的 5端与另一条链的端相连。
Antitermination protein (抗终止蛋白质):能够使 RNA 聚合酶通过一定的终止位点的蛋白质质。
AP endonucleases (AP 核酸内切酶):剪切掉 DNA 5端脱嘌呤和脱嘧啶位点的酶 Apoptosis(细胞凋亡):细胞进行程序性死亡的能力;对刺激应答使通过一系列特定反应摧毁细胞的途径发生。
Archeae (古细菌):进化中与原核和真核不同的一个分支。
Ascue (子囊):真菌的子囊包含四个或八个(单一的)孢子,表示一次减数分裂的产物。
Att sites (Att 位点):在噬菌体和细菌染色体中将噬菌体插入或切除细菌染色体的位点。
Attenuation (衰减):控制一些细菌启动子表达中涉及的转录终止调控。
Attenuator (衰减子):衰减发生处的一种内部终止子序列。
Autogenous control (自体调控):基因产物减弱(负自体调控)或者激活(正自体调控)其编码基因表达的作用。
Autonomous controlling element (自主控制元件):玉米中一种具有转座能力的转座元件。
Autoradiography (放射性子显影):通过放射性标记分子在胶卷上留下图像检测分子的方法。
Autosomes (常染色体):除性染色体外的所有染色体。二倍体细胞拥有两套常染色体。
B B lymphocytes or B cell (B 淋巴细胞或 B 细胞):合成抗体的细胞。
Backcross (回交):杂交检测的另一种(早期的)说法。
Back mutation (回复突变):逆转产生基因失活效果突变的突变,从而使细胞恢复野生型。
Bacteriophage (细菌噬菌体):侵染细菌的病毒,通常简称为噬菌体。
Balbiani ring (B 环):多线染色体条带中一个很大的泡状环。
Normal chromosomes (常染色体):相对较大,一定区域内在特定化学处理下保持着色。 Base pair (碱基对):是DNA 双链中一对 A 和 T 或 G 和 C。在 RNA 中特定条件下也能形成其它的配对。
Bidirectinal replication (双向复制):当两个复制叉在同一起始点以不同的方向移动时形成。 Bivalent(二价染色体):在减数分裂初期一种包括四条染色单体的结构(两个染色单体代表同源染色体)。
Blastoderm (囊胚层):昆虫胚胎发育的一个阶段,其中胚胎周围的一层细胞核或细胞围绕着中央的卵黄。
Blocked reading frame (闭锁读框):由于被终止密码子打断而不能被翻译成蛋白质的读码框。
Blunt-end ligation (平端连接):直接在末端连接两个 DNA 双链分子的反应。
bp:是碱基对的简称,表示 DNA 之间的距离。
Branch migration (分支迁移):指双链中与其互补链部分配对的 DNA链通过延伸与其同源的固定链配对的能力。
Breakage and reunion (断裂与重连):指一种遗传重组的模式,其中两个 DNA双链分子在相应的位置打断并十字交叉重新连接(涉及在连接位点异源双链的形成)。
Buoyant density (漂浮密度):衡量一种物质漂浮在一些标准液体上的能力,如 CsCl。
C Cbanding:在着丝粒附近产生着色区域的染色体分带技术。 C gene (C 基因):编码免疫球蛋白质链恒定区域的基因。 Cvalue (C 值):单倍体基因组中 DNA 的总量。
CAAT box (CAAT 盒):真核生物转录单位起始点上游的保守序列,被一组转录因子识别。
Cap (帽):是真核生物 mRNA 5端的结构,在转录后通过末端 5 GTP 的磷酸基团和 mRNA 的末端碱基而引入。增加的G(有时是其它碱基)是甲基化的,产生了 MeG5pppNp… 的结构。
CAP(CRP):由 cAMP 激活的正调控蛋白质。对 RNA 聚合酶起始 E.coli中一些操纵子(分解代谢——敏感)是必须的。
Capsid (衣壳):是病毒微粒外部的蛋白质衣壳。
Caspases:一个蛋白质酶家族,其成员在调亡(细胞程序性死亡)中起作用。
Catabolite repression(分解代谢物阻碍):由于葡萄糖增加引起一些细菌操纵子表达降低。是cAMP 水平降低使 CAP调控蛋白质失活所导至。cDNA:与 RNA 互补的单链 DNA,通过体内 RNA 逆转录而合成。
cDNA clone (cDNA 克隆):代表一个 RNA 的双链 DNA 进入一个克隆载体。
Cell cycle (细胞周期):一次细胞分裂到另一次分裂的时期。
Cell hybrid(细胞杂交):包含来自不同种属亲本细胞染色体的体细胞(如人-鼠融合细胞杂交),通过融合细胞形成融合的异型核而产生。
Centrioles (中心粒):在减数分裂期聚集在中轴附近、由微管组成的小空圆柱体,位于着丝粒上。
Centromere (着丝粒):染色体聚集区域,包含减数分裂或有丝分裂纺锤体结合位点。 Centrosomes(中心体):减数分裂细胞微管组织的区域。在动物细胞中,每一个中心体包括一对由微管附接的、高密度不定型区域围绕的中心粒构成。
Chaperone (分子伴侣):使一些蛋白质装备或者恰当折叠所需的蛋白质,但是这种蛋白质并不是目标复合物的成分。
Chemical complexity (化学复杂度):化学分析测量的 DNA 成分量。
Chi sequemce (Chi 序列):一个提供 E.coli 中 RecA 介导遗传重组热点的八聚体序列。 Chistructure (Chi 结构):两个双链 DNA之间的接头通过去掉两个连在一起的环而使每个环产生线形末端暴露出来。它类似于希腊文 chi,从而得此名字。 Chiasma(交叉):两个同源染色体在减数分裂中交换物质的位点。
Chromatids (染色单体):复制时产生的染色体拷贝。此名字通常用来形容处于随后的细胞分裂期它们分开的之前的染色体。
Chromatin (染色质):是细胞中期核内 DNA 和蛋白质复合体。个别的染色体不能区分开。它只能通过与 DNA特异性作用的染料而识别。
Chromatin remodeling (染色体重建):指发生在基因活化转录时核小体能量-依赖型的排列或重排。
Chromocenter (染色中心):来自不同染色体的异染色质聚集。
Chromomeres(染色粒):在某一时的期染色体中,特别是减数分裂初期,染色很深的可见小颗粒,此时染色体可能表现为一系列的染色粒。
Chromosome (染色体):携带很多基因的基因组的分离单位。每一条染色体包含长的双链 DNA分子以及等量的蛋白质。只在细胞分裂中才为可见的形态单位。
Chromosome walking (染色体步移):连续分离携带重叠 DNA序列的克隆,使染色体大部分被覆盖。步移通常用于获得某个感兴趣的位点。
cis-acting locus (顺式作用位点):只影响处于同一 DNA 分子上的 DNA序列,此性质通常暗示该位点不编码蛋白质。
cis-acting protein (顺式作用蛋白质):不同寻常的、只作用于表达它的 DNA 序列上的蛋白质质。
cis configuration (顺势构型):指在同一个 DNA 分子上的两个位点。
cis/transassays(顺/反测验):分析两个突变相对构型对表达的影响,双杂合体中,同一基因上的两个突变在反式构型中表现出突变表型,顺势构型中表现出野生表型。
Ciston (顺反子):是由顺/反测验定义的遗传单位,与基因等同,都是代表一个蛋白质质的DNA 单位组成。
Class switching (类别转换):在淋巴细胞分化过程中免疫球蛋白质重链 C 区表达的转换。
Clone (克隆):指大量与祖先细胞和分子相同的细胞和分子。
Cloning vector (克隆载体):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。
Closed reading frame (关闭读框):包含阻碍它翻译成蛋白质的终止密码子。
Coated vesicles (包被膜泡):膜表面有一层蛋白质,如网格蛋白质、COP-1、COP-II 的膜泡。
Coconversion (共转变):在基因转换中两个位点的同时修改。
Coding strand (编码链):与 mRNA 有相同序列的 DNA 链。
Codominant alleles (共显性等位基因):两个都对表型有贡献,谁也不占优势。
Codon (密码子):三连体核苷酸,代表一个氨基酸或者终止信号。
Coevolution (共进化):见协同进化。
Cognate tRNAs (同功 tRNA):能够被一个特殊的氨酰基-tRNA 合成酶识别的 tRNA。
Coincidental evolution (重合进化):见协同进化。
Cointegrate structure(共合结构):两个复制子融合产生的结构,一个复制子带有一个转座子,另外一个缺少,但是整合体中出现两个在复制子汇合处的转座子,方向是正向复制。Cold-sensitive (冷敏):这种突变在低温下是缺陷型的,但是在高温下正常。
Colon hybridization (菌落杂交):使用原位杂交来确定携带一个特定同源序列的插入 DNA片段载体的技术。
Compatibility group (相容组):含有不能同时存在一个细菌细胞内的质粒。 Complementation(互补):不同的(非等位)基因提供扩散型产物,从而使含有两个反式突变的杂合体产生野生表型的能力。
Complementation assay (互补测验):见体内互补测验。
Complementation group (互补群):互相反式重组时不互补的一系列突变,它定义了一个遗传单位(顺反子)。
Complexlocus(复合基因座):果蝇中拥有与代表单个蛋白质的基因功能不一致的遗传性质。在分子水平上复合基因座通常很大(>100kb)。
Complexity (复杂度):在给定样本中不同 DNA 序列的总长度。
Composite transposons(复合转座子):两个插入序列包围着一段中央区域,这两个序列中的一个或者两个可能使整个元件转座。 Concatemer (多联体DNA):包含一系列一前一后重复的基因组单位。
(Con)catenated circle (多联环):DNA 环如同链上的环一样连接起来。
Concerted evolution (协同进化):两个相关基因如同组成一个等位基因那样共同进化。 Condensationreaction (缩合反应):由于失去水分子使共价键形成,例如往多肽链中加入氨基酸的反应。
Conditional lethal mutations(条件致死突变):在特定的(非许可的)条件下杀死一个细胞或病毒的突变,但是在其它(许可的)条件下使其存活。
Conjugation (接合):指两个细菌之间的杂交,部分染色体从一个细胞转入另一个细胞。 Consensus sequemce(共有序列):当许多实际序列比较时,每个位点上的碱基能够代表最常出现的碱基理想序列。
Conservative recombination (保守重组):在没有任何新 DNA 链形成情况下,已经存在DNA链的打断和重新连接。
Conservative transposition(保守转座):即大的序列移动,原认为是转座子,现在认为是附加体。这种机制类似于噬菌体λ位点。
Constant regions (恒定区):免疫球蛋白质的保守区由 C基因编码,是变化很少的链的一部分。重链的恒定区决定免疫球蛋白质的类型。
Constitutive genes (结构基因):由于 RNA聚合酶与启动子作用而表达的基因,不需要额外的调控。有时候也被称为看家基因,因为它在所有细胞中都有低水平表达。
Constitutive heterochromatin(组成型异染色质):指永久不表达序列的钝化状态,通常是卫星DNA。
Constitutive mutations (组成型突变):引起需要调控的基因在不被调控的状态下持续表达。 Contractilering (收缩环):在有丝分裂后期中轴附近形成的激动蛋白质纤维环,负责将子代细胞分开。
Controlling elements (控制成分):玉米中的控制成分是最初由其遗传性质确认的转座单位。
分自主(能够独立转座)或者非自主(只有在一个自主元件存在下转座)两类。
Coordinate regulation (协同调控):即对一组基因的调控。
Cordycepin (蛹虫草菌素):是 3脱氧腺苷,是 RNA 聚腺苷化的阻扼子。
Core DNA (核心 DNA):核心颗粒中包含的 146bp DNA。
Core particle (核心颗粒):核小体的消化产物,包含组蛋白质八聚体和 146bpDNA,其结构与核小体本身相似。
Corepressor (共阻碍物):是一个小分子,通过结合到调控蛋白质上抑制转录。
Cosmid (粘粒):包含l噬菌体 cos 位点的质粒,因此,质粒 DNA 能够在体内被噬菌体衣壳包裹。
Cot (浓度时间常数):在复性反应中 DNA 浓度和反应时间的乘积。
Cot1/2(半变 Cot 值):反应完成一半时所需的 Cot 值,它直接与复性 DNA 成正比。
Cotransfection (共转染):两个标记的共同转染。
Crossing-over (交换):发生在减数分裂中染色体间互相交换物质,引起遗传重组。 Crossover fixtion(交换固定):不均等交换的一种可能结果,能使前后连接簇中一个成员的突变延伸到每一簇。
Cruciform (十字架):在同一链中插入其互补链(而不是与双链中另一条链中的互补片段)配对的 DNA重复序列所形成的结构。
Cryptic satellite (隐蔽卫星):不能通过密度梯度上的峰值分离的卫星,即隐藏在主带中。
ctDNA:即叶绿体 DNA。
cAMP:磷酸基团连接核糖 3和 5位置的 AMP 分子,其结合可激活 CAP,原核生物转录中的正调控因子。
Cyclins (细胞周期蛋白质):在细胞周期中连续积累的蛋白质,随后在减数分裂中被蛋白质水解作用消除。
Cytokinesis (胞质分裂):在减数分裂中涉及子代细胞分裂和离开的最终过程。
Cytological hybridization (细胞学杂交):见原位杂交。
Cytoplasm (细胞质):指质膜和核之间的物质。
Cytoplasmic inheritance (胞质遗传):定位在线粒体或者叶绿体(也可能是其它细胞器)的基因性质。
Cytoplasmic protein synthesis (胞质蛋白质合成):代表核基因 mRNA的翻译,通过附加在细胞骨架上的核糖体进行。
Cytoskeleton (细胞骨架):真核细胞质中纤维组成的网络。
Cytosol (胞质溶胶):容纳细胞器(如线粒体)的胞质容积。
D Dloop (D 环):线粒体 DNA 上的一个区域,其上一小段 RNA 与 DNA 的一条链配对,使 DNA原始配对链在此区域闲置。也用来描述在 RecA 蛋白质催化的反应中单链“入侵者”的进入,使双链 DNA 中的一条被闲置。
Degeneracy (简并性):指密码子的第三个碱基上的变化不会改变它所代表的氨基酸。
Deletion (缺失):一段 DNA 序列被删除,两边的区域连接起来产生的。
Denaturation of DNA or RNA (DNA 或 RNA变性):指它们从双链转变成单链状态,双链分开一般因加热产生。
Denaturation of protein (蛋白质变性):指蛋白质的物理结构向另一结构(不活泼的)转变。 Depressedstate(抑制状态):指关闭的基因。当描述一个基因的一般状态时,它与“诱导”同义。在描述突变的效果时,它与“组成型”同义。
Dicentric chromosome(双着丝粒染色体):两个染色体片段融合的产物,每一片段都有一个着丝粒。通常稳定,在减数分裂中当两个中心粒向两极运动时被拉断。
Diploid (二倍体):二倍体染色体包括两个拷贝的常染色体和两个性染色体。
Direct repeat (同向重复):在同一个 DNA分子中,相同的(或者相近的)序列以相同的方向出现两次或多次,但并不一定相邻。
Discontinuous replication (不连续复制):指 DNA 以小片段(岗崎片段)合成然后连接起来。
Disjuction (间断分布):指在细胞分裂中染色体成分向两极运动。在减数分裂和有丝分裂 II期,分裂的是姊妹染色单体,在有丝 I期分裂的是姊妹染色单体对。
Divergence (差异百分率):两个相关 DNA 的核苷酸序列或者两个蛋白质氨基酸序列间差异百分率。
Divergent transcription(异向转录):相反方向两个启动子之间的转录起始,因此转录从中央区域开始向两边进行。
dna mutant (dna 突变):这种突变的细菌是温度敏感型的,它们不能在 42℃下合成 DNA,但是能在37℃合成。
DNAase (DNA 酶):攻击 DNA 之间化学键的酶。
DNAase I hypersensitive (DNA 酶 I 超敏位点):由于对 DNA 酶 I和其它核酸酶切割高度敏感而被发现的染色单体上一小段区域。可能由不包括核小体的区域构成。
DNA-driven hybridization (DNA 驱动杂交):涉及到额外 DNA 与 RNA 反应的杂交。 DNApoymerase (DNA 聚合酶):合成子代 DNA 链(在 DNA 模板的指导下)的酶。可能在修复或复制中涉及。
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