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ELISA实战案例分享——数据处理
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发表于 2024-11-3 13:45
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之前的几期课堂讲座给大家分享了ELISA实验的原理,操作步骤以及实验中的常见问题(感兴趣的小伙伴可以去视频专区收看),近期又收到部分小伙伴的反馈问题,主要集中在数据处理上。小编看了也觉得比较可惜,整个ELISA实验做得不错,可惜在最后的数据处理上犯了错误,直接导致实验结果出了大问题,可谓功亏一篑。接下跟着小编进行一次实战案例的分析,详细了解一下爱必信ELISA试剂盒的数据处理过程吧~
话不多说,先上图:
图一. 客户提供原始OD值图(涉及未发表数据,部分隐去,部分略作处理)
图二. 客户处理的标准曲线图
客户反馈,部分数据OD出现负值,无法处理,觉得试剂盒有问题。小编接到这个case之后,简单的看了一下客户的数据,就发现几个明显的数据处理问题,而根据客户的原始OD数据,初步判断,试剂盒是正常的,并且实验数据还比较可靠。不知道是否有聪明的小伙伴已经从这个数据中发现了问题呢?没关系,跟着小编一起来抽丝剥茧的详细分析一下吧~
1. OD值出现负值
大量样品孔的读值为负数,但接近零点,小编看了一下客户标曲的0点OD值接近0,初步判断客户是用空白孔进行校准,但空白孔由于操作污染等原因,OD值偏高,进而导致样品孔OD值为负。跟客户沟通之后,确实是进行了空白孔校准。
沟通之后,确认原始空白孔读值为0.0962,明显偏高,正常OD450的空白孔读值应为0.06左右。
在这里,小编建议有条件的小伙伴,尽量要用我们推荐的双波长校正法,使用570或630nm波长进行校正,OD450 - OD570/630即为校正后的OD值,可直接用于计算,也可根据数据质量,再进行空白校正。如没有双波长的酶标仪,读取OD450数据后,应先判断数据质量,再进行空白校正。
小编将空白校正进行补回,得到的OD450原始数据如下:
至此,样品孔数据出现负值这一问题解决。
图三. 经还原处理的OD450原始数据图
2. 标曲拟合问题
处理完了负值问题,还有一个很明显的问题就是,客户的标曲拟合问题。我们这款试剂盒(Mouse TNF alpha ELISA Kit,abs520010)标曲最高点是2000 pg/ml,客户给我的截图(图二)只到250 pg/ml,再仔细研究一下,发现客户的拟合方式用的竟然是直线拟合。跟客户沟通之后,确认原因,客户选择直线拟合,高点不符合拟合方式,R2值过低,所以客户自己把上面高浓度的点去掉了,只选取到250 pg/ml,进行直线拟合。在这里,小编强调一下, 爱必信ELISA试剂盒推荐拟合方式为四参数拟合,四参数拟合,四参数拟合,重要的事情说三遍。不要再用其他稀奇古怪的拟合方式进行拟合啦。就像这个客户犯的错误,虽然看似250 pg/ml以下的点可以用直线拟合,但是表达含量较高的样品,OD值高时,就不符合他拟合的这条直线了,会导致结果出现严重偏差。由于0孔出现问题,小编在拟合标曲时,将OD值最低的孔作为空白孔,TNF-α在正常样品中表达含量极低,可视为0,拟合曲线如下:
图四. 四参数拟合的曲线图及方程
回归计算之后得到样品浓度,部分无法计算出的样品孔,表达含量低于0点,按0计算即可。
本期ELISA实战案例解析就到这里了,希望对各位小伙伴们有所帮助。大家在平时的实验中遇到什么问题也可以联系我们,小编汇总之后,尽力为大家解答~
原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/145583938
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