许明炎专访：揭秘“万人癌症基因测序计划”背后的故事

千姿百态

从年初至今，中国特色的精准医疗已成为生物医药行业十足的热门话题。然而，在精准医疗这一概念炙手可热的同时，如何将其落地，真正地去实践和应用，是目前政府界、企业界和科研界需要共同思考的问题。

前不久，深圳市海普洛斯生物科技有限公司和深圳市人民医院联合启动了针对五种常见癌症的大型测序计划——“万人癌症基因测序”计划，以期实施个体化精准诊疗，进入癌症精准医疗新时代。近日，测序中国编辑有幸采访到海普洛斯创始人兼董事长许明炎先生，请他讲述了“万人癌症基因测序”计划背后的故事。

测序中国编辑：“万人癌症基因测序计划”对于精准医疗在我们国内的推动无疑具有重要的意义，这项计划将采用什么样的测序技术，将结合患者的哪些临床指标？

许明炎：“万人癌症基因测序”计划是在特定的历史时期，结合基因测序技术的发展， 延续了过去25年来，国际上人类对自我认识的一系列重大计划的精髓的基础上提出的。20多年前，人类基因组计划启动，经历了十余年的时间，发布了人类基因组草图，中国在其中参与并完成了1%的工作。随后国际上开展的HapMap和1000 Genomes计划，确定了大部分人群的单碱基多态性SNP。美中不足的是，此次计划的测试人群只有数千人，而中国人基因组不足1000人。在随后的几年，对于癌症基因组的研究也陆续开启。2006年，国际基因组织（ICGC）启动了重大科研项目—“癌症基因组图谱计划”（The Cancer Genome Atlas， TCGA），目的是绘制出1万个肿瘤基因组图谱。这项计划汇集了16个国家科学家的智慧和努力，发现了近1000万个癌症相关突变，于2015年初宣布完成。2007年，英国Sanger研究所启动了一项针对癌症患者的癌症基因组计划。科学家们锁定了 200个特定的肿瘤，进行了一项大规模的基因译码活动。该活动中，500个特定的基因，超过25亿个基因序列被破译。2009年12月，Sanger研究所宣布破译肺癌、皮肤癌和乳腺癌的全部基因密码，并绘制出相应的肿瘤基因图谱。该计划所发现的突变中，大多数是“被动的”，不会导至癌变；小部分是“主动的”，会导至癌变发生。在2015年的时候，英国的十万人基因组计划以及美国的百万基因组计划的提出，目的也是通过大规模的基因组分析，寻找疾病的精准诊疗方案。接下来，科学家还将为更多癌症病人进行基因图谱测绘，最终找出致病的基因和变异信息，为癌症的诊疗提供帮助，也为研制抗癌新药提供参考。

中国人有很多特有的癌种，比如肝癌、胃癌、食管癌等，这些癌症在欧美国家很少发生，所以研究和解决这些癌症是中国人自己的责任。为了建立中国人特有的癌症基因组数据库，实现中国人自己的精准医疗，一个更大规模的癌症基因测序计划势在必行。我们将这个计划简称为“万人癌症计划”。这项计划主要采用国际最先进的二代测序技术，结合“液体样本活检”技术，针对受试者的循环肿瘤DNA（ctDNA）进行超高深度的捕获测序，试图建立全球首个针对中国人种的ctDNA数据库。具体来讲，该计划通过深度测序肿瘤患者和高危人群的多个时间点的血液样本，对照组织样本，结合现有数据库，结合临床信息，多维度的全程监测五种高发癌症（肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌、肝癌）的发展变化。我们开启这项计划的最终目的是为了实现1万人的癌症早期筛查、预后监测及个体化用药指导，建立中国首个大型癌症基因数据库，为实现精准医疗奠定基础。

测序中国编辑：这项大的计划，也体现了精准医疗所提倡的“交叉融合，协同创新”的思想，那么，这项计划实施过程中，企业和医院之间是如何优势互补，分工合作的？

许明炎：这项计划由海普洛斯和深圳市人民医院联合启动，随后全国各地数十家顶级癌症诊疗三甲医院将陆续加盟。没错，该计划的实施，很好地体现了“交叉融合、协同创新”的思想。随着测序技术的发展，一个人全基因组测序的成本已降到1000美金。尽管如此，测序技术对于大部分人群来说，仍然是个高大上的、高深莫测的技术。疾病的复杂性和人体基因数据的庞大，使得一个跨学科、跨院企的结合成为必然。海普洛斯在“液体样本活检”技术和基因测序技术相结合的研发上有非常深厚的功底，积累了非常大的临床样本数据。

此外，医院无疑是该计划的承担主体，从病人的咨询、样本的收集、临床数据的收集、诊疗信息的反馈、精准医疗的实施主体、患者预后的跟踪随访等各个层面，都起到不可替代的作用。以深圳市人民医院为例，深圳市人民医院是深圳地区资历最老的一家现代化综合性医院。在临床、转化医学和基础研究拥有一流的软硬件平台。因此，“万人癌症基因测序”计划，将发挥海普洛斯在基因测序领域的领先优势，结合医院在临床方面不可替代的优越性，实现优势互补，资源共享，共同推进我国精准医疗事业的发展。

测序中国编辑：是否方便介绍一下这个大项目预计投入多少人力、物力和财力？

许明炎：“万人癌症基因测序”计划针对癌症基因进行超高深度测序，结合临床诊疗数据，要实现1万人的癌症无创检测、预后监测、用药指导、耐药评估，其工作量巨大，海普洛斯公司全体将全职加入该计划，同时，各大加盟医院的专家学者预计数百人。该计划预计投入1亿元，目前海普洛斯作为深圳市政府引进海归创业团队，已经得到深圳市科创委、南山区科技局的项目资助，同时，目前也在考虑申请国家级项目经费支持。

测序中国编辑：这项计划所产生的数据将如何利用，未来是会否考虑共享？

许明炎：“万人癌症基因测序”计划将收集1万人的癌症基因数据，以及临床诊疗数据，建立中国首个癌症精准医疗数据库。该数据库由海普洛斯搭建，所有加盟单位同等享有使用的权利。未来，在完成数据库的安全性、稳定性、论理性等综合测评后，有望将数据库实现全国范围内的资源共享。所以，在此，我们也诚邀更多的医院和单位通过“万人癌症基因测序”计划的官方网站 www.10000cancer.com加盟该计划。同时，符合入组条件的高危人群以及癌症患者，也可以通过我们的官方网站以及扫描下面的二维码参与该计划。


来源：测序中国