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“蜡”开新局:巧妙利用相变温控,让CRISPR-POCT告别开盖污染

2026-9-27 08:44| 发布者: 沙糖桔| 查看: 181| 评论: 0|来源: 小桔灯网丨 作者:动力彩虹🌈

摘要: 作者提出的WIAT平台是一种利用蜡相变实现自动分步反应的一管式RPA-CRISPR检测平台。

基于核酸的分子检测对早期诊断、疫情控制和临床决策具有重要作用。其中,CRISPR分子诊断在POCT应用中有着不可或缺的作用,如果联合RPA、LAMP等等温扩增,就可以在不依赖PCR热循环仪的条件下实现较高灵敏度和特异性。但扩增和CRISPR检测同时进行时,会导至反应效率下降、背景升高等问题。而常规两步法CRISPR检测需要人工操作,如震荡、离心或涡旋混匀,不仅增加流程复杂度,也增加气溶胶污染风险。

近日,来自美国康涅狄格大学的研究团队在杂志ACS Sensors上发表了一篇题为    “Wax-in-a-Tube: A Simple, Rapid, One-Pot Platform for Molecular Detection”的文章。作者利用蜡的相变特性,设计了一个封闭管内的自动分步反应,称为WIAT平台。在PCR管内预先制备一个成型的蜡隔板,把RPA反应液和CRISPR-Cas12a反应液物理隔开。先在39°C完成RPA扩增,然后升温到46°C,蜡隔板熔化,两侧反应液自动混合,启动Cas12a检测。文章以HSV-2 DNA检测为模型,展示WIAT可以达到10 aM检测灵敏度,并在30份临床HSV-2拭子样本中取得与qPCR高度一致的结果。

图片来源:ACS Sensors




主要内容

WIAT平台的工作原理


WIAT

WIAT平台由一个200 μL反应管和其中的蜡隔板组成。蜡隔板把管内空间分为两个反应腔,一个是RPA扩增腔,另一个是CRISPR检测腔。RPA反应液和CRISPR-Cas12a反应液分别加入两个腔室。

首先,反应管在39°C孵育20分钟,以进行RPA扩增。由于蜡隔板熔点为44–46°C,RPA扩增液和CRISPR检测液彼此隔离。RPA扩增结束后,温度升至46°C。蜡隔板熔化,RPA产物自动与CRISPR反应液混合。若样本中存在目标DNA,RPA扩增产物会激活Cas12a,产生荧光信号。阴性样本则无明显荧光(如下图)。

WIAT平台的工作流程

图片来源:ACS Sensors


WIAT平台的制备


WIAT

作者设计了蜡隔板阴模,再用3D打印技术和Grey Pro树脂制备模具。制备蜡隔板时,作者将55–60 μL熔融石蜡加入PCR管中,把预处理过脱模剂的3D打印模具插入液态蜡中。冷却固化后取出模具,就在PCR管内形成固定形状的蜡隔板。模具脱模后可以清洗并重复使用(图A)。用红绿染料显示加热前两个腔室能够稳定分隔,加热后液体合并(图B)。与此前一些蜡基RPA-CRISPR系统相比,WIAT的预成型蜡隔板能形成明确的RPA和CRISPR腔室,不需要每次新鲜制备蜡屏障,更利于规模化和批量生产。

WIAT平台的设计、制造与优化

图片来源:ACS Sensors


WIAT平台的工程优化


WIAT

作者系统比较了三种脱模剂,矿物油、硅胶脱模**和凡士林。结果显示,矿物油和硅胶脱模剂会导至蜡隔板不完整或受损,而凡士林可以稳定获得结构完整、几何形状清晰的蜡隔板。

作者测试了不同蜡隔板壁厚,包括0.8、1.1和1.4 mm。如果蜡壁太薄,脱模过程中容易损坏,太厚会占用过多反应体积,影响腔室容量。综合结构完整性和反应空间,作者最终选择1.1 mm 作为后续实验的蜡壁厚度。作者使用熔点为44–46°C 的石蜡,并用染料测试39–46°C之间的相变行为。结果显示,46°C时所有管都出现完全、均匀混合,约1.5分钟内形成一致分布。因此,作者选择46°C 作为CRISPR反应启动温度。作者还测试了5、10和15 μL 三种RPA体积,同时保持CRISPR反应液为20 μL。结果显示,10 μL RPA体积能够产生阳性与阴性的显著分离(下图B)。

WIAT平台的工程优化

图片来源:ACS Sensors


WIAT平台的分析性能


WIAT

作者使用10倍梯度稀释的HSV-2 DNA评估检测灵敏度,浓度范围从10 aM到10 fM。结果显示,WIAT平台可以清楚地区分最低测试浓度10 aM 和阴性对照,并且差异具有统计学显著性。随着靶标浓度升高,CRISPR荧光信号也相应增强。作者还使用相同梯度样本做传统两步RPA-CRISPR,与WIAT平台进行直接比较。结果显示,两步法与WIAT灵敏度相当,同样可达到10 aM水平(如下图)。不过,两步法荧光强度更高、背景更低,这可能是因为WIAT中熔化后的蜡层对荧光有一定衰减。

除了灵敏度,作者还使用包括HSV-2、HSV-1、HPV16、HPV18、HPV31和HPV33在内的多种核酸靶标评估了WIAT平台的检测特异性,结果表明WIAT平台具有优异的特异性。总体而言,这些结果表明,单步WIAT平台可在低于10 aM的浓度下特异性地检测到HSV-2 DNA,其灵敏度与传统的两步RPA-CRISPR流程相当。

单管WIAT平台与两步RPA-CRISPR检测法的灵敏度比较

图片来源:ACS Sensors


WIAT平台的临床样本验证


WIAT

作者进一步用临床HSV-2拭子样本验证WIAT。作者先从样本中提取DNA,再分别进行qPCR和WIAT检测。共测试了30份临床拭子样本,其中1–13号为qPCR阳性,14–30号为qPCR阴性。

WIAT检测结果显示,它正确识别了13个qPCR阳性样本中的12个。唯一漏检的是Sample 10,该样本qPCR阳性但Ct值为34.4,提示病毒载量接近当前平台检测下限。在17个qPCR阴性样本中,WIAT没有产生阳性信号,显示出良好特异性。总体来看,WIAT与qPCR结果高度一致(如下图)。

WIAT平台的临床验证

图片来源:ACS Sensors




总结与讨论

作者提出的WIAT平台是一种利用蜡相变实现自动分步反应的一管式RPA-CRISPR检测平台。系统在一支200 μL反应管内用预成型蜡隔板分隔RPA扩增液和CRISPR-Cas12a检测液。RPA扩增后升温至46°C后蜡熔化,两侧液体自动混合,RPA产物激活Cas12a并产生荧光信号。WIAT用于HSV-2 DNA检测时可达到10 aM 灵敏度。灵敏度和特异性测试均良好。在30份临床HSV-2拭子样本中,WIAT检出12/13个qPCR阳性样本,阴性样本均未出现阳性信号。

不过,WIAT目前仍不是完整POCT产品。它仍需要前端核酸提取,临床样本量较小,低病毒载量样本存在漏检风险,蜡层可能影响荧光读数,多重检测和长期储存稳定性也还需要验证。未来如果能进一步整合免提取样本处理、冻干试剂、内参控制、侧向层析或便携荧光读数,并完成更大规模临床验证,WIAT有潜力成为一种非常实用的低成本封闭式RPA-CRISPR检测平台。总之,WIAT重新设计了RPA和CRISPR在管内相遇的方式,结构简单,成本低。WIAT最适合的场景,是需要低设备依赖、低污染风险、操作简单的近患者检测。


注:本文内容仅供行业动态参考,不构成任何投资建议或临床医疗决策依据。

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