动力学指纹识别血液中miRNA肿瘤标志物

检验之星

在人体血液中经常存在肿瘤组织的生物标志物（biomarkers），例如微小RNA（miRNA）。miRNA是具有22-24个碱基的非编码RNA，由于它的后转录调节作用，近年来备受学界关注。传统的分析方法依赖于核酸杂交的热力学，导至背景信号高，难以用于人体血液中miRNA的直接分析。科学家开发了一种基于动力学指纹的miRNA识别方法，可直接用于血液中miRNA肿瘤标志物的快速定量分析。

研究者利用短荧光DNA探针与其目标miRNA杂交动力学的特点，在全内反射显微镜（TIRF）上实现了miRNA的单分子计数。该方法的最大优势在于运用了DNA探针与目标miRNA“可逆结合”的模式，将杂交和解链的速率作为定性定量的依据（动力学指纹，kinetic fingerprinting），从而解决了单分子分析中背景信号干扰的问题，极大地提高了灵敏度和特异性。研究者还利用泊松分布对体系进行统计学描述，实现了多种miRNA的“零背景”检测，灵敏度达到1-5fM；同时还实现了单碱基差异区分，区分因子达到570倍。这一结果超过了很多基于信号放大的检测方法。该方法成功应用于前列腺癌病人血清中生物标志物miR-141的直接定量。

原文检索：Kinetic fingerprinting to identify and count single nucleic acids

来源：生物360